More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3098 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  82.92 
 
 
927 aa  1578    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0106  helicase domain-containing protein  75.63 
 
 
443 aa  667    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  89.72 
 
 
925 aa  1687    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  100 
 
 
922 aa  1875    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0102  SNF2-related protein  89.52 
 
 
346 aa  624  1e-177  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  32.28 
 
 
877 aa  295  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0104  hypothetical protein  83.33 
 
 
297 aa  295  3e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.664447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  29.73 
 
 
801 aa  292  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  29.03 
 
 
988 aa  282  2e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  29.85 
 
 
937 aa  270  8e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  30.93 
 
 
900 aa  263  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  32.09 
 
 
1172 aa  256  9e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  30.89 
 
 
1170 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  28.25 
 
 
894 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  32.59 
 
 
962 aa  251  4e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
1129 aa  251  5e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  30.89 
 
 
1167 aa  250  7e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  32.69 
 
 
1160 aa  250  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  31.85 
 
 
1170 aa  249  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  31.48 
 
 
1170 aa  249  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  32 
 
 
941 aa  248  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  32 
 
 
941 aa  248  4e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  31.69 
 
 
1170 aa  248  4.9999999999999997e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  30.61 
 
 
1167 aa  246  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  28.88 
 
 
969 aa  246  1.9999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  32.25 
 
 
1172 aa  245  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  32.78 
 
 
1116 aa  243  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  31.61 
 
 
1167 aa  243  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  29.74 
 
 
1169 aa  242  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  32.2 
 
 
1144 aa  241  5e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  29.88 
 
 
1168 aa  240  8e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  32.2 
 
 
835 aa  240  8e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  31.37 
 
 
1145 aa  239  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  31.58 
 
 
972 aa  239  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  31.68 
 
 
964 aa  239  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  31.79 
 
 
1138 aa  238  4e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  29.98 
 
 
1169 aa  237  9e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  32 
 
 
1147 aa  232  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  28.84 
 
 
971 aa  230  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  27.45 
 
 
969 aa  220  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  28.85 
 
 
829 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  30.65 
 
 
1062 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  36.44 
 
 
805 aa  202  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  29.85 
 
 
951 aa  185  3e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  37.09 
 
 
1131 aa  185  4.0000000000000006e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  36.05 
 
 
1194 aa  182  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.31 
 
 
1212 aa  172  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  29.06 
 
 
947 aa  171  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  28.4 
 
 
955 aa  169  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  29.33 
 
 
1045 aa  168  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  31.29 
 
 
1160 aa  165  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  33.15 
 
 
966 aa  165  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0659  DEAD/DEAH box helicase family protein  30.79 
 
 
440 aa  164  6e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.348224  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  28.47 
 
 
942 aa  163  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  25.13 
 
 
1013 aa  163  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  29.11 
 
 
1046 aa  162  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  26.93 
 
 
963 aa  161  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  33.44 
 
 
1137 aa  161  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  33.82 
 
 
933 aa  160  8e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  28.95 
 
 
1031 aa  160  9e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  32.89 
 
 
1136 aa  160  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  28.48 
 
 
952 aa  160  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  26.21 
 
 
963 aa  159  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  27.98 
 
 
949 aa  157  8e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  26.37 
 
 
964 aa  157  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0958  SNF2-related protein  26.1 
 
 
975 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106346  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  29.56 
 
 
1095 aa  153  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  28.38 
 
 
961 aa  153  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  28.23 
 
 
1201 aa  152  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  28.23 
 
 
1201 aa  152  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  30.32 
 
 
1165 aa  152  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  30.4 
 
 
919 aa  152  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  30.13 
 
 
1049 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  25.11 
 
 
966 aa  145  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  28.59 
 
 
1094 aa  144  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  28.72 
 
 
953 aa  143  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  29.34 
 
 
814 aa  142  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1396  SNF2-related  33.73 
 
 
283 aa  142  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  27.6 
 
 
1058 aa  142  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  26.49 
 
 
1177 aa  139  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  33.13 
 
 
572 aa  137  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.13 
 
 
1028 aa  134  6.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  40.2 
 
 
1065 aa  131  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  40.2 
 
 
1065 aa  131  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  32.18 
 
 
584 aa  129  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  27.08 
 
 
949 aa  129  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  31.86 
 
 
584 aa  126  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  31.33 
 
 
554 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0575  ATP-dependent helicase HepA  33.33 
 
 
968 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  27.56 
 
 
940 aa  123  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3455  ATP-dependent helicase HepA  32.88 
 
 
968 aa  122  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3131  ATP-dependent helicase HepA  35 
 
 
967 aa  121  6e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  27.23 
 
 
941 aa  120  9e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0574  ATP-dependent helicase HepA  32.53 
 
 
968 aa  120  9e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3704  ATP-dependent helicase HepA  31.86 
 
 
968 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0569  ATP-dependent helicase HepA  33.22 
 
 
967 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3547  ATP-dependent helicase HepA  31.82 
 
 
968 aa  119  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3419  ATP-dependent helicase HepA  31.82 
 
 
968 aa  119  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0575  ATP-dependent helicase HepA  32.99 
 
 
968 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2948  ATP-dependent helicase HepA  31.49 
 
 
968 aa  118  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.476978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>