More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1945 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  51.26 
 
 		 947 aa  937    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  48 
 
 		 955 aa  876    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  51.66 
 
 		 932 aa  937    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3658  SNF2 family helicase  49.58 
 
 		 960 aa  888    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.041395  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  53.09 
 
 		 966 aa  1008    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  52.77 
 
 		 665 aa  693    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  50.16 
 
 		 942 aa  926    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  43.94 
 
 		 951 aa  772    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  45.32 
 
 		 963 aa  819    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  50.59 
 
 		 929 aa  914    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  45.28 
 
 		 963 aa  840    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  100 
 
 		 949 aa  1942    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  42.41 
 
 		 961 aa  714    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  52.84 
 
 		 967 aa  1004    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  48.77 
 
 		 964 aa  874    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0958  SNF2-related protein  45.97 
 
 		 975 aa  813    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.106346  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  42.84 
 
 		 961 aa  686    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  47.6 
 
 		 915 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  47.3 
 
 		 915 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  47.16 
 
 		 921 aa  568  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  47.3 
 
 		 916 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  31.66 
 
 		 584 aa  232  3e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  30.67 
 
 		 555 aa  225  3e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  30.91 
 
 		 560 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  30.91 
 
 		 560 aa  223  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  30.91 
 
 		 560 aa  223  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  30.91 
 
 		 560 aa  223  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  30.91 
 
 		 560 aa  223  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  31.18 
 
 		 584 aa  223  1.9999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  30.74 
 
 		 560 aa  222  3e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  29.78 
 
 		 560 aa  219  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0036  hypothetical protein  34.89 
 
 		 363 aa  219  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.922282  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  30.27 
 
 		 554 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  30.1 
 
 		 572 aa  212  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  29.3 
 
 		 467 aa  197  7e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  27.85 
 
 		 1138 aa  192  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  29.57 
 
 		 966 aa  191  5.999999999999999e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  29.39 
 
 		 1144 aa  191  5.999999999999999e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  29.39 
 
 		 835 aa  191  5.999999999999999e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  32.36 
 
 		 1147 aa  189  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  27.75 
 
 		 988 aa  188  3e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  30.66 
 
 		 941 aa  188  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  30.66 
 
 		 941 aa  188  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  29.14 
 
 		 1145 aa  188  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  27.79 
 
 		 969 aa  187  6e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  29.95 
 
 		 1129 aa  185  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  29.77 
 
 		 933 aa  184  6e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  29.82 
 
 		 962 aa  183  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  28.8 
 
 		 969 aa  180  1e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  28.3 
 
 		 1116 aa  179  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  27.7 
 
 		 578 aa  171  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  27.12 
 
 		 1037 aa  171  8e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  28.52 
 
 		 1062 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  29.5 
 
 		 801 aa  164  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  29.04 
 
 		 877 aa  164  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  27.88 
 
 		 972 aa  162  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  27.55 
 
 		 1046 aa  162  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  26.71 
 
 		 805 aa  160  9e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  28.04 
 
 		 925 aa  159  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  27.71 
 
 		 1160 aa  157  8e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  26.52 
 
 		 971 aa  155  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  27.1 
 
 		 922 aa  154  7e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  28.14 
 
 		 1172 aa  153  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  28.83 
 
 		 1169 aa  153  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  27.16 
 
 		 964 aa  152  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  28.22 
 
 		 1169 aa  152  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  26.08 
 
 		 1095 aa  151  5e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  26.53 
 
 		 937 aa  150  8e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  27.04 
 
 		 1057 aa  150  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  28.79 
 
 		 1168 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  28.57 
 
 		 1165 aa  149  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  26.95 
 
 		 1160 aa  149  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  28.1 
 
 		 927 aa  149  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  28.92 
 
 		 900 aa  148  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  26.5 
 
 		 1201 aa  147  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  26.5 
 
 		 1201 aa  147  8.000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  26.77 
 
 		 1044 aa  145  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  27.06 
 
 		 1170 aa  145  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  27.3 
 
 		 1170 aa  145  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  27.51 
 
 		 894 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  28.52 
 
 		 1170 aa  143  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  27.47 
 
 		 1172 aa  143  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  26.67 
 
 		 1170 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  27.54 
 
 		 952 aa  142  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  27.55 
 
 		 1194 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  25.39 
 
 		 1167 aa  141  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  25.68 
 
 		 1167 aa  141  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  26.48 
 
 		 1167 aa  141  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  27.04 
 
 		 1137 aa  138  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  25.92 
 
 		 541 aa  138  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  26.29 
 
 		 919 aa  135  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  27.06 
 
 		 1038 aa  135  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  27.16 
 
 		 1049 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  25.45 
 
 		 1069 aa  133  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  25.45 
 
 		 1069 aa  133  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  24.71 
 
 		 1028 aa  128  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  32.11 
 
 		 560 aa  128  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  26.83 
 
 		 829 aa  127  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  37.78 
 
 		 560 aa  127  9e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  37.78 
 
 		 560 aa  126  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>