More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1877 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  70.37 
 
 		 906 aa  1288    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  71.37 
 
 		 1212 aa  1768    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  63.67 
 
 		 1170 aa  1503    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  48.73 
 
 		 1167 aa  1101    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  52.07 
 
 		 1172 aa  1189    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  65.73 
 
 		 760 aa  1011    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  59.54 
 
 		 1170 aa  1452    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  48.6 
 
 		 1160 aa  1058    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  52.42 
 
 		 1168 aa  1197    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  50.89 
 
 		 829 aa  758    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  51.5 
 
 		 1194 aa  1152    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  48.18 
 
 		 1167 aa  1091    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  49.11 
 
 		 1167 aa  1107    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  65.42 
 
 		 814 aa  767    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  43.44 
 
 		 1136 aa  874    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  46.16 
 
 		 774 aa  638    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  47.96 
 
 		 1160 aa  1084    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  66.67 
 
 		 1170 aa  1638    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  60.67 
 
 		 1169 aa  1454    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1172 aa  2422    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  60.89 
 
 		 1169 aa  1446    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  43.88 
 
 		 1131 aa  797    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  49.87 
 
 		 1170 aa  1133    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  43.27 
 
 		 1137 aa  868    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0659  DEAD/DEAH box helicase family protein  69.66 
 
 		 440 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.348224  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  43.06 
 
 		 964 aa  585  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  34.58 
 
 		 1116 aa  483  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  33.94 
 
 		 1129 aa  481  1e-134  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  31.62 
 
 		 1138 aa  443  1e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  31.55 
 
 		 1144 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  31.97 
 
 		 1145 aa  436  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  33.61 
 
 		 835 aa  402  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  35.88 
 
 		 1147 aa  368  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  35.1 
 
 		 1062 aa  357  6.999999999999999e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1396  SNF2-related  63.8 
 
 		 283 aa  349  2e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  29.06 
 
 		 988 aa  332  3e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0821  putative helicase  36.69 
 
 		 565 aa  318  4e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  27.32 
 
 		 971 aa  286  2.0000000000000002e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  30.76 
 
 		 969 aa  282  3e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  26.29 
 
 		 1069 aa  263  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  26.29 
 
 		 1069 aa  263  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  30.04 
 
 		 925 aa  253  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  31.85 
 
 		 922 aa  253  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  31.24 
 
 		 941 aa  253  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  31.24 
 
 		 941 aa  253  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1632  DEAD-like helicase  48.66 
 
 		 312 aa  253  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  30.47 
 
 		 927 aa  252  3e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  31.69 
 
 		 877 aa  245  3.9999999999999997e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  29.8 
 
 		 966 aa  239  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  32.35 
 
 		 962 aa  237  8e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  33.22 
 
 		 919 aa  237  9e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  28.24 
 
 		 937 aa  237  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  30.56 
 
 		 801 aa  234  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  29.95 
 
 		 805 aa  231  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  31.05 
 
 		 933 aa  228  6e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  30.56 
 
 		 969 aa  224  9e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  32.32 
 
 		 894 aa  220  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  31.08 
 
 		 1057 aa  219  2.9999999999999998e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  29.65 
 
 		 1049 aa  214  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  31.92 
 
 		 972 aa  213  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  29.55 
 
 		 1082 aa  211  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  28.93 
 
 		 952 aa  209  3e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  27.71 
 
 		 572 aa  209  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  29.48 
 
 		 1046 aa  206  3e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  28.44 
 
 		 1031 aa  201  9e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  30.1 
 
 		 1165 aa  198  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  29.03 
 
 		 1045 aa  197  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  28.6 
 
 		 1058 aa  191  7e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  31.27 
 
 		 1028 aa  190  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  29.67 
 
 		 1201 aa  188  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  29.67 
 
 		 1201 aa  188  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  29.41 
 
 		 1095 aa  185  3e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  29.94 
 
 		 1038 aa  184  9.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.55 
 
 		 961 aa  181  8e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  25.56 
 
 		 1013 aa  181  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  29.61 
 
 		 900 aa  178  5e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  30.43 
 
 		 1177 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  28.32 
 
 		 584 aa  175  5e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  28.21 
 
 		 961 aa  174  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  27.38 
 
 		 554 aa  173  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  30.73 
 
 		 963 aa  171  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  29.8 
 
 		 955 aa  171  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  26.76 
 
 		 969 aa  171  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  29.3 
 
 		 953 aa  169  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  25.83 
 
 		 949 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  27.68 
 
 		 584 aa  166  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  27.72 
 
 		 467 aa  165  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  30.16 
 
 		 933 aa  164  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  30.04 
 
 		 948 aa  163  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0102  SNF2-related protein  30.14 
 
 		 346 aa  162  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  27.81 
 
 		 957 aa  161  8e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  28.55 
 
 		 967 aa  160  9e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  29.51 
 
 		 921 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  27.2 
 
 		 951 aa  159  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  25.79 
 
 		 945 aa  156  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  30.52 
 
 		 964 aa  156  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  27.2 
 
 		 950 aa  155  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  28.23 
 
 		 942 aa  154  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  29.61 
 
 		 915 aa  153  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  29.61 
 
 		 916 aa  153  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>