More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2766 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  48.9 
 
 
1167 aa  772    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  49.84 
 
 
1194 aa  796    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  79.91 
 
 
1212 aa  1477    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  46.76 
 
 
1170 aa  751    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  100 
 
 
906 aa  1847    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  47.79 
 
 
1167 aa  768    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  49.89 
 
 
1172 aa  835    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  63.13 
 
 
760 aa  960    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  47.8 
 
 
1167 aa  763    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  47.96 
 
 
1160 aa  740    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  61.89 
 
 
1170 aa  1120    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  51.71 
 
 
1168 aa  840    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  63.36 
 
 
1169 aa  1112    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  65.59 
 
 
1170 aa  1176    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  70.37 
 
 
1172 aa  1307    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  63.92 
 
 
1169 aa  1110    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  46.7 
 
 
1160 aa  778    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  60.88 
 
 
1170 aa  1081    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  48.43 
 
 
774 aa  634  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  42.16 
 
 
1136 aa  543  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  40.38 
 
 
1137 aa  533  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  97.11 
 
 
814 aa  520  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  39.63 
 
 
1131 aa  431  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  48.34 
 
 
829 aa  424  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  43.17 
 
 
964 aa  375  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0821  putative helicase  37.81 
 
 
565 aa  324  4e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  31.14 
 
 
1129 aa  295  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  32.44 
 
 
1116 aa  284  7.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  30.48 
 
 
1138 aa  253  1e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  29.84 
 
 
1145 aa  245  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  29.48 
 
 
1144 aa  239  1e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0659  DEAD/DEAH box helicase family protein  72.34 
 
 
440 aa  209  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.348224  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  32.2 
 
 
835 aa  209  3e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  40.05 
 
 
1062 aa  207  5e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  28.25 
 
 
971 aa  202  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  29.31 
 
 
1147 aa  199  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  32.44 
 
 
969 aa  193  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  27.01 
 
 
988 aa  186  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1396  SNF2-related  69.7 
 
 
283 aa  171  5e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  32.91 
 
 
962 aa  135  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  28.12 
 
 
877 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  27.85 
 
 
937 aa  132  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  30 
 
 
1069 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  30 
 
 
1069 aa  130  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  31.7 
 
 
972 aa  126  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  30.29 
 
 
941 aa  125  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  30.29 
 
 
941 aa  125  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  31.39 
 
 
966 aa  125  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  28.82 
 
 
801 aa  124  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  27.54 
 
 
805 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  30.32 
 
 
933 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  30.39 
 
 
894 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  30.41 
 
 
1049 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  41.72 
 
 
572 aa  120  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  28.03 
 
 
560 aa  118  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  34.06 
 
 
919 aa  117  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  29.08 
 
 
969 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  37.57 
 
 
1046 aa  116  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  30.48 
 
 
1057 aa  115  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  27.88 
 
 
925 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  27.61 
 
 
927 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  43.38 
 
 
560 aa  113  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  37.31 
 
 
554 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  42.65 
 
 
560 aa  112  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  42.65 
 
 
560 aa  112  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  42.65 
 
 
560 aa  112  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  42.65 
 
 
560 aa  112  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  42.65 
 
 
560 aa  112  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  42.65 
 
 
560 aa  112  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  42.65 
 
 
560 aa  112  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  42.65 
 
 
560 aa  112  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  42.65 
 
 
560 aa  112  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  39.75 
 
 
1037 aa  112  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  27.75 
 
 
952 aa  112  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  28.88 
 
 
1165 aa  111  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  41.36 
 
 
555 aa  111  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  38.6 
 
 
578 aa  110  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  29.19 
 
 
1082 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  27.87 
 
 
1065 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  27.87 
 
 
1065 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  30.48 
 
 
955 aa  107  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  26.65 
 
 
1046 aa  103  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  27.35 
 
 
1031 aa  103  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  40.88 
 
 
1043 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  30.58 
 
 
1187 aa  103  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  30.84 
 
 
963 aa  102  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  36.76 
 
 
1013 aa  102  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  29.63 
 
 
916 aa  101  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  29.63 
 
 
915 aa  101  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  28.14 
 
 
961 aa  101  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0219  helicase-like  27.7 
 
 
840 aa  101  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000357618  hitchhiker  0.00781123 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4785  helicase domain-containing protein  30.06 
 
 
724 aa  101  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0599344  normal  0.582969 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  29.46 
 
 
915 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  35.1 
 
 
584 aa  100  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  36.5 
 
 
1177 aa  99  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  31.01 
 
 
964 aa  99.4  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  27.49 
 
 
951 aa  99  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  27.54 
 
 
1058 aa  99  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  27.22 
 
 
1045 aa  97.8  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  35.23 
 
 
922 aa  97.8  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>