More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0219 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007412  Ava_C0219  helicase-like  100 
 
 
840 aa  1706    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000357618  hitchhiker  0.00781123 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  73.57 
 
 
1082 aa  1268    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  39.98 
 
 
1177 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  32.48 
 
 
1046 aa  348  2e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  34.24 
 
 
1031 aa  342  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  32.16 
 
 
1049 aa  335  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  32.75 
 
 
1045 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  33.41 
 
 
1165 aa  300  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  30.43 
 
 
1058 aa  289  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  32.3 
 
 
1038 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  32.39 
 
 
1057 aa  283  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  31.74 
 
 
1201 aa  280  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  31.74 
 
 
1201 aa  280  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  31.15 
 
 
1028 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  31.42 
 
 
1044 aa  268  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  30.05 
 
 
1095 aa  254  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4785  helicase domain-containing protein  27.77 
 
 
724 aa  173  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0599344  normal  0.582969 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  33.63 
 
 
919 aa  148  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  27.1 
 
 
1172 aa  147  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  28.1 
 
 
969 aa  140  7.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  28.28 
 
 
988 aa  139  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  29.5 
 
 
1160 aa  137  7.000000000000001e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  28.19 
 
 
1160 aa  134  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  28.86 
 
 
1172 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  27.67 
 
 
1169 aa  132  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  29.92 
 
 
1170 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  31.73 
 
 
1168 aa  128  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  28.83 
 
 
1167 aa  128  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  25.93 
 
 
1169 aa  127  6e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  26.87 
 
 
952 aa  127  8.000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  27.15 
 
 
945 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  28.95 
 
 
1194 aa  127  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  27.45 
 
 
801 aa  126  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  26.91 
 
 
805 aa  126  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  30.77 
 
 
1170 aa  126  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  28.34 
 
 
1170 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  27.79 
 
 
968 aa  126  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  27.48 
 
 
971 aa  126  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  27.06 
 
 
1170 aa  125  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  28.1 
 
 
1167 aa  123  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  29.64 
 
 
964 aa  122  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  27.08 
 
 
1212 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  27.98 
 
 
954 aa  121  4.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  27.29 
 
 
952 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  27.29 
 
 
952 aa  120  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  28.43 
 
 
1167 aa  120  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  26.85 
 
 
952 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4894  helicase family protein  27.29 
 
 
952 aa  119  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  29.28 
 
 
1129 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  26.8 
 
 
1147 aa  116  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  30.54 
 
 
829 aa  114  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  26.57 
 
 
1136 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  28.67 
 
 
1137 aa  114  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  27.05 
 
 
941 aa  112  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  25.81 
 
 
877 aa  110  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  27.91 
 
 
1145 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  26.67 
 
 
958 aa  109  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  30.1 
 
 
1131 aa  109  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  26.7 
 
 
1013 aa  108  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  26.87 
 
 
969 aa  108  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  27.81 
 
 
900 aa  107  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  28.97 
 
 
1062 aa  107  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  26.17 
 
 
933 aa  107  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  26.91 
 
 
953 aa  106  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  27.55 
 
 
966 aa  105  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  26.47 
 
 
962 aa  104  9e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  27.59 
 
 
950 aa  103  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  25.74 
 
 
1144 aa  103  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  24.43 
 
 
937 aa  103  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  26.87 
 
 
946 aa  103  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  24.9 
 
 
1138 aa  103  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  25.74 
 
 
835 aa  103  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  29.03 
 
 
906 aa  103  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  27.05 
 
 
941 aa  102  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  27.05 
 
 
941 aa  102  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  25.96 
 
 
949 aa  100  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  28.13 
 
 
1094 aa  100  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  27.42 
 
 
1116 aa  100  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4771  helicase domain-containing protein  27 
 
 
953 aa  100  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.360251 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  25.78 
 
 
932 aa  99  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  24.83 
 
 
958 aa  99  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  28.34 
 
 
957 aa  97.8  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  25.75 
 
 
966 aa  97.4  8e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  25.65 
 
 
961 aa  97.4  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  27.21 
 
 
972 aa  97.4  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3743  helicase domain protein  26.41 
 
 
973 aa  97.1  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  29.36 
 
 
933 aa  97.1  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  25.74 
 
 
1069 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  25.74 
 
 
1069 aa  95.9  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  25.93 
 
 
961 aa  95.9  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  35.95 
 
 
969 aa  95.5  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  26.26 
 
 
923 aa  95.1  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  34.5 
 
 
554 aa  94.4  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0352  helicase domain protein  39.75 
 
 
937 aa  94.4  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  36.48 
 
 
1065 aa  93.6  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  36.48 
 
 
1065 aa  93.6  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  26.23 
 
 
929 aa  93.2  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  25.91 
 
 
894 aa  92  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  31.14 
 
 
760 aa  91.7  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3088  helicase domain-containing protein  26.72 
 
 
956 aa  91.3  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.01898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>