More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2718 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  51.83 
 
 
1167 aa  1152    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  67.25 
 
 
1212 aa  1634    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  51.78 
 
 
1160 aa  1128    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  53.67 
 
 
1194 aa  1201    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  61.69 
 
 
814 aa  716    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  53.36 
 
 
1172 aa  1219    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  70.39 
 
 
760 aa  1089    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0659  DEAD/DEAH box helicase family protein  78.13 
 
 
440 aa  719    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.348224  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  51.15 
 
 
1167 aa  1130    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  46.11 
 
 
1136 aa  910    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  53.58 
 
 
1168 aa  1199    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  54.15 
 
 
829 aa  816    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  52.07 
 
 
1170 aa  1160    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  51.7 
 
 
1167 aa  1136    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  65.59 
 
 
906 aa  1160    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  50.08 
 
 
1160 aa  1142    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  45.79 
 
 
1137 aa  907    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  63.66 
 
 
1170 aa  1508    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  60.17 
 
 
1169 aa  1414    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  49.07 
 
 
774 aa  646    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  100 
 
 
1170 aa  2403    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  66.67 
 
 
1172 aa  1638    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  60.6 
 
 
1169 aa  1417    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  59.13 
 
 
1170 aa  1387    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  43.46 
 
 
964 aa  600  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  34.22 
 
 
1129 aa  472  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  34.28 
 
 
1116 aa  469  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  32.71 
 
 
1145 aa  462  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  32.4 
 
 
1138 aa  459  1e-127  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  32.4 
 
 
1144 aa  459  1e-127  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  40.56 
 
 
1131 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  34.77 
 
 
835 aa  413  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  32.45 
 
 
1147 aa  392  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1396  SNF2-related  65.23 
 
 
283 aa  352  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0821  putative helicase  39.25 
 
 
565 aa  352  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  38.03 
 
 
1062 aa  348  4e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  30.81 
 
 
988 aa  307  1.0000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  33.1 
 
 
969 aa  298  5e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  32.23 
 
 
971 aa  293  1e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1632  DEAD-like helicase  48.46 
 
 
312 aa  263  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  33.17 
 
 
941 aa  253  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  33.17 
 
 
941 aa  253  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  31.47 
 
 
877 aa  250  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  31.01 
 
 
925 aa  250  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  30.69 
 
 
927 aa  245  3.9999999999999997e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  31.76 
 
 
922 aa  245  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  26.24 
 
 
1069 aa  242  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  26.24 
 
 
1069 aa  242  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  31.76 
 
 
933 aa  238  6e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  32.4 
 
 
962 aa  235  4.0000000000000004e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  30.28 
 
 
801 aa  233  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  30.29 
 
 
805 aa  230  1e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  28.12 
 
 
969 aa  229  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  33.45 
 
 
919 aa  226  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  28.37 
 
 
952 aa  226  3e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  31.25 
 
 
1049 aa  222  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  31.27 
 
 
966 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  33.83 
 
 
972 aa  219  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  29.08 
 
 
937 aa  219  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  31.38 
 
 
1046 aa  216  9.999999999999999e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  31.99 
 
 
1045 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  31.41 
 
 
1031 aa  214  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  32.01 
 
 
1057 aa  211  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  31.37 
 
 
894 aa  202  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  28.07 
 
 
572 aa  201  7e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  30.86 
 
 
1058 aa  199  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  27.74 
 
 
1082 aa  199  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  31.34 
 
 
1165 aa  197  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  30.88 
 
 
1038 aa  187  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  30.11 
 
 
1177 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  28.47 
 
 
900 aa  183  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  31.2 
 
 
1044 aa  179  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  27.41 
 
 
948 aa  179  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  27.67 
 
 
555 aa  177  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  26.83 
 
 
949 aa  175  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  29.25 
 
 
1201 aa  174  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  29.25 
 
 
1201 aa  174  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  29.77 
 
 
1095 aa  173  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  30.38 
 
 
963 aa  173  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  29.59 
 
 
967 aa  173  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  27.38 
 
 
945 aa  172  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.87 
 
 
1028 aa  172  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  27.7 
 
 
1013 aa  171  5e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  31.19 
 
 
933 aa  170  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.57 
 
 
961 aa  170  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  29.5 
 
 
963 aa  168  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  29.07 
 
 
953 aa  168  5.9999999999999996e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  27.39 
 
 
941 aa  167  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  26.55 
 
 
940 aa  167  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  27.82 
 
 
951 aa  165  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  27.37 
 
 
584 aa  165  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  26.74 
 
 
950 aa  164  8.000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  28.97 
 
 
961 aa  162  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  27.69 
 
 
554 aa  160  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  24.43 
 
 
1037 aa  159  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  29.23 
 
 
955 aa  157  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0102  SNF2-related protein  35.6 
 
 
346 aa  157  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  28.26 
 
 
942 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  28.08 
 
 
932 aa  156  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  27.51 
 
 
1094 aa  155  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>