More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0659 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0659  DEAD/DEAH box helicase family protein  100 
 
 		 440 aa  905    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.348224  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  78.13 
 
 		 1170 aa  719    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  73.35 
 
 		 1212 aa  626  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  69.66 
 
 		 1172 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  71.29 
 
 		 1170 aa  594  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  62.19 
 
 		 814 aa  572  1.0000000000000001e-162  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  63.33 
 
 		 1169 aa  557  1e-157  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  62.64 
 
 		 1169 aa  552  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  61.26 
 
 		 1167 aa  521  1e-147  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  61.02 
 
 		 1167 aa  521  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  58.73 
 
 		 1172 aa  518  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  61.2 
 
 		 1170 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  59.67 
 
 		 1167 aa  518  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  62.38 
 
 		 1170 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  62.5 
 
 		 1168 aa  510  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  58.49 
 
 		 1194 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  55.38 
 
 		 1160 aa  480  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  58.21 
 
 		 1136 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  58.57 
 
 		 1160 aa  464  1e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  57.46 
 
 		 1137 aa  462  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  58.46 
 
 		 829 aa  461  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  54.73 
 
 		 1131 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1396  SNF2-related  64.39 
 
 		 283 aa  347  3e-94  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  44.42 
 
 		 964 aa  326  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  41.94 
 
 		 1129 aa  264  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  44.08 
 
 		 1116 aa  256  4e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1632  DEAD-like helicase  46.92 
 
 		 312 aa  251  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  38.86 
 
 		 1145 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  37.75 
 
 		 835 aa  243  5e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  35.35 
 
 		 1138 aa  243  7e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  37.8 
 
 		 1144 aa  240  2.9999999999999997e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  37.56 
 
 		 1147 aa  228  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  43.08 
 
 		 1062 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  72.34 
 
 		 906 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  33.33 
 
 		 988 aa  180  4.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  31.53 
 
 		 925 aa  166  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  29.73 
 
 		 927 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  30.79 
 
 		 922 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  31.01 
 
 		 933 aa  164  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  34.22 
 
 		 941 aa  164  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  34.22 
 
 		 941 aa  164  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  34.65 
 
 		 962 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  32.03 
 
 		 801 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  32.35 
 
 		 805 aa  150  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  31.64 
 
 		 969 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  31.81 
 
 		 966 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  32.27 
 
 		 877 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  32.1 
 
 		 971 aa  147  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  30.75 
 
 		 1049 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0102  SNF2-related protein  32.94 
 
 		 346 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.707301 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  32.41 
 
 		 969 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  32.96 
 
 		 919 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  28.93 
 
 		 952 aa  138  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  29.5 
 
 		 937 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  33.01 
 
 		 894 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  30.9 
 
 		 1045 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  31.76 
 
 		 1069 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  32.45 
 
 		 1058 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  31.76 
 
 		 1069 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  30.28 
 
 		 1046 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  30.88 
 
 		 1031 aa  132  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  31.96 
 
 		 1057 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  32.93 
 
 		 972 aa  130  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  31.01 
 
 		 900 aa  129  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  31.92 
 
 		 1165 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  30.65 
 
 		 1038 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  29.17 
 
 		 941 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  30.19 
 
 		 953 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3830  ATP-dependent helicase HepA  31.29 
 
 		 943 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  29.25 
 
 		 1094 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3547  ATP-dependent helicase HepA  37.23 
 
 		 968 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3419  ATP-dependent helicase HepA  37.23 
 
 		 968 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  31.34 
 
 		 1082 aa  119  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2948  ATP-dependent helicase HepA  36.7 
 
 		 968 aa  119  9e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.476978 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2088  ATP-dependent helicase HepA  37.31 
 
 		 969 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000725404  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0352  ATP-dependent helicase HepA  35.32 
 
 		 969 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  28.88 
 
 		 572 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  31.06 
 
 		 948 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  29.07 
 
 		 560 aa  117  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  30.32 
 
 		 940 aa  117  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4519  ATP-dependent helicase HepA  34.32 
 
 		 975 aa  116  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  29.31 
 
 		 560 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  29.31 
 
 		 578 aa  116  6.9999999999999995e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  30.29 
 
 		 933 aa  116  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03676  ATP-dependent helicase HepA  37.31 
 
 		 969 aa  116  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002392  RNA polymerase associated protein RapA  37.25 
 
 		 969 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000609656  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  32.1 
 
 		 1044 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  29.31 
 
 		 560 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  29.17 
 
 		 952 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  29.31 
 
 		 560 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  28.86 
 
 		 945 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0608  ATP-dependent helicase HepA  31.53 
 
 		 967 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.171676  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  29.17 
 
 		 952 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  29.17 
 
 		 952 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  29.31 
 
 		 560 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0730  ATP-dependent helicase HepA  35.64 
 
 		 968 aa  114  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000570719  normal  0.719856 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  27.65 
 
 		 954 aa  113  6e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  28.7 
 
 		 560 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  28.7 
 
 		 560 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  28.7 
 
 		 560 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>