More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4828 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4894  helicase family protein  94.33 
 
 		 952 aa  1845    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  99.58 
 
 		 952 aa  1962    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  49.58 
 
 		 945 aa  873    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  100 
 
 		 952 aa  1969    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  100 
 
 		 952 aa  1969    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  54.6 
 
 		 954 aa  986    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  34.3 
 
 		 960 aa  523  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.608461 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0352  helicase domain protein  36.17 
 
 		 937 aa  521  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1314  helicase domain-containing protein  36.52 
 
 		 982 aa  492  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3743  helicase domain protein  36.26 
 
 		 973 aa  474  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3088  helicase domain-containing protein  34.36 
 
 		 956 aa  436  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5420  helicase domain-containing protein  38.5 
 
 		 1046 aa  399  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  30.45 
 
 		 1201 aa  226  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  30.45 
 
 		 1201 aa  226  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  31.89 
 
 		 919 aa  214  7e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  27.59 
 
 		 1095 aa  197  6e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  29.67 
 
 		 952 aa  194  7e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  29.01 
 
 		 988 aa  189  2e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  29.44 
 
 		 971 aa  189  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  27.77 
 
 		 1028 aa  188  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  27.47 
 
 		 949 aa  187  9e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  28.9 
 
 		 969 aa  186  2.0000000000000003e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  30.58 
 
 		 1058 aa  182  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  27.76 
 
 		 1082 aa  182  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  27 
 
 		 1057 aa  182  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  26.35 
 
 		 1038 aa  181  7e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  28.04 
 
 		 1177 aa  180  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  28.41 
 
 		 1049 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  26.81 
 
 		 1031 aa  172  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  30.04 
 
 		 941 aa  172  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  30.04 
 
 		 941 aa  172  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  28.07 
 
 		 1046 aa  168  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  32.27 
 
 		 1094 aa  167  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  28.35 
 
 		 1045 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  28.25 
 
 		 950 aa  165  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  27.98 
 
 		 1129 aa  161  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  26.87 
 
 		 1044 aa  160  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  26.9 
 
 		 968 aa  160  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  25.27 
 
 		 958 aa  158  4e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  28.11 
 
 		 1160 aa  157  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  27.92 
 
 		 923 aa  155  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  26.48 
 
 		 953 aa  155  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  27.64 
 
 		 1170 aa  152  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  26.69 
 
 		 958 aa  152  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0273  helicase domain-containing protein  28.57 
 
 		 919 aa  151  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  28.05 
 
 		 1167 aa  150  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  28.26 
 
 		 962 aa  150  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  28.11 
 
 		 1167 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  27.59 
 
 		 1167 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  25.38 
 
 		 1170 aa  149  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  27.8 
 
 		 801 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  28.1 
 
 		 969 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  26.11 
 
 		 572 aa  147  9e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  28.3 
 
 		 933 aa  146  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  27.18 
 
 		 966 aa  147  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0353  helicase-like  26.86 
 
 		 933 aa  146  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  24.91 
 
 		 957 aa  145  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  26.97 
 
 		 805 aa  144  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  27.33 
 
 		 877 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  27.94 
 
 		 1172 aa  143  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  25.28 
 
 		 941 aa  142  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  26.44 
 
 		 1172 aa  142  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  26.57 
 
 		 1169 aa  140  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  24.83 
 
 		 972 aa  139  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  26.79 
 
 		 560 aa  138  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  26.2 
 
 		 1169 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  25.23 
 
 		 1160 aa  135  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  25.18 
 
 		 560 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  25.76 
 
 		 560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  26.57 
 
 		 560 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  25.18 
 
 		 560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  25.18 
 
 		 560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  25.18 
 
 		 560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  25.18 
 
 		 560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  27.02 
 
 		 937 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  24.56 
 
 		 951 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  25.72 
 
 		 560 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  25.49 
 
 		 560 aa  132  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  25.18 
 
 		 560 aa  132  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  29.09 
 
 		 894 aa  129  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4771  helicase domain-containing protein  25.4 
 
 		 953 aa  128  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.360251 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  25.71 
 
 		 1136 aa  127  9e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  24.36 
 
 		 578 aa  127  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  26.03 
 
 		 829 aa  127  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  26.51 
 
 		 1116 aa  126  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3508  ATP-dependent helicase HepA  27.72 
 
 		 968 aa  126  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  24.19 
 
 		 964 aa  125  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  27.16 
 
 		 1137 aa  125  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  26.45 
 
 		 900 aa  125  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  25.83 
 
 		 1170 aa  124  9e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  24.46 
 
 		 949 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  27.1 
 
 		 1013 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  25.04 
 
 		 963 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  30.74 
 
 		 1165 aa  122  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  25.41 
 
 		 1138 aa  122  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03676  ATP-dependent helicase HepA  24.31 
 
 		 969 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  24.22 
 
 		 1170 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  24.31 
 
 		 1168 aa  119  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  24.87 
 
 		 1145 aa  119  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002392  RNA polymerase associated protein RapA  25.49 
 
 		 969 aa  119  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000609656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>