More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5420 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0352  helicase domain protein  42.6 
 
 
937 aa  707    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  48.73 
 
 
960 aa  684    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.608461 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3743  helicase domain protein  48.5 
 
 
973 aa  863    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5420  helicase domain-containing protein  100 
 
 
1046 aa  2058    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3088  helicase domain-containing protein  48.99 
 
 
956 aa  843    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.01898 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  38.36 
 
 
945 aa  456  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  40.35 
 
 
954 aa  426  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  35.55 
 
 
952 aa  403  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  35.42 
 
 
952 aa  398  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  35.42 
 
 
952 aa  398  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4894  helicase family protein  38.06 
 
 
952 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1314  helicase domain-containing protein  39.12 
 
 
982 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  28.17 
 
 
1057 aa  192  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  31.36 
 
 
1201 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  31.36 
 
 
1201 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  29.29 
 
 
1038 aa  182  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  33.72 
 
 
919 aa  179  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  30.46 
 
 
969 aa  178  5e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  30.27 
 
 
1045 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  28.91 
 
 
1095 aa  176  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  30.49 
 
 
1031 aa  175  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  30.46 
 
 
1049 aa  175  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  29.09 
 
 
1046 aa  173  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  28.84 
 
 
971 aa  166  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  30.05 
 
 
953 aa  160  9e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  30.15 
 
 
1082 aa  159  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.2 
 
 
1028 aa  159  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  29.38 
 
 
1177 aa  159  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  27.23 
 
 
952 aa  157  1e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  30.92 
 
 
941 aa  155  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  30.92 
 
 
941 aa  155  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  29.46 
 
 
584 aa  152  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  28.93 
 
 
578 aa  151  8e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  28.92 
 
 
584 aa  150  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  27.44 
 
 
1013 aa  150  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  28.18 
 
 
933 aa  149  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  28.67 
 
 
1167 aa  149  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  27.36 
 
 
972 aa  147  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  29.87 
 
 
923 aa  147  1e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  27.07 
 
 
988 aa  146  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  28.57 
 
 
1167 aa  146  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  27.76 
 
 
805 aa  145  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  28.47 
 
 
968 aa  145  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  27.6 
 
 
958 aa  144  6e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  31.12 
 
 
1094 aa  142  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  29.05 
 
 
1167 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  26.52 
 
 
877 aa  141  7e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  27.61 
 
 
801 aa  141  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  29.89 
 
 
1160 aa  140  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  27.44 
 
 
900 aa  139  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4771  helicase domain-containing protein  26.5 
 
 
953 aa  139  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.360251 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  28.03 
 
 
949 aa  140  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  29.27 
 
 
950 aa  139  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  29.34 
 
 
1170 aa  137  7.000000000000001e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  27.08 
 
 
958 aa  137  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  26.64 
 
 
957 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  27.38 
 
 
1160 aa  134  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  27.82 
 
 
1170 aa  134  9e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  28.21 
 
 
946 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  27.29 
 
 
1129 aa  132  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  24.28 
 
 
560 aa  132  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  23.95 
 
 
560 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  27.86 
 
 
966 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  24.04 
 
 
560 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  26.61 
 
 
941 aa  130  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  25.97 
 
 
560 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0273  helicase domain-containing protein  28.16 
 
 
919 aa  129  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  23.89 
 
 
560 aa  127  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  23.75 
 
 
560 aa  127  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  23.75 
 
 
560 aa  127  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  23.75 
 
 
560 aa  127  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  26.41 
 
 
669 aa  127  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  23.75 
 
 
560 aa  127  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  23.75 
 
 
560 aa  127  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  28.48 
 
 
572 aa  127  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  24.35 
 
 
560 aa  126  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  27.79 
 
 
894 aa  125  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  27.73 
 
 
1069 aa  124  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  26.36 
 
 
937 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  27.73 
 
 
1069 aa  124  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00061  ATP-dependent helicase HepA  27.97 
 
 
968 aa  122  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283033  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3540  SNF2-related protein  27.97 
 
 
968 aa  122  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410418  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0061  ATP-dependent helicase HepA  27.97 
 
 
968 aa  122  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00130615  normal  0.800173 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0061  ATP-dependent helicase HepA  27.97 
 
 
968 aa  122  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000176621  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0051  ATP-dependent helicase HepA  27.97 
 
 
968 aa  122  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000808065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3598  ATP-dependent helicase HepA  27.97 
 
 
968 aa  122  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.517032  unclonable  0.0000000467864 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0063  ATP-dependent helicase HepA  27.97 
 
 
968 aa  122  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000144173  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00060  hypothetical protein  27.97 
 
 
968 aa  122  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.326785  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0569  ATP-dependent helicase HepA  27.67 
 
 
967 aa  122  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0064  ATP-dependent helicase HepA  27.97 
 
 
919 aa  122  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.694047  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3547  ATP-dependent helicase HepA  28.7 
 
 
968 aa  121  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3419  ATP-dependent helicase HepA  28.7 
 
 
968 aa  121  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2088  ATP-dependent helicase HepA  28.89 
 
 
969 aa  121  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000725404  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  25.89 
 
 
1138 aa  121  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0730  ATP-dependent helicase HepA  29.16 
 
 
968 aa  120  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000570719  normal  0.719856 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2948  ATP-dependent helicase HepA  28.51 
 
 
968 aa  120  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.476978 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  24.28 
 
 
555 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0352  ATP-dependent helicase HepA  27.49 
 
 
969 aa  119  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  24.86 
 
 
554 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0353  helicase-like  27.45 
 
 
933 aa  117  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>