252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4787 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008697  Noca_4787  DEAD-like helicases-like protein  100 
 
 
338 aa  686    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111321  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  76.45 
 
 
1095 aa  499  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  74.57 
 
 
1028 aa  454  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  64.74 
 
 
1201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  64.74 
 
 
1201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  50.91 
 
 
1165 aa  303  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  53.44 
 
 
1044 aa  300  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  51.94 
 
 
1038 aa  297  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  51.59 
 
 
1058 aa  296  3e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  53.27 
 
 
1057 aa  288  6e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  49.68 
 
 
1046 aa  288  8e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  51.78 
 
 
1031 aa  286  4e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  47.74 
 
 
1049 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  49.84 
 
 
1045 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  42.43 
 
 
1082 aa  228  9e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  40.85 
 
 
1177 aa  206  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  36.19 
 
 
1094 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  37.17 
 
 
919 aa  106  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  31.88 
 
 
933 aa  96.7  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  30.26 
 
 
948 aa  96.3  7e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4771  helicase domain-containing protein  31.72 
 
 
953 aa  95.9  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.360251 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  31.56 
 
 
968 aa  95.9  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  32.79 
 
 
986 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  33.5 
 
 
949 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0725  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  32.74 
 
 
949 aa  93.2  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  35.33 
 
 
957 aa  92.8  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  30.77 
 
 
945 aa  92.4  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  34.08 
 
 
941 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  33.55 
 
 
952 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4894  helicase family protein  33.55 
 
 
952 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  31.8 
 
 
946 aa  90.9  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  33.55 
 
 
952 aa  90.9  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  33.55 
 
 
952 aa  90.5  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  32.92 
 
 
945 aa  90.1  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  33.17 
 
 
988 aa  89.7  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  36.91 
 
 
578 aa  89  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  29.22 
 
 
1138 aa  88.6  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  30 
 
 
1144 aa  88.6  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0353  helicase-like  27.91 
 
 
933 aa  88.2  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  30 
 
 
835 aa  88.6  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  31.33 
 
 
940 aa  88.2  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  32.49 
 
 
1145 aa  87.4  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  34.36 
 
 
969 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  32.86 
 
 
941 aa  87.8  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  32.86 
 
 
941 aa  87.8  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  28.43 
 
 
923 aa  87.4  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0469  ATP-dependent helicase HepA  38.98 
 
 
980 aa  85.9  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30280  ATP-dependent helicase HepA  35.9 
 
 
949 aa  85.9  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.561885  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  29.36 
 
 
958 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  36.88 
 
 
971 aa  85.5  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0273  helicase domain-containing protein  34.16 
 
 
919 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  28.9 
 
 
958 aa  84  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  30.65 
 
 
954 aa  83.6  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  32.82 
 
 
1170 aa  84  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3820  ATP-dependent helicase HepA  40.43 
 
 
967 aa  83.6  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3629  ATP-dependent helicase HepA  40.43 
 
 
967 aa  83.6  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  37.78 
 
 
669 aa  83.6  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  38.01 
 
 
1194 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1485  ATP-dependent helicase HepA  36.9 
 
 
947 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.810829  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  36.99 
 
 
1062 aa  82.8  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  30.16 
 
 
952 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  35.07 
 
 
972 aa  81.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1516  ATP-dependent helicase HepA  35.66 
 
 
966 aa  81.3  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1314  helicase domain-containing protein  26.25 
 
 
982 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  34.38 
 
 
1037 aa  81.3  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4104  ATP-dependent helicase hepA , putative  33.69 
 
 
948 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1812  ATP-dependent helicase HepA  35.29 
 
 
948 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.502146  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  32.75 
 
 
1167 aa  80.5  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3842  ATP-dependent helicase HepA  33.69 
 
 
948 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2088  ATP-dependent helicase HepA  39.01 
 
 
969 aa  79.7  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000725404  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0730  ATP-dependent helicase HepA  36.21 
 
 
968 aa  79.7  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000570719  normal  0.719856 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21230  ATP-dependent helicase HepA  34.76 
 
 
950 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  38.37 
 
 
1170 aa  79.7  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  38.61 
 
 
814 aa  79.7  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  33.92 
 
 
1172 aa  79.3  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4519  ATP-dependent helicase HepA  35.97 
 
 
975 aa  78.6  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  33.17 
 
 
969 aa  79  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  33.89 
 
 
962 aa  79  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1255  ATP-dependent helicase HepA  33.69 
 
 
948 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2286  ATP-dependent helicase HepA  38.69 
 
 
1028 aa  79  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.642335  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1986  ATP-dependent helicase HepA  37.96 
 
 
982 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.819734 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
933 aa  78.6  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  30.73 
 
 
1172 aa  78.2  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
1169 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  35.15 
 
 
1046 aa  78.2  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0832  DEAD-like helicases-like  29.63 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.76445 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  33.53 
 
 
1170 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0606  ATP-dependent helicase HepA  33.01 
 
 
968 aa  77.8  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00996895  normal  0.766513 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1145  ATP-dependent helicase HepA  32.97 
 
 
948 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.286627 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.67 
 
 
1212 aa  77.8  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3419  ATP-dependent helicase HepA  36.93 
 
 
968 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  32.16 
 
 
1167 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3547  ATP-dependent helicase HepA  36.93 
 
 
968 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  32 
 
 
584 aa  77.8  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1162  ATP-dependent helicase HepA  32.43 
 
 
948 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504978  normal  0.026685 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  35.2 
 
 
1136 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2948  ATP-dependent helicase HepA  36.93 
 
 
968 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.476978 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  30.9 
 
 
964 aa  77  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03676  ATP-dependent helicase HepA  36.24 
 
 
969 aa  77  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  33.33 
 
 
584 aa  77  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>