More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3916 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03676  ATP-dependent helicase HepA  59.88 
 
 
969 aa  1220    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00061  ATP-dependent helicase HepA  58.14 
 
 
968 aa  1192    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283033  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3540  SNF2-related protein  58.14 
 
 
968 aa  1192    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410418  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0064  ATP-dependent helicase HepA  57.33 
 
 
919 aa  1112    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.694047  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1145  ATP-dependent helicase HepA  49.84 
 
 
948 aa  919    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.286627 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2531  ATP-dependent helicase HepA  47.51 
 
 
949 aa  827    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0608  ATP-dependent helicase HepA  57.17 
 
 
967 aa  1166    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.171676  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1162  ATP-dependent helicase HepA  49.95 
 
 
948 aa  922    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.504978  normal  0.026685 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4519  ATP-dependent helicase HepA  52.2 
 
 
975 aa  1019    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0535  ATP-dependent helicase HepA  99.69 
 
 
968 aa  1982    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0575  ATP-dependent helicase HepA  93.49 
 
 
968 aa  1873    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3598  ATP-dependent helicase HepA  58.14 
 
 
968 aa  1192    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.517032  unclonable  0.0000000467864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4104  ATP-dependent helicase hepA , putative  50.47 
 
 
948 aa  926    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3704  ATP-dependent helicase HepA  81.7 
 
 
968 aa  1647    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2247  ATP-dependent helicase HepA  42.89 
 
 
958 aa  806    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2218  ATP-dependent helicase HepA  42.89 
 
 
958 aa  802    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1485  ATP-dependent helicase HepA  50 
 
 
947 aa  913    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.810829  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3842  ATP-dependent helicase HepA  50.47 
 
 
948 aa  927    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1986  ATP-dependent helicase HepA  42.55 
 
 
982 aa  723    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.819734 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0051  ATP-dependent helicase HepA  58.14 
 
 
968 aa  1192    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000808065  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30280  ATP-dependent helicase HepA  50.36 
 
 
949 aa  920    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.561885  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3419  ATP-dependent helicase HepA  56.29 
 
 
968 aa  1155    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2948  ATP-dependent helicase HepA  56.19 
 
 
968 aa  1155    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.476978 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002392  RNA polymerase associated protein RapA  59.86 
 
 
969 aa  1241    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000609656  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1255  ATP-dependent helicase HepA  50.93 
 
 
948 aa  930    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4272  ATP-dependent helicase HepA  49.95 
 
 
948 aa  920    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1179  ATP-dependent helicase HepA  50.05 
 
 
948 aa  923    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.572965 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0102  ATP-dependent helicase HepA  57.73 
 
 
968 aa  1186    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0648061  normal  0.111163 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0730  ATP-dependent helicase HepA  56.91 
 
 
968 aa  1166    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000570719  normal  0.719856 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4324  ATP-dependent helicase HepA  80.66 
 
 
968 aa  1640    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0536  ATP-dependent helicase HepA  85.85 
 
 
968 aa  1738    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00420482  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0469  ATP-dependent helicase HepA  43.84 
 
 
980 aa  743    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2286  ATP-dependent helicase HepA  42.35 
 
 
1028 aa  718    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.642335  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0112  ATP-dependent helicase HepA  42.17 
 
 
960 aa  672    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000140392  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0063  ATP-dependent helicase HepA  58.04 
 
 
968 aa  1190    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000144173  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0061  ATP-dependent helicase HepA  58.04 
 
 
968 aa  1193    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00130615  normal  0.800173 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3790  ATP-dependent helicase HepA  99.69 
 
 
968 aa  1984    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3830  ATP-dependent helicase HepA  48.13 
 
 
943 aa  907    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1516  ATP-dependent helicase HepA  50.15 
 
 
966 aa  956    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0108  ATP-dependent helicase HepA  57.84 
 
 
968 aa  1188    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0575  ATP-dependent helicase HepA  93.8 
 
 
968 aa  1880    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3455  ATP-dependent helicase HepA  93.7 
 
 
968 aa  1877    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0061  ATP-dependent helicase HepA  58.14 
 
 
968 aa  1192    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000176621  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3508  ATP-dependent helicase HepA  86.36 
 
 
968 aa  1749    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3733  ATP-dependent helicase HepA  100 
 
 
968 aa  1990    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21230  ATP-dependent helicase HepA  51.09 
 
 
950 aa  930    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0101  ATP-dependent helicase HepA  57.84 
 
 
968 aa  1188    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03699  ATP-dependent helicase HepA  46.4 
 
 
947 aa  847    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0574  ATP-dependent helicase HepA  93.9 
 
 
968 aa  1879    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0106  ATP-dependent helicase HepA  57.84 
 
 
968 aa  1188    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00405197  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3820  ATP-dependent helicase HepA  56.86 
 
 
967 aa  1165    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3916  ATP-dependent helicase HepA  100 
 
 
968 aa  1990    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0625  ATP-dependent helicase HepA  83.04 
 
 
968 aa  1688    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0457  ATP-dependent helicase HepA  83.35 
 
 
968 aa  1697    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.65643 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0606  ATP-dependent helicase HepA  57.53 
 
 
968 aa  1189    Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00996895  normal  0.766513 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00060  hypothetical protein  58.14 
 
 
968 aa  1192    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.326785  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0569  ATP-dependent helicase HepA  58.1 
 
 
967 aa  1176    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3131  ATP-dependent helicase HepA  78.8 
 
 
967 aa  1581    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1812  ATP-dependent helicase HepA  51.5 
 
 
948 aa  930    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.502146  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3629  ATP-dependent helicase HepA  56.97 
 
 
967 aa  1165    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0568  ATP-dependent helicase HepA  57.01 
 
 
970 aa  1158    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00434325  normal  0.886581 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0352  ATP-dependent helicase HepA  60.27 
 
 
969 aa  1249    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3302  ATP-dependent helicase HepA  95.25 
 
 
968 aa  1912    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0103  ATP-dependent helicase HepA  56.98 
 
 
944 aa  1141    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3615  ATP-dependent helicase HepA  43.23 
 
 
953 aa  755    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2088  ATP-dependent helicase HepA  59.03 
 
 
969 aa  1212    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000725404  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3547  ATP-dependent helicase HepA  56.29 
 
 
968 aa  1155    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.212031  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4527  helicase domain-containing protein  40.1 
 
 
982 aa  685    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5609  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2892  ATP-dependent helicase HepA  37.6 
 
 
942 aa  597  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1680  ATP-dependent helicase HepA  35.19 
 
 
874 aa  542  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0454688  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0567  RNA polymerase associated protein rapA  28.27 
 
 
898 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0602  SNF2-related protein  27.87 
 
 
892 aa  196  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0594  helicase domain protein  27.75 
 
 
898 aa  194  9e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0610  type III restriction protein res subunit  30.45 
 
 
905 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  29.35 
 
 
941 aa  164  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  29.35 
 
 
941 aa  164  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  27.45 
 
 
560 aa  161  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  26.72 
 
 
560 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  26.53 
 
 
560 aa  154  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  26.53 
 
 
560 aa  154  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  26.72 
 
 
560 aa  153  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  26.72 
 
 
560 aa  153  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  26.72 
 
 
560 aa  153  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  26.72 
 
 
560 aa  153  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  26.72 
 
 
560 aa  153  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  26.2 
 
 
560 aa  151  6e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  26.2 
 
 
560 aa  151  7e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  26.93 
 
 
554 aa  150  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  26.25 
 
 
555 aa  149  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  26.45 
 
 
572 aa  130  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  29.39 
 
 
919 aa  130  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  34.39 
 
 
988 aa  124  6e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2682  prophage LambdaMc01, SNF2 family helicase  31.01 
 
 
925 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  37.26 
 
 
1094 aa  121  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  36.06 
 
 
927 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  33.49 
 
 
1065 aa  119  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  33.49 
 
 
1065 aa  119  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3098  helicase domain protein  31.51 
 
 
922 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.348218  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  35.71 
 
 
900 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  27.92 
 
 
1028 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>