More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0887 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0887  Non-specific serine/threonine protein kinase  100 
 
 
559 aa  1129    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000163947  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0368  SNF2-related protein  32.29 
 
 
674 aa  232  1e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.375742  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0035  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.17 
 
 
1112 aa  213  7e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3526  putative helicase  32.91 
 
 
1064 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1877  helicase, putative  32.05 
 
 
1064 aa  211  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.609799  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2451  SNF2-related protein  31.52 
 
 
1087 aa  210  5e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1815  putative helicase  32.69 
 
 
1064 aa  210  6e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  34.63 
 
 
1084 aa  210  7e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  34.42 
 
 
1084 aa  209  8e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3248  SNF2 helicase associated domain-containing protein  30.58 
 
 
1084 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1925  putative helicase  32.05 
 
 
1064 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  32.71 
 
 
1181 aa  207  3e-52  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1851  putative helicase  31.84 
 
 
1064 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000970317 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1653  SWF/SNF family helicase  31.84 
 
 
1064 aa  207  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1618  SWF/SNF family helicase  31.84 
 
 
1064 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.31767  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1671  helicase  31.84 
 
 
1064 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.480924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1804  helicase  31.84 
 
 
1064 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1669  non-specific serine/threonine protein kinase  32.19 
 
 
1068 aa  206  9e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1424  non-specific serine/threonine protein kinase  32.1 
 
 
1066 aa  204  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.106706  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2328  SNF2 family DNA/RNA helicase  31.84 
 
 
1034 aa  203  5e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0464  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.6 
 
 
1139 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000898251  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1539  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.39 
 
 
1091 aa  201  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00041445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2499  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.54 
 
 
1082 aa  201  3e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000806643  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1766  non-specific serine/threonine protein kinase  30.88 
 
 
1055 aa  201  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  28.45 
 
 
1002 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1148  putative helicase  32.99 
 
 
1069 aa  200  5e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0135217  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0986  DNA/RNA helicase, SNF2  32.64 
 
 
1069 aa  200  5e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  30.85 
 
 
1068 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1144  SNF2-related protein  30.69 
 
 
1071 aa  197  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00377305  normal  0.635598 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0598  non-specific serine/threonine protein kinase  32.38 
 
 
898 aa  196  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0596  SNF2-related protein  30.97 
 
 
1250 aa  196  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160311  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  32.81 
 
 
1125 aa  196  8.000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0789  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.17 
 
 
1069 aa  196  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.412315 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1564  DEAD/DEAH box helicase-like  30.63 
 
 
1068 aa  195  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.666232  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0731  SNF2-related protein  31.13 
 
 
1031 aa  194  4e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3458  SNF2-related protein  31.54 
 
 
1077 aa  194  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5096  helicase  31.26 
 
 
918 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5336  putative helicase  31.26 
 
 
918 aa  192  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0158606 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5487  helicase  31.26 
 
 
918 aa  192  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.700848  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5226  non-specific serine/threonine protein kinase  30.5 
 
 
1021 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14860  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.44 
 
 
1082 aa  192  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0912995  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0420  SNF2-related protein  29.68 
 
 
901 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0843  SNF2 family helicase  30.6 
 
 
1202 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4926  SNF2 family helicase  31.06 
 
 
918 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1096  SNF2-related protein  30.71 
 
 
899 aa  190  5.999999999999999e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.87327  normal  0.314656 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4941  SNF2 family helicase  31.06 
 
 
918 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0902  DEAD/DEAH box helicase-like  28.69 
 
 
1006 aa  189  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0006  Snf2 family protein  32.01 
 
 
1194 aa  188  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0921  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.98 
 
 
895 aa  188  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.203055  normal  0.885337 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5039  non-specific serine/threonine protein kinase  30.66 
 
 
918 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5418  SNF2 family helicase  30.95 
 
 
918 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  28 
 
 
621 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1235  SNF2-related protein  28.69 
 
 
1007 aa  187  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.224345  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5364  helicase, putative  30.94 
 
 
918 aa  187  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7277  non-specific serine/threonine protein kinase  28.74 
 
 
892 aa  187  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0554781 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0283  SNF2-related protein  28.93 
 
 
1062 aa  187  5e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0430  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.29 
 
 
1068 aa  187  6e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.218151  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3580  SNF2-related protein  27.76 
 
 
990 aa  186  9e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5370  putative helicase  29.96 
 
 
918 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3777  non-specific serine/threonine protein kinase  30.2 
 
 
918 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  30.74 
 
 
1152 aa  185  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2601  SNF2-related protein  30.28 
 
 
1086 aa  184  3e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0811  SNF2-related protein  29.27 
 
 
917 aa  184  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5586  putative helicase  29.76 
 
 
918 aa  183  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0588585 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1618  Snf2 family protein  28.21 
 
 
1032 aa  183  8.000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6788  SNF2/helicase domain protein  28.6 
 
 
1040 aa  183  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0383717  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4580  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.24 
 
 
982 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.407175  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2279  SNF2-related protein  28.23 
 
 
1033 aa  182  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  28.72 
 
 
1159 aa  182  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0327  SNF2-related protein  32.64 
 
 
1354 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.19544  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6251  SNF2-related protein  29.04 
 
 
959 aa  182  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971738  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0053  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.23 
 
 
1007 aa  181  4.999999999999999e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13470  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.46 
 
 
1102 aa  180  4.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3216  Non-specific serine/threonine protein kinase  28.8 
 
 
925 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.456162  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0905  non-specific serine/threonine protein kinase  28.1 
 
 
1120 aa  180  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1769  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.34 
 
 
1171 aa  179  1e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000889358  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6255  SNF2-related protein  28.83 
 
 
1019 aa  179  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.999994  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1047  Non-specific serine/threonine protein kinase  27.58 
 
 
1028 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00746664  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  29.5 
 
 
1072 aa  179  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3506  non-specific serine/threonine protein kinase  26.4 
 
 
848 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3354  SNF2-related protein  29.08 
 
 
924 aa  179  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0494  SNF2-like protein  27.53 
 
 
1025 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0284  SNF2 family DNA/RNA helicase  28.99 
 
 
1031 aa  179  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 
617 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4316  SNF2-related protein  28.12 
 
 
980 aa  178  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3239  non-specific serine/threonine protein kinase  29.75 
 
 
876 aa  178  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  27.72 
 
 
1065 aa  177  4e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3980  non-specific serine/threonine protein kinase  29.09 
 
 
1068 aa  177  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863358  normal  0.858201 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  28.14 
 
 
777 aa  176  7e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1760  non-specific serine/threonine protein kinase  29.77 
 
 
966 aa  176  7e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83690  component of SWI/SNF global transcription activator complex  29.74 
 
 
1566 aa  177  7e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0631887 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1744  SNF2-related protein  31.33 
 
 
1386 aa  176  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2303  SNF2-related protein  28.42 
 
 
1112 aa  176  8e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.646715  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0208  SNF2 helicase-related protein  27.59 
 
 
1209 aa  176  9e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  27.5 
 
 
988 aa  176  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54139  predicted protein  29.82 
 
 
995 aa  176  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0138  SNF2-related protein  29.1 
 
 
903 aa  176  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.021253  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3627  SNF2 family DNA/RNA helicase  31.15 
 
 
977 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE04710  helicase, putative  30.04 
 
 
1848 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  28.72 
 
 
1023 aa  174  2.9999999999999996e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>