104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0387 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0387  putative DNA methylase  100 
 
 
766 aa  1546    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  41.36 
 
 
1932 aa  273  1e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  40.31 
 
 
1934 aa  264  6e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  39.56 
 
 
2117 aa  263  8e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  40.92 
 
 
1722 aa  262  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  32.8 
 
 
2077 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  31.56 
 
 
1649 aa  233  9e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  30.59 
 
 
1642 aa  231  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  31.94 
 
 
2274 aa  231  4e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  33.55 
 
 
1669 aa  228  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  35.66 
 
 
1669 aa  217  7e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  30.11 
 
 
1706 aa  208  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  30.58 
 
 
1575 aa  204  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  38.51 
 
 
2098 aa  203  8e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1500  hypothetical protein  28.27 
 
 
763 aa  203  9.999999999999999e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538454 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  32.34 
 
 
1606 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  28.72 
 
 
1697 aa  201  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  32.79 
 
 
1726 aa  200  7.999999999999999e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  28.15 
 
 
1703 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  29.47 
 
 
1701 aa  196  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  27.9 
 
 
1925 aa  192  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  27.13 
 
 
1748 aa  191  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  27.3 
 
 
1702 aa  190  9e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  27.1 
 
 
1700 aa  189  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  27.23 
 
 
1697 aa  188  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  26.95 
 
 
1516 aa  187  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  26.54 
 
 
1693 aa  183  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  32.13 
 
 
2570 aa  179  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4475  helicase domain-containing protein  26.5 
 
 
761 aa  175  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5796  helicase domain-containing protein  29.03 
 
 
976 aa  169  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00607211  hitchhiker  2.23463e-19 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  27.18 
 
 
2005 aa  167  5.9999999999999996e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0847  hypothetical protein  30.61 
 
 
526 aa  160  1e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203105 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0868  hypothetical protein  57.46 
 
 
458 aa  154  4e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  25.51 
 
 
1956 aa  151  4e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 
1674 aa  146  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  27.68 
 
 
1594 aa  142  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  28.42 
 
 
1417 aa  115  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a020  hypothetical protein  43.57 
 
 
191 aa  89  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8083  helicase  22.29 
 
 
1211 aa  80.9  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0239915  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3018  helicase domain-containing protein  24.67 
 
 
678 aa  68.6  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  29.77 
 
 
900 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  36.47 
 
 
894 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3080  helicase related protein  29.26 
 
 
1786 aa  57.8  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1826  hypothetical protein  27.95 
 
 
442 aa  57.4  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  26.4 
 
 
971 aa  57  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  24.43 
 
 
1046 aa  53.5  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  26.34 
 
 
937 aa  52  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  27.39 
 
 
877 aa  51.6  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  27.96 
 
 
933 aa  50.4  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1599  helicase domain protein  42.03 
 
 
889 aa  48.9  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0244124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  37.65 
 
 
560 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  37.65 
 
 
560 aa  48.9  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  37.65 
 
 
560 aa  48.9  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  37.65 
 
 
560 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  37.65 
 
 
560 aa  48.9  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  37.65 
 
 
560 aa  48.9  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  37.65 
 
 
560 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  37.65 
 
 
560 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  37.65 
 
 
560 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  35.63 
 
 
1168 aa  48.9  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  27.82 
 
 
950 aa  48.5  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  37.93 
 
 
968 aa  48.1  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  37.65 
 
 
560 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  25.44 
 
 
969 aa  48.1  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  30.97 
 
 
805 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  23.72 
 
 
1031 aa  48.1  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  41.18 
 
 
1147 aa  48.1  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  39.68 
 
 
953 aa  47.8  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  42.86 
 
 
958 aa  47  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4785  helicase domain-containing protein  31.21 
 
 
724 aa  47.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0599344  normal  0.582969 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  31.78 
 
 
1002 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  42.86 
 
 
958 aa  47  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  46.67 
 
 
957 aa  47.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  38.24 
 
 
555 aa  47.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  37.5 
 
 
952 aa  47.4  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  38.24 
 
 
554 aa  47.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  30.95 
 
 
801 aa  46.6  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  23.87 
 
 
1058 aa  47  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  27.04 
 
 
1172 aa  46.6  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  23.03 
 
 
1045 aa  46.6  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  26.72 
 
 
1116 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  39.58 
 
 
986 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  43.48 
 
 
969 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  36.76 
 
 
560 aa  46.2  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  33.8 
 
 
1177 aa  46.2  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  30.85 
 
 
1109 aa  46.6  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2134  helicase domain protein  31.58 
 
 
927 aa  46.2  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0072  RecQ helicase, putative  25.78 
 
 
468 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  30.58 
 
 
669 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  40.35 
 
 
1160 aa  45.4  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  26.53 
 
 
1125 aa  45.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  40 
 
 
941 aa  45.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  40 
 
 
941 aa  45.1  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  42.42 
 
 
951 aa  45.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  29.46 
 
 
467 aa  45.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  28.31 
 
 
919 aa  45.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  35.71 
 
 
1145 aa  44.7  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  31.11 
 
 
1129 aa  44.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  42.86 
 
 
1153 aa  44.7  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  31.63 
 
 
1028 aa  44.3  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>