98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0160 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  30.2 
 
 
1722 aa  643    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  31.46 
 
 
2077 aa  676    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  28.57 
 
 
1669 aa  642    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  40.82 
 
 
1934 aa  1266    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  32.59 
 
 
2098 aa  688    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  100 
 
 
2117 aa  4327    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  40.01 
 
 
1932 aa  1284    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  28.29 
 
 
1669 aa  631  1e-179  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  28.05 
 
 
1726 aa  617  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  28.26 
 
 
1706 aa  612  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  26.89 
 
 
1642 aa  596  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  27.36 
 
 
1748 aa  561  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  27.03 
 
 
1697 aa  556  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  27.31 
 
 
1693 aa  556  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  25.97 
 
 
1925 aa  552  1e-155  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  27.32 
 
 
1702 aa  547  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  27.03 
 
 
1701 aa  550  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  27.72 
 
 
1697 aa  545  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  26.62 
 
 
1700 aa  546  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  27.25 
 
 
1703 aa  542  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  26.44 
 
 
1649 aa  526  1e-147  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  27.95 
 
 
1516 aa  517  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  26.82 
 
 
2570 aa  508  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  26.75 
 
 
1417 aa  507  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  26.64 
 
 
1606 aa  493  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  31.79 
 
 
2274 aa  487  1e-135  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  25.98 
 
 
1575 aa  476  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  27.48 
 
 
1674 aa  466  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  24.78 
 
 
1956 aa  432  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  30.13 
 
 
2005 aa  409  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  26.39 
 
 
1594 aa  366  3e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8083  helicase  27.76 
 
 
1211 aa  343  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0239915  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5796  helicase domain-containing protein  26.06 
 
 
976 aa  326  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00607211  hitchhiker  2.23463e-19 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0387  putative DNA methylase  38.35 
 
 
766 aa  271  8e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4475  helicase domain-containing protein  30.92 
 
 
761 aa  244  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1500  hypothetical protein  31.51 
 
 
763 aa  241  1e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538454 
 
 
-
 
NC_002950  PG0847  hypothetical protein  29.21 
 
 
526 aa  131  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203105 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  27.3 
 
 
470 aa  117  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3075  DEAD-like helicase  22.35 
 
 
1328 aa  81.3  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3018  helicase domain-containing protein  23.26 
 
 
678 aa  73.9  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5797  methyltransferase type 11  26.14 
 
 
577 aa  64.7  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.295406  hitchhiker  4.23938e-17 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1466  SNF2 family helicase  21.47 
 
 
1379 aa  62.4  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.942792  normal  0.0166873 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1895  type I restriction-modification system, M subunit  26.34 
 
 
518 aa  60.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.646372  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1860  type I restriction-modification system, M subunit  26.34 
 
 
518 aa  60.8  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.876278  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  26.34 
 
 
518 aa  60.5  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  26.34 
 
 
518 aa  60.5  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  28.79 
 
 
423 aa  57.4  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0664  SNF2-related protein  38.66 
 
 
1125 aa  55.5  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2472  type I restriction-modification system, M subunit  28.17 
 
 
518 aa  54.7  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0275864  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0129  N-6 DNA methylase  27.35 
 
 
533 aa  54.7  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0268034  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0610  type III restriction protein res subunit  29.89 
 
 
905 aa  52  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_15102  helicase  28.06 
 
 
809 aa  51.2  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00429974 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0594  helicase domain protein  29.89 
 
 
898 aa  51.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0567  RNA polymerase associated protein rapA  29.89 
 
 
898 aa  51.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0602  SNF2-related protein  29.89 
 
 
892 aa  51.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6184  helicase domain protein  25.45 
 
 
284 aa  50.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0111751 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2961  N-6 DNA methylase  25.94 
 
 
530 aa  50.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  28.3 
 
 
894 aa  50.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4987  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.17 
 
 
1155 aa  50.4  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.894116  normal  0.0382537 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.61 
 
 
503 aa  50.1  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0613  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  22.37 
 
 
484 aa  49.3  0.0009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1535  N-6 DNA methylase  23.65 
 
 
486 aa  48.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  37.31 
 
 
813 aa  48.5  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  40.98 
 
 
900 aa  48.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03920  DNA supercoiling, putative  27.86 
 
 
993 aa  48.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3570  N-6 DNA methylase  23.53 
 
 
484 aa  48.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.054861  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  28.24 
 
 
937 aa  48.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1195  type II restriction-modification enzyme  24.91 
 
 
1343 aa  47.8  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3354  type I restriction-modification system, M subunit  23.13 
 
 
528 aa  47.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.501947  normal  0.0329699 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1597  Snf2/Rad54 family helicase  26.05 
 
 
1084 aa  48.1  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154649  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1878  Snf2/Rad54 family helicase  25.63 
 
 
1084 aa  47.4  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.456033  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00855  DNA-dependent ATPase (Eurofung)  21.09 
 
 
1011 aa  47  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  22.81 
 
 
969 aa  47  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  23.08 
 
 
1181 aa  47  0.004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1835  hypothetical protein  24.49 
 
 
318 aa  47  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000176209  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1468  adenine-specific DNA methylase  25.71 
 
 
254 aa  47  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00771536 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  31.46 
 
 
958 aa  47  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2313  type III restriction protein res subunit  37.84 
 
 
706 aa  47  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56808  DNA dependent ATPase  21.67 
 
 
1067 aa  46.6  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0205871 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  32 
 
 
1065 aa  46.6  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1741  ATP-dependent DNA helicase RecG  31.58 
 
 
681 aa  46.6  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4600  SNF2-related protein  31.76 
 
 
746 aa  46.2  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4265  type I restriction-modification system, M subunit  26.97 
 
 
537 aa  46.2  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  31.46 
 
 
958 aa  46.2  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  23.22 
 
 
494 aa  46.2  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02510  chromosome organization and biogenesis -related protein, putative  25.81 
 
 
939 aa  46.2  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  23.33 
 
 
1023 aa  46.2  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  31.25 
 
 
560 aa  45.8  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1663  non-specific serine/threonine protein kinase  25.19 
 
 
1108 aa  45.8  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0559989  normal  0.741306 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02278  catalytic subunit of the SWI/SNF chromatin remodeling complex (Eurofung)  30.53 
 
 
1407 aa  45.8  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0444609  normal  0.871565 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  27.35 
 
 
1143 aa  45.8  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10820  helicase protein  25 
 
 
872 aa  45.8  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  31.03 
 
 
968 aa  45.8  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0219  helicase-like  41.82 
 
 
840 aa  45.8  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000357618  hitchhiker  0.00781123 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  41.82 
 
 
1082 aa  45.8  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  27.78 
 
 
554 aa  45.8  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  32.81 
 
 
933 aa  45.8  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  35.82 
 
 
1177 aa  45.8  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>