More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0034 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  100 
 
 		 1153 aa  2349    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  43.22 
 
 		 1143 aa  854    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  35.74 
 
 		 1124 aa  613  9.999999999999999e-175  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  31.4 
 
 		 1016 aa  357  8.999999999999999e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  28.84 
 
 		 1131 aa  284  6.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  26.1 
 
 		 1112 aa  245  3e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  26.49 
 
 		 1085 aa  241  5e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  25.79 
 
 		 1052 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  26.04 
 
 		 1086 aa  232  4e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  26.52 
 
 		 1067 aa  231  7e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  26.07 
 
 		 1080 aa  230  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  24.65 
 
 		 1083 aa  229  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  28.69 
 
 		 1053 aa  226  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  27.07 
 
 		 1069 aa  224  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  25.03 
 
 		 1051 aa  223  9.999999999999999e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  28.36 
 
 		 1077 aa  218  7e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  28.11 
 
 		 853 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  27.23 
 
 		 1109 aa  211  6e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  28.19 
 
 		 1089 aa  209  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  26.81 
 
 		 1071 aa  207  9e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  26.71 
 
 		 1100 aa  206  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  28.09 
 
 		 1077 aa  206  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  28.49 
 
 		 1082 aa  206  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  25.84 
 
 		 1072 aa  204  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  27.78 
 
 		 1075 aa  203  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  26.41 
 
 		 1065 aa  201  5e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  24.73 
 
 		 1081 aa  201  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  25.6 
 
 		 1086 aa  200  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  26.09 
 
 		 1065 aa  197  7e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  26.12 
 
 		 1127 aa  197  8.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  26.58 
 
 		 1064 aa  197  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  25.99 
 
 		 1078 aa  192  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  24.19 
 
 		 1099 aa  191  7e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  26.98 
 
 		 1078 aa  191  8e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  25.44 
 
 		 1074 aa  189  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  25 
 
 		 1077 aa  186  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  26.18 
 
 		 1090 aa  183  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  25.42 
 
 		 1075 aa  183  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  27.59 
 
 		 1140 aa  184  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  25.09 
 
 		 1087 aa  178  6e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  24.85 
 
 		 1075 aa  176  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  28.4 
 
 		 1060 aa  165  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  23.3 
 
 		 1117 aa  160  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  28.48 
 
 		 1128 aa  159  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  25.87 
 
 		 1065 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  28.01 
 
 		 1153 aa  149  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  25.32 
 
 		 1086 aa  131  6e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  27.01 
 
 		 1109 aa  114  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  26.88 
 
 		 1170 aa  108  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  28.32 
 
 		 1125 aa  99.4  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  24.79 
 
 		 1160 aa  96.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  26.39 
 
 		 1169 aa  96.3  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  23.1 
 
 		 1160 aa  95.9  4e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  25.8 
 
 		 1170 aa  95.5  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  26.2 
 
 		 1169 aa  95.1  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3488  type III restriction enzyme, res subunit  24.28 
 
 		 696 aa  94.7  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325873  normal  0.223098 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  26.25 
 
 		 1160 aa  94  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  27.5 
 
 		 1122 aa  92  6e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  25.13 
 
 		 1170 aa  90.1  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  24.35 
 
 		 969 aa  89.7  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  23.93 
 
 		 988 aa  89.4  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  25.79 
 
 		 1212 aa  87.4  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  24.92 
 
 		 1172 aa  85.5  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  25.4 
 
 		 1167 aa  84.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  24.92 
 
 		 952 aa  83.6  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  27.58 
 
 		 1187 aa  82.8  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  24.53 
 
 		 1170 aa  81.6  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  23.82 
 
 		 919 aa  80.9  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  25.55 
 
 		 1168 aa  80.9  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  33.99 
 
 		 951 aa  80.5  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  23.16 
 
 		 1062 aa  79.7  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  34.88 
 
 		 961 aa  79  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  23.92 
 
 		 1167 aa  78.2  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1937  helicase, putative  27.35 
 
 		 1062 aa  78.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000134724 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  23.45 
 
 		 1046 aa  77  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  24.56 
 
 		 1082 aa  76.3  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  32 
 
 		 1065 aa  75.9  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  32 
 
 		 1065 aa  75.9  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  23.6 
 
 		 1167 aa  75.9  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  24.46 
 
 		 962 aa  75.5  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  55.56 
 
 		 1046 aa  75.1  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  24.09 
 
 		 1172 aa  74.3  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  22.11 
 
 		 1138 aa  73.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  25.71 
 
 		 964 aa  73.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  41.11 
 
 		 1043 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  50 
 
 		 972 aa  72.8  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2069  SNF2-related protein  39.09 
 
 		 964 aa  72.4  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  42.55 
 
 		 665 aa  72  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  27.27 
 
 		 906 aa  72  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  34.91 
 
 		 932 aa  71.6  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  42.11 
 
 		 963 aa  71.6  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  38.17 
 
 		 955 aa  71.6  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  25.23 
 
 		 966 aa  71.6  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  32.24 
 
 		 963 aa  70.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  33.81 
 
 		 584 aa  70.9  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  23.73 
 
 		 1145 aa  70.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  36.23 
 
 		 915 aa  70.1  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  36.23 
 
 		 915 aa  70.1  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  36.23 
 
 		 916 aa  70.1  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  28.63 
 
 		 760 aa  69.7  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>