113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4316 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  37.66 
 
 		 1669 aa  823    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  38.02 
 
 		 1669 aa  833    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  33.05 
 
 		 1726 aa  733    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  34.56 
 
 		 1706 aa  685    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  74.82 
 
 		 1703 aa  2305    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  84.5 
 
 		 1700 aa  2622    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  100 
 
 		 1516 aa  3085    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  34.85 
 
 		 1575 aa  737    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  34.3 
 
 		 1925 aa  740    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  33.33 
 
 		 1649 aa  729    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  37.53 
 
 		 1642 aa  843    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  31.47 
 
 		 1932 aa  640    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  83.51 
 
 		 1748 aa  2591    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  79.31 
 
 		 1702 aa  2454    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  84.76 
 
 		 1417 aa  2128    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  80.04 
 
 		 1697 aa  2467    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  57.88 
 
 		 1693 aa  1684    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  35.65 
 
 		 1606 aa  743    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  34.23 
 
 		 2077 aa  836    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8083  helicase  75.94 
 
 		 1211 aa  1786    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0239915  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  81.49 
 
 		 1697 aa  2520    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  81.52 
 
 		 1701 aa  2503    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  33.79 
 
 		 2098 aa  736    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  31.67 
 
 		 1934 aa  630  1e-179  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  32.24 
 
 		 1594 aa  601  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  32.03 
 
 		 1956 aa  574  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  29.19 
 
 		 2570 aa  550  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  31.14 
 
 		 1674 aa  513  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  28.1 
 
 		 2117 aa  503  1e-140  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  29.49 
 
 		 2274 aa  486  1e-135  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  33.68 
 
 		 1722 aa  460  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  78.16 
 
 		 470 aa  421  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5796  helicase domain-containing protein  34.63 
 
 		 976 aa  416  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00607211  hitchhiker  2.23463e-19 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  32.79 
 
 		 2005 aa  401  9.999999999999999e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1500  hypothetical protein  29.51 
 
 		 763 aa  240  2e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538454 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4475  helicase domain-containing protein  29.81 
 
 		 761 aa  228  6e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0387  putative DNA methylase  26.95 
 
 		 766 aa  187  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5797  methyltransferase type 11  33.2 
 
 		 577 aa  164  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.295406  hitchhiker  4.23938e-17 
 
 
-
 
NC_002950  PG0847  hypothetical protein  27.55 
 
 		 526 aa  136  3e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203105 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6184  helicase domain protein  67.71 
 
 		 284 aa  136  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0111751 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7033  hypothetical protein  57.14 
 
 		 97 aa  97.1  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0796  hypothetical protein  31.68 
 
 		 339 aa  89.7  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3075  DEAD-like helicase  25.13 
 
 		 1328 aa  84  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2349  hypothetical protein  34.03 
 
 		 341 aa  78.2  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0743518  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3018  helicase domain-containing protein  33.1 
 
 		 678 aa  77  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1570  hypothetical protein  33.33 
 
 		 341 aa  76.6  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.447914  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  39.08 
 
 		 894 aa  66.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4142  N-6 DNA methylase  27.83 
 
 		 503 aa  59.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  37.35 
 
 		 950 aa  56.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5420  helicase domain-containing protein  35.05 
 
 		 1046 aa  56.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1466  SNF2 family helicase  22.33 
 
 		 1379 aa  55.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.942792  normal  0.0166873 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  28.21 
 
 		 968 aa  55.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  27.35 
 
 		 933 aa  55.8  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  30.91 
 
 		 557 aa  55.5  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  28.57 
 
 		 1116 aa  55.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  32.77 
 
 		 900 aa  53.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  24.89 
 
 		 958 aa  53.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  34.09 
 
 		 466 aa  53.9  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  26.42 
 
 		 986 aa  53.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1468  adenine-specific DNA methylase  31.41 
 
 		 254 aa  53.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771536 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  31.19 
 
 		 1147 aa  53.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  29.63 
 
 		 958 aa  53.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  30.88 
 
 		 235 aa  52.8  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  32.58 
 
 		 953 aa  52  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0279  hypothetical protein  37.21 
 
 		 285 aa  50.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.313315  normal  0.062823 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  26.81 
 
 		 969 aa  50.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  21.63 
 
 		 947 aa  50.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  29.15 
 
 		 477 aa  51.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1599  helicase domain protein  38.57 
 
 		 889 aa  51.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0244124  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  21.8 
 
 		 929 aa  51.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1195  type II restriction-modification enzyme  28.99 
 
 		 1343 aa  50.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0545  helicase-like  32.05 
 
 		 910 aa  50.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2172  helicase-like  29.92 
 
 		 922 aa  50.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338314  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0588  Eco57I restriction endonuclease  28 
 
 		 527 aa  50.4  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.274467  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1254  N-6 DNA methylase  30.6 
 
 		 484 aa  49.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0072  RecQ helicase, putative  29.6 
 
 		 468 aa  49.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  30.53 
 
 		 945 aa  48.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  29.3 
 
 		 1201 aa  48.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  29.3 
 
 		 1201 aa  48.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  30.08 
 
 		 481 aa  48.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  32.18 
 
 		 957 aa  48.9  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  29.36 
 
 		 1046 aa  48.9  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  30.08 
 
 		 481 aa  48.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1352  helicase-like  35.71 
 
 		 928 aa  48.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  29.27 
 
 		 1065 aa  48.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  29.27 
 
 		 1065 aa  48.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  28 
 
 		 553 aa  48.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  35.24 
 
 		 877 aa  48.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3619  methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 450 aa  48.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.264037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  31.39 
 
 		 1160 aa  48.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  29.94 
 
 		 423 aa  48.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  30.77 
 
 		 952 aa  48.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0012  helicase-like protein  28.8 
 
 		 924 aa  47.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3698  hypothetical protein  29.88 
 
 		 449 aa  47.8  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  29.82 
 
 		 1095 aa  47.8  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  32.5 
 
 		 941 aa  47.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0725  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  26.35 
 
 		 949 aa  47  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 948 aa  47  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  32.14 
 
 		 506 aa  47  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  37.5 
 
 		 1177 aa  47  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>