More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0545 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0545  helicase-like  100 
 
 
910 aa  1850    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0278  helicase domain protein  46.1 
 
 
915 aa  789    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2172  helicase-like  44.52 
 
 
922 aa  739    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338314  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0012  helicase-like protein  46.95 
 
 
924 aa  798    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1352  helicase-like  46.68 
 
 
928 aa  782    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1599  helicase domain protein  37.82 
 
 
889 aa  556  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0244124  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  24.31 
 
 
1065 aa  186  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  24.31 
 
 
1065 aa  186  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1540  helicase domain protein  31.27 
 
 
1187 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100683  unclonable  0.000000000869975 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  24.62 
 
 
1037 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  21.24 
 
 
1052 aa  105  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  24.48 
 
 
1043 aa  100  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  29.62 
 
 
1147 aa  100  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  25.28 
 
 
964 aa  98.6  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  20.08 
 
 
1051 aa  97.4  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  30.06 
 
 
1144 aa  96.3  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  30.06 
 
 
835 aa  96.3  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  21.27 
 
 
1099 aa  96.7  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  33.94 
 
 
1168 aa  95.9  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  21.84 
 
 
1086 aa  94.4  9e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  34.59 
 
 
1136 aa  94  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  31.25 
 
 
584 aa  94.4  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  28.9 
 
 
1095 aa  94  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  34.91 
 
 
1013 aa  93.6  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.25 
 
 
1212 aa  92.4  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  31.54 
 
 
1169 aa  92  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  30.77 
 
 
1046 aa  91.7  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  38.29 
 
 
1170 aa  91.3  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  29.24 
 
 
760 aa  91.3  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  26.63 
 
 
829 aa  91.3  8e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  38.52 
 
 
1169 aa  90.9  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  30.11 
 
 
1138 aa  90.5  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  25.58 
 
 
966 aa  90.5  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  31.73 
 
 
919 aa  90.9  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  28.52 
 
 
969 aa  90.1  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  35.06 
 
 
1170 aa  90.1  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  30.63 
 
 
584 aa  89.7  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  29.86 
 
 
541 aa  89.4  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  28.62 
 
 
969 aa  89.4  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  28.3 
 
 
941 aa  88.2  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  25.32 
 
 
962 aa  87.8  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  28.3 
 
 
941 aa  88.2  7e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  27.46 
 
 
805 aa  87.8  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05330  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.57 
 
 
961 aa  87.8  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  27.9 
 
 
801 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  36.91 
 
 
906 aa  87.4  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  29 
 
 
988 aa  87  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  28.63 
 
 
572 aa  87.4  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  33.12 
 
 
1137 aa  86.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  34.09 
 
 
1172 aa  86.7  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4128  helicase domain protein  35.46 
 
 
1131 aa  85.9  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33452  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  33.7 
 
 
1167 aa  85.9  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  27.63 
 
 
877 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  33.54 
 
 
1160 aa  85.9  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  34.55 
 
 
1167 aa  85.9  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  34.1 
 
 
1170 aa  85.1  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 
1145 aa  85.1  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  27.88 
 
 
933 aa  85.1  0.000000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  28.32 
 
 
1069 aa  84.7  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  28.32 
 
 
1069 aa  84.7  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  36.91 
 
 
1170 aa  84.7  0.000000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  36.91 
 
 
972 aa  83.6  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  31.3 
 
 
949 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  33.82 
 
 
1165 aa  83.2  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  31.22 
 
 
894 aa  83.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  34.07 
 
 
1201 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  31.71 
 
 
951 aa  83.6  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  34.07 
 
 
1201 aa  83.2  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  28.62 
 
 
971 aa  82.4  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  33.77 
 
 
1167 aa  82  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  38.69 
 
 
1038 aa  82  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  34.3 
 
 
774 aa  81.3  0.00000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  40.57 
 
 
560 aa  80.9  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  47.37 
 
 
1129 aa  80.9  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  35.71 
 
 
1044 aa  80.9  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  42.57 
 
 
560 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  37.1 
 
 
1057 aa  80.5  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  39.64 
 
 
554 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  31.17 
 
 
1046 aa  80.5  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  43.96 
 
 
560 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  43.96 
 
 
560 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  43.96 
 
 
560 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  43.96 
 
 
560 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  43.96 
 
 
560 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  26.56 
 
 
937 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  43.96 
 
 
560 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  43.96 
 
 
560 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  43.96 
 
 
560 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  30.8 
 
 
1031 aa  80.1  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  43.96 
 
 
560 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  27.14 
 
 
1116 aa  80.1  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  33.14 
 
 
1194 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  43.68 
 
 
949 aa  79.3  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  36.6 
 
 
1160 aa  79.3  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  30.03 
 
 
1028 aa  79  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  30.14 
 
 
963 aa  78.6  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0933  DEAD/DEAH box helicase  32.14 
 
 
932 aa  77.8  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.599756  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  45.98 
 
 
555 aa  77.8  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  38 
 
 
968 aa  77.4  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  34.13 
 
 
1172 aa  76.6  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>