More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1195 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1195  type II restriction-modification enzyme  100 
 
 		 1343 aa  2704    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1393  restriction and modification enzyme CjeI  49.82 
 
 		 1285 aa  953    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1564  restriction modification system DNA specificity domain protein  38.68 
 
 		 1134 aa  381  1e-104  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0972  N-6 DNA methylase  27.13 
 
 		 911 aa  142  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.91965 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2086  restriction modification system DNA specificity domain protein  37.5 
 
 		 417 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000683293 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3129  restriction modification system DNA specificity subunit  25.33 
 
 		 416 aa  116  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.343622  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1170  restriction modification system DNA specificity subunit  40 
 
 		 402 aa  107  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.249165  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1158  restriction modification system DNA specificity subunit  34.83 
 
 		 454 aa  103  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000117149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.25 
 
 		 457 aa  100  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.41 
 
 		 477 aa  99.4  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  34.12 
 
 		 456 aa  95.5  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3089  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.36 
 
 		 520 aa  93.2  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1978  restriction modification system DNA specificity subunit  25.2 
 
 		 616 aa  91.7  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  31.94 
 
 		 432 aa  90.9  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  23.9 
 
 		 498 aa  90.5  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1027  restriction modification system DNA specificity subunit  34.95 
 
 		 420 aa  89  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  32.35 
 
 		 846 aa  87.8  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5276  restriction modification system DNA specificity subunit  33.33 
 
 		 418 aa  86.3  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3192  N-6 DNA methylase  26.42 
 
 		 605 aa  85.5  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1307  restriction modification system DNA specificity subunit  31.76 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0324  N-6 DNA methylase  23.44 
 
 		 657 aa  84.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00528654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3525  restriction modification system DNA specificity subunit  29.02 
 
 		 420 aa  83.6  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  26.72 
 
 		 730 aa  83.6  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0448  restriction modification system DNA specificity domain  30.69 
 
 		 435 aa  84  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000159098 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  23.14 
 
 		 498 aa  82.4  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  23.16 
 
 		 456 aa  82.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0004  N-6 DNA methylase  24.66 
 
 		 710 aa  82  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.702722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3267  restriction modification system DNA specificity subunit  25.07 
 
 		 557 aa  81.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0920403  decreased coverage  0.00535253 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0149  restriction modification system DNA specificity subunit  31.77 
 
 		 400 aa  81.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3132  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.51 
 
 		 424 aa  80.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.474681 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1954  restriction modification system DNA specificity subunit  32.47 
 
 		 406 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2722  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.98 
 
 		 385 aa  79.7  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0508  restriction modification system DNA specificity subunit  34.09 
 
 		 511 aa  79.7  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  35.67 
 
 		 422 aa  79.7  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  22.7 
 
 		 810 aa  79  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  24.83 
 
 		 499 aa  78.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1060  restriction modification system DNA specificity subunit  34.19 
 
 		 397 aa  78.2  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  24.29 
 
 		 810 aa  77.8  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1220  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.38 
 
 		 620 aa  77.4  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  29.35 
 
 		 422 aa  76.3  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20400  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  23.36 
 
 		 654 aa  76.3  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0518055 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  31.48 
 
 		 834 aa  76.3  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0504  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.58 
 
 		 408 aa  75.9  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  22.59 
 
 		 496 aa  75.5  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0842  type I restriction-modification enzyme, S subunit, putative  29.85 
 
 		 476 aa  74.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  21.28 
 
 		 799 aa  74.3  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  22.58 
 
 		 809 aa  74.3  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3550  restriction modification system DNA specificity subunit  25.79 
 
 		 417 aa  74.7  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257959  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  25.22 
 
 		 438 aa  74.3  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0951  restriction modification system DNA specificity subunit  29.41 
 
 		 419 aa  73.6  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000406123 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  24.91 
 
 		 499 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20210  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.36 
 
 		 565 aa  73.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266778  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  22.49 
 
 		 500 aa  72.8  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0750  type I restriction-modification system, M subunit  22.66 
 
 		 544 aa  72.8  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  24.15 
 
 		 527 aa  72.4  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003235  type I restriction-modification system specificity subunit S  29.79 
 
 		 437 aa  72.8  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0921  N-6 DNA methylase  25.09 
 
 		 676 aa  72  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3653  type I restriction enzyme StySPI specificity protein  21.02 
 
 		 460 aa  70.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.234587  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3200  N-6 DNA methylase  24.52 
 
 		 545 aa  71.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1032  restriction modification system DNA specificity subunit  22.36 
 
 		 457 aa  70.5  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41908  normal  0.322454 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2995  N-6 DNA methylase  28.16 
 
 		 707 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00439445  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  22.92 
 
 		 847 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  22.64 
 
 		 508 aa  69.7  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  34.17 
 
 		 549 aa  69.7  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  23.26 
 
 		 502 aa  69.7  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0450  type I restriction-modification system, M subunit  25.26 
 
 		 537 aa  69.3  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003054 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  22.64 
 
 		 523 aa  69.3  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4163  restriction modification system DNA specificity subunit  38.54 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.864984  normal  0.0584456 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1851  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  32.92 
 
 		 194 aa  68.9  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  28.21 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2672  N-6 DNA methylase  22.68 
 
 		 814 aa  68.9  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29252  normal  0.213379 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  22.53 
 
 		 477 aa  68.9  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  21.53 
 
 		 489 aa  68.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  23.78 
 
 		 489 aa  68.2  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2397  restriction modification system DNA specificity domain  26.02 
 
 		 417 aa  67.8  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  27.24 
 
 		 775 aa  68.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  21.67 
 
 		 814 aa  68.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  23.1 
 
 		 694 aa  68.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4454  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.68 
 
 		 406 aa  67.8  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.859615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1061  putative type I restriction-modification system, S subunit  25 
 
 		 528 aa  68.2  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4809  N-6 DNA methylase  24.47 
 
 		 544 aa  67.8  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.136314  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2008  Sec-independent protein translocase protein TatC  23.81 
 
 		 489 aa  67.4  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  23.61 
 
 		 429 aa  67.8  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2372  type I restriction-modification system, M subunit  22.12 
 
 		 537 aa  67.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.728855  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2003  type I restriction-modification system, M subunit  22.12 
 
 		 537 aa  67.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  23.89 
 
 		 505 aa  67  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0925  type I restriction-modification system, M subunit  25.17 
 
 		 535 aa  66.6  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000528021  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4713  N-6 DNA methylase  24.47 
 
 		 544 aa  66.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0950517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2413  N-6 DNA methylase  21.94 
 
 		 494 aa  66.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3154  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  21.46 
 
 		 508 aa  66.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  21.89 
 
 		 500 aa  66.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0499  type I restriction-modification system, M subunit  23.13 
 
 		 808 aa  65.9  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115412  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  20.82 
 
 		 585 aa  65.5  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3546  type I restriction-modification system, M subunit  22.32 
 
 		 535 aa  65.5  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.831972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3719  restriction modification system DNA specificity subunit  28.12 
 
 		 585 aa  65.1  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02073  type I restriction enzyme EcoEI M protein  23.15 
 
 		 489 aa  65.5  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1085  type I restriction-modification system, M subunit  21.32 
 
 		 547 aa  65.1  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3540  restriction modification system DNA specificity subunit  28.1 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2027  N-6 DNA methylase  23.82 
 
 		 513 aa  65.1  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128967 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0871  restriction modification system DNA specificity subunit  37.5 
 
 		 211 aa  64.7  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>