181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3010 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  100 
 
 		 549 aa  1123    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2285  hypothetical protein  39.19 
 
 		 425 aa  303  6.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0313194  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  40.05 
 
 		 429 aa  302  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3129  restriction modification system DNA specificity subunit  48.76 
 
 		 416 aa  293  8e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.343622  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2452  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  48.83 
 
 		 419 aa  290  4e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.587532 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2742  type I restriction-modification system specificity determinant  40.81 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971087  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2016  restriction modification system DNA specificity subunit  38.15 
 
 		 417 aa  203  8e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0839323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2909  restriction modification system DNA specificity subunit  38.49 
 
 		 440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  30.46 
 
 		 432 aa  190  7e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  35.42 
 
 		 447 aa  189  8e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0287  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  33.02 
 
 		 471 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3297  restriction modification system DNA specificity subunit  33.33 
 
 		 430 aa  170  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489204 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0878  type I restriction modification system methylase  30.94 
 
 		 424 aa  160  5e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.707045 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0836  type I restriction-modification system S subunit  35.61 
 
 		 416 aa  159  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4778  restriction modification system DNA specificity subunit  32.16 
 
 		 415 aa  154  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1220  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.23 
 
 		 620 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1307  restriction modification system DNA specificity subunit  31.15 
 
 		 285 aa  145  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4472  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.97 
 
 		 428 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2791  type I restriction-modification system, S subunit  31.85 
 
 		 418 aa  144  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2415  restriction modification system DNA specificity domain  31.85 
 
 		 418 aa  144  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.589349  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0006  restriction modification system, type I  34.73 
 
 		 412 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4241  restriction modification system DNA specificity subunit  31.59 
 
 		 411 aa  136  8e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.491612  hitchhiker  0.00127278 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1941  restriction endonuclease S subunits-like  33.87 
 
 		 451 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0182546  normal  0.0682578 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0223  putative HsdS protein  27.76 
 
 		 438 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3525  restriction modification system DNA specificity subunit  27.47 
 
 		 420 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3382  restriction modification system DNA specificity subunit  29.18 
 
 		 485 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3757  restriction modification system S subunit  29.87 
 
 		 436 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.386531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1095  hypothetical protein  30.43 
 
 		 401 aa  126  8.000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1103  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.78 
 
 		 400 aa  126  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0442932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3505  DNA polymerase beta subunit  58.33 
 
 		 115 aa  126  9e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3144  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.22 
 
 		 412 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1360  restriction modification system DNA specificity subunit  31.86 
 
 		 453 aa  124  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3353  DNA polymerase beta subunit  63.27 
 
 		 112 aa  123  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1087  type I restriction-modification system, S subunit  30.68 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247708  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0637  restriction modification system DNA specificity domain  25.78 
 
 		 422 aa  120  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  24.85 
 
 		 429 aa  114  5e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0041  restriction modification system DNA specificity subunit  27.25 
 
 		 397 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1808  restriction modification system DNA specificity subunit  26.35 
 
 		 483 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.300643  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0035  hypothetical protein  30.75 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0508  restriction modification system DNA specificity subunit  30.14 
 
 		 511 aa  106  9e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1643  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.83 
 
 		 428 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3180  restriction modification system DNA specificity domain protein  35.71 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1219  restriction modification system DNA specificity domain  26.85 
 
 		 412 aa  103  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2508  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  39.51 
 
 		 401 aa  99  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.700746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3081  restriction modification system DNA specificity domain protein  42.18 
 
 		 415 aa  97.8  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2910  putative type I restriction-modification system, S subunit  32.96 
 
 		 373 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.13 
 
 		 427 aa  96.3  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.76 
 
 		 457 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3592  DNA polymerase beta domain protein region  47.92 
 
 		 96 aa  92.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000372185  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1735  DNA polymerase beta domain protein region  44.34 
 
 		 106 aa  92  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  27.69 
 
 		 456 aa  91.7  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0842  type I restriction-modification enzyme, S subunit, putative  29 
 
 		 476 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2926  restriction modification system DNA specificity subunit  38.31 
 
 		 434 aa  91.3  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0899  restriction endonuclease S subunit  35.5 
 
 		 396 aa  90.9  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000681459  hitchhiker  0.00000169581 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4163  restriction modification system DNA specificity subunit  33.8 
 
 		 405 aa  88.2  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.864984  normal  0.0584456 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2665  type I restriction-modification system specificity subunit  25.07 
 
 		 446 aa  87.4  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0650221  normal  0.332066 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3550  restriction modification system DNA specificity subunit  28.36 
 
 		 417 aa  87.8  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257959  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2237  restriction modification system DNA specificity subunit  26.99 
 
 		 412 aa  87.8  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0221  hypothetical protein  40.78 
 
 		 112 aa  87.4  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7555  Restriction endonuclease S subunits-like protein  25.24 
 
 		 402 aa  86.7  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0086  restriction modification system DNA specificity protein  30.7 
 
 		 538 aa  86.7  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2364  restriction modification system DNA specificity subunit  22.19 
 
 		 413 aa  86.7  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.188022 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0549  restriction modification system DNA specificity subunit  26.14 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0149  restriction modification system DNA specificity subunit  24.38 
 
 		 400 aa  85.1  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0900  restriction modification system DNA specificity domain protein  35.19 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.963501 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2722  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.57 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1021  nucleotidyltransferase  45.83 
 
 		 99 aa  83.6  0.000000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.598559  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20210  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.41 
 
 		 565 aa  83.2  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  24.06 
 
 		 456 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0005  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.23 
 
 		 378 aa  83.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.09 
 
 		 477 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4930  type I restriction enzyme StySJI specificity protein  30.81 
 
 		 469 aa  81.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  29.9 
 
 		 846 aa  81.3  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0918  putative nucleotidyltransferase  44.79 
 
 		 99 aa  80.9  0.00000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1091  restriction modification system DNA specificity domain protein  37.78 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17387  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1536  restriction modification system DNA specificity domain  33.53 
 
 		 364 aa  80.5  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1671  restriction modification system DNA specificity subunit  29.81 
 
 		 442 aa  79.3  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.517259  hitchhiker  0.00037426 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1536  hypothetical protein  23.04 
 
 		 380 aa  79.3  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00344436  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1176  restriction modification system DNA specificity subunit  30.17 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.882603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1911  hypothetical protein  20.46 
 
 		 453 aa  78.2  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.568524  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3540  restriction modification system DNA specificity subunit  30.94 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  20.81 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0268  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 		 100 aa  77.4  0.0000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1221  restriction modification system DNA specificity subunit  32.1 
 
 		 463 aa  76.3  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0448  restriction modification system DNA specificity domain  24.8 
 
 		 435 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000159098 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0504  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.18 
 
 		 408 aa  75.1  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  30 
 
 		 834 aa  75.1  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5276  restriction modification system DNA specificity subunit  23.45 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2423  restriction modification system DNA specificity subunit  29.75 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.57431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.67 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3227  restriction modification system DNA specificity subunit  34.67 
 
 		 575 aa  74.3  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1710  restriction modification system DNA specificity subunit  22.32 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2935  DNA polymerase beta subunit  44.44 
 
 		 115 aa  73.6  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2097  restriction modification system DNA specificity subunit  34.04 
 
 		 393 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4917  restriction modification system DNA specificity subunit  38.71 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.544675 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2690  hypothetical protein  34.21 
 
 		 649 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1122  restriction endonuclease S subunits-like  27.04 
 
 		 428 aa  72  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.878738  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0132  restriction modification system DNA specificity subunit  24.74 
 
 		 427 aa  72  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47299 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2792  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.7 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1170  restriction modification system DNA specificity subunit  35.51 
 
 		 402 aa  71.2  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.249165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>