194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2665 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2665  type I restriction-modification system specificity subunit  100 
 
 		 446 aa  902    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0650221  normal  0.332066 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2328  type I restriction-modification system specificity subunit  40.63 
 
 		 404 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3525  restriction modification system DNA specificity subunit  35 
 
 		 420 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2237  restriction modification system DNA specificity subunit  33.89 
 
 		 412 aa  202  7e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2467  restriction modification system DNA specificity domain  30.18 
 
 		 438 aa  171  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1307  restriction modification system DNA specificity subunit  36.2 
 
 		 285 aa  161  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1220  restriction modification system DNA specificity domain protein  35.14 
 
 		 620 aa  161  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0005  restriction modification system DNA specificity domain protein  37.26 
 
 		 378 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1710  restriction modification system DNA specificity subunit  33.9 
 
 		 414 aa  146  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2909  restriction modification system DNA specificity subunit  27.44 
 
 		 440 aa  143  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1643  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.74 
 
 		 428 aa  140  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3499  restriction modification system DNA specificity subunit  31.94 
 
 		 405 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.082109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1941  restriction endonuclease S subunits-like  24.66 
 
 		 451 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0182546  normal  0.0682578 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0333  restriction modification system DNA specificity subunit  34.47 
 
 		 371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2364  restriction modification system DNA specificity subunit  29.56 
 
 		 413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.188022 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.39 
 
 		 477 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4348  restriction modification system DNA specificity subunit  29.65 
 
 		 363 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.43 
 
 		 429 aa  113  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0023  type I restriction-modification system specificity subunit  33.17 
 
 		 411 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0031  type I restriction-modification system specificity subunit  33.17 
 
 		 411 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404176  normal  0.032892 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2508  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  25.18 
 
 		 401 aa  106  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.700746 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  27.93 
 
 		 432 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0637  restriction modification system DNA specificity domain  25.29 
 
 		 422 aa  103  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0287  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  42.11 
 
 		 471 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3297  restriction modification system DNA specificity subunit  27.25 
 
 		 430 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489204 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2875  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.61 
 
 		 390 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3144  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.33 
 
 		 412 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4472  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.75 
 
 		 428 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0878  type I restriction modification system methylase  22.99 
 
 		 424 aa  93.6  6e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.707045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7555  Restriction endonuclease S subunits-like protein  27.47 
 
 		 402 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  31.5 
 
 		 435 aa  90.9  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3272  type I restriction-modification system specificity subunit  35.03 
 
 		 492 aa  90.1  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425878  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  25.07 
 
 		 549 aa  87.4  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1360  restriction modification system DNA specificity subunit  23.57 
 
 		 453 aa  86.7  7e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  24.94 
 
 		 447 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3180  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.76 
 
 		 390 aa  85.1  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0041  restriction modification system DNA specificity subunit  28.8 
 
 		 397 aa  85.1  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2742  type I restriction-modification system specificity determinant  25.3 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971087  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  24.56 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  22.07 
 
 		 425 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2452  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  25.73 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.587532 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  25.26 
 
 		 439 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2285  hypothetical protein  25.08 
 
 		 425 aa  82.4  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0313194  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4761  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  23.91 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1103  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.46 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0442932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3129  restriction modification system DNA specificity subunit  22.97 
 
 		 416 aa  79.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.343622  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  23.24 
 
 		 425 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0006  restriction modification system, type I  24.14 
 
 		 412 aa  76.6  0.0000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0076  type I restriction-modification system subunit S  25.17 
 
 		 464 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0102  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.52 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0845  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.17 
 
 		 495 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31571e-19 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0836  type I restriction-modification system S subunit  26.04 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  23.38 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2791  type I restriction-modification system, S subunit  27.15 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2415  restriction modification system DNA specificity domain  27.15 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.589349  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1492  restriction modification system DNA specificity subunit  26.63 
 
 		 479 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2016  restriction modification system DNA specificity subunit  26.04 
 
 		 417 aa  72  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0839323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1808  restriction modification system DNA specificity subunit  24.36 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.300643  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1122  restriction endonuclease S subunits-like  24.06 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.878738  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4241  restriction modification system DNA specificity subunit  23.71 
 
 		 411 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.491612  hitchhiker  0.00127278 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0416  type I restriction-modification system S subunit  23.66 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0531711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3757  restriction modification system S subunit  22.58 
 
 		 436 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.386531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1015  hypothetical protein  24.65 
 
 		 477 aa  70.1  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2277  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.76 
 
 		 433 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  hitchhiker  0.00000677276 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3382  restriction modification system DNA specificity subunit  23.22 
 
 		 485 aa  68.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1536  hypothetical protein  24.02 
 
 		 380 aa  68.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00344436  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  30.6 
 
 		 390 aa  67.8  0.0000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000269296  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3443  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.35 
 
 		 445 aa  67  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4714  restriction modification system DNA specificity domain  21.91 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.232226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0549  restriction modification system DNA specificity subunit  25.23 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03610  type I site-specific deoxyribonuclease  23.19 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1087  type I restriction-modification system, S subunit  22.66 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247708  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4007  restriction endonuclease S subunits-like  22.87 
 
 		 412 aa  65.5  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4778  restriction modification system DNA specificity subunit  23.43 
 
 		 415 aa  65.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3199  restriction modification system DNA specificity subunit  25.16 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0268  restriction endonuclease S subunits  26.83 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2033  N-6 DNA methylase  23.61 
 
 		 775 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599209  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2249  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.04 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  25.96 
 
 		 456 aa  63.5  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1452  restriction modification system DNA specificity domain  23.86 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0462219  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0605  restriction modification system DNA specificity subunit  25.84 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1032  restriction modification system DNA specificity subunit  26.84 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41908  normal  0.322454 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3914  Restriction endonuclease S subunit  24.43 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1160  restriction modification system DNA specificity subunit  30.09 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0944  restriction modification system DNA specificity subunit  26.09 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000962716  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1860  type I restriction enzyme, S subunit  21.92 
 
 		 474 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0504746  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0223  putative HsdS protein  23.46 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4012  restriction modification system DNA specificity subunit  22.04 
 
 		 436 aa  60.5  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.848484  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2606  restriction modification system DNA specificity subunit  21.71 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3989  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.14 
 
 		 456 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0737122 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.16 
 
 		 422 aa  59.7  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  24.59 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0277  hypothetical protein  21.74 
 
 		 474 aa  58.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0233  restriction modification system DNA specificity subunit  23.83 
 
 		 461 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0967889  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3537  putative type I restriction-modification system, S subunit  23.8 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1219  restriction modification system DNA specificity domain  24.3 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3132  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.14 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.474681 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5244  restriction modification system DNA specificity domain  24.8 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  25.6 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1778  type I restriction-modification system specificity subunit  22.55 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.926504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>