167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1360 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1360  restriction modification system DNA specificity subunit  100 
 
 
453 aa  935    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0878  type I restriction modification system methylase  40.75 
 
 
424 aa  296  4e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.707045 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3081  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.77 
 
 
415 aa  239  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  32.06 
 
 
447 aa  201  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4622  Restriction endonuclease S subunits-like protein  43.23 
 
 
411 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.156513 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0836  type I restriction-modification system S subunit  29.16 
 
 
416 aa  166  8e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3297  restriction modification system DNA specificity subunit  30.11 
 
 
430 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000489204 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3757  restriction modification system S subunit  26.44 
 
 
436 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.386531  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2452  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  27.19 
 
 
419 aa  150  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.587532 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1941  restriction endonuclease S subunits-like  27.85 
 
 
451 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0182546  normal  0.0682578 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2548  restriction modification system DNA specificity domain  40.45 
 
 
405 aa  140  6e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0006  restriction modification system, type I  26.9 
 
 
412 aa  137  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3382  restriction modification system DNA specificity subunit  25.61 
 
 
485 aa  133  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4042  restriction modification system DNA specificity subunit  42.26 
 
 
428 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4778  restriction modification system DNA specificity subunit  27.85 
 
 
415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16943  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2924  restriction endonuclease S subunit  42.03 
 
 
394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2909  restriction modification system DNA specificity subunit  26.97 
 
 
440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2016  restriction modification system DNA specificity subunit  31.44 
 
 
417 aa  128  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0839323  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1808  restriction modification system DNA specificity subunit  26.37 
 
 
483 aa  127  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.300643  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1643  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.13 
 
 
428 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  31.86 
 
 
549 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4007  restriction endonuclease S subunits-like  26.04 
 
 
412 aa  121  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2791  type I restriction-modification system, S subunit  26.65 
 
 
418 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2415  restriction modification system DNA specificity domain  26.65 
 
 
418 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.589349  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2033  N-6 DNA methylase  29.7 
 
 
775 aa  120  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599209  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2467  restriction modification system DNA specificity domain  25.28 
 
 
438 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4241  restriction modification system DNA specificity subunit  26.41 
 
 
411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.491612  hitchhiker  0.00127278 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1087  type I restriction-modification system, S subunit  27.51 
 
 
422 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247708  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2742  type I restriction-modification system specificity determinant  28.02 
 
 
398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971087  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0223  putative HsdS protein  23.63 
 
 
438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  35 
 
 
456 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0745  restriction modification system DNA specificity domain  34.12 
 
 
411 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.189202  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2285  hypothetical protein  29.57 
 
 
425 aa  103  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0313194  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0333  restriction modification system DNA specificity subunit  26.35 
 
 
371 aa  103  7e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0287  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  25.12 
 
 
471 aa  102  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2180  restriction modification system DNA specificity subunit  23.92 
 
 
405 aa  100  7e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  25.88 
 
 
432 aa  99.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3525  restriction modification system DNA specificity subunit  24.95 
 
 
420 aa  98.2  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3144  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.4 
 
 
412 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527027  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.59 
 
 
429 aa  97.4  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0041  restriction modification system DNA specificity subunit  25.92 
 
 
397 aa  97.1  6e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3129  restriction modification system DNA specificity subunit  22.13 
 
 
416 aa  95.1  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.343622  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3914  Restriction endonuclease S subunit  31.47 
 
 
405 aa  95.5  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0637  restriction modification system DNA specificity domain  22.7 
 
 
422 aa  94.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4472  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.77 
 
 
428 aa  90.5  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2249  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.82 
 
 
384 aa  89.7  9e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0023  type I restriction-modification system specificity subunit  27.57 
 
 
411 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0031  type I restriction-modification system specificity subunit  27.57 
 
 
411 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404176  normal  0.032892 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2665  type I restriction-modification system specificity subunit  23.57 
 
 
446 aa  86.7  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0650221  normal  0.332066 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1122  restriction endonuclease S subunits-like  26.38 
 
 
428 aa  86.3  9e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.878738  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  31.05 
 
 
429 aa  84.7  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2652  Restriction endonuclease S subunits-like protein  28.5 
 
 
413 aa  84.3  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.252104  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3499  restriction modification system DNA specificity subunit  29.78 
 
 
405 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.082109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1158  restriction modification system DNA specificity subunit  23.8 
 
 
454 aa  80.9  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000117149  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2508  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  33.14 
 
 
401 aa  81.3  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.700746 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2097  restriction modification system DNA specificity subunit  27.36 
 
 
393 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2328  type I restriction-modification system specificity subunit  29.35 
 
 
404 aa  76.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0005  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.21 
 
 
378 aa  76.6  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1710  restriction modification system DNA specificity subunit  22.42 
 
 
414 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2689  restriction modification system DNA specificity subunit  24.62 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.841682  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2910  putative type I restriction-modification system, S subunit  33.5 
 
 
373 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2421  restriction modification system DNA specificity subunit  30.61 
 
 
402 aa  72.8  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1805  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.23 
 
 
423 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.745604  normal  0.535567 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0605  restriction modification system DNA specificity subunit  25.51 
 
 
453 aa  70.9  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  29.65 
 
 
390 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000269296  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1502  restriction modification system DNA specificity domain  26.87 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1220  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.65 
 
 
620 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1791  restriction modification system DNA specificity subunit  21.78 
 
 
419 aa  68.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365715  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  28.5 
 
 
456 aa  67.4  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  22.69 
 
 
426 aa  66.6  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1536  hypothetical protein  32.43 
 
 
380 aa  66.6  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00344436  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  27.09 
 
 
435 aa  65.9  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.72 
 
 
422 aa  66.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3440  N-6 DNA methylase  26.43 
 
 
629 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000836739  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2237  restriction modification system DNA specificity subunit  25.52 
 
 
412 aa  64.7  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1218  restriction modification system DNA specificity subunit  28.14 
 
 
351 aa  64.7  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.67755  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2364  restriction modification system DNA specificity subunit  22.27 
 
 
413 aa  64.3  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.188022 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0829  type I restriction-modification system, S subunit  27.36 
 
 
409 aa  64.3  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232689  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1219  restriction modification system DNA specificity domain  26.47 
 
 
412 aa  63.9  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0508  restriction modification system DNA specificity subunit  23.26 
 
 
511 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0549  restriction modification system DNA specificity subunit  23.3 
 
 
385 aa  63.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  25.64 
 
 
433 aa  63.2  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7555  Restriction endonuclease S subunits-like protein  24.86 
 
 
402 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  25.6 
 
 
425 aa  62.4  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1061  putative type I restriction-modification system, S subunit  27.17 
 
 
528 aa  62  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0102  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.11 
 
 
442 aa  62  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1911  hypothetical protein  26.51 
 
 
453 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.568524  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4264  type I restriction-modification system, S subunit  27.27 
 
 
495 aa  60.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1260  restriction modification system DNA specificity subunit  30.08 
 
 
385 aa  60.5  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2926  restriction modification system DNA specificity subunit  22.6 
 
 
434 aa  60.1  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3272  type I restriction-modification system specificity subunit  29.14 
 
 
492 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425878  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1144  restriction modification system DNA specificity subunit  27.21 
 
 
473 aa  59.7  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1204  restriction modification system DNA specificity subunit  24.64 
 
 
547 aa  58.5  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340549  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4189  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.29 
 
 
401 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  23.68 
 
 
438 aa  57.8  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3989  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.22 
 
 
456 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0737122 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3425  restriction endonuclease S subunits-like  27.22 
 
 
390 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835151  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4348  restriction modification system DNA specificity subunit  22.14 
 
 
363 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0564  restriction modification system DNA specificity subunit  24.68 
 
 
415 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00017151  decreased coverage  6.20122e-17 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0873  restriction modification system DNA specificity subunit  23.96 
 
 
375 aa  57.4  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>