204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0016 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  100 
 
 
432 aa  874    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  38.85 
 
 
429 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0041  restriction modification system DNA specificity subunit  40.62 
 
 
397 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2452  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  43.01 
 
 
419 aa  230  3e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.587532 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  36.58 
 
 
447 aa  225  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2909  restriction modification system DNA specificity subunit  31.57 
 
 
440 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0287  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  31.28 
 
 
471 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1103  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.71 
 
 
400 aa  197  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0442932  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3129  restriction modification system DNA specificity subunit  31.22 
 
 
416 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.343622  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  30.46 
 
 
549 aa  190  5e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3525  restriction modification system DNA specificity subunit  34.78 
 
 
420 aa  189  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0637  restriction modification system DNA specificity domain  32.49 
 
 
422 aa  186  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1220  restriction modification system DNA specificity domain protein  52.63 
 
 
620 aa  184  4.0000000000000006e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  27.52 
 
 
456 aa  171  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1219  restriction modification system DNA specificity domain  29.55 
 
 
412 aa  160  4e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1307  restriction modification system DNA specificity subunit  34.47 
 
 
285 aa  157  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2722  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.21 
 
 
385 aa  146  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  32.17 
 
 
429 aa  140  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3144  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.72 
 
 
412 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527027  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0508  restriction modification system DNA specificity subunit  38.28 
 
 
511 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20210  restriction modification system DNA specificity domain protein  40.7 
 
 
565 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266778  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1643  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.04 
 
 
428 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1911  hypothetical protein  28.3 
 
 
453 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.568524  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0842  type I restriction-modification enzyme, S subunit, putative  35.92 
 
 
476 aa  131  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0871  restriction modification system DNA specificity subunit  42.39 
 
 
211 aa  129  7.000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  25 
 
 
426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0959  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.32 
 
 
442 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0829  type I restriction-modification system, S subunit  24.68 
 
 
409 aa  123  6e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232689  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.52 
 
 
462 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3132  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.12 
 
 
424 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.474681 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1710  restriction modification system DNA specificity subunit  24.21 
 
 
414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.86 
 
 
457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4163  restriction modification system DNA specificity subunit  25.9 
 
 
405 aa  114  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.864984  normal  0.0584456 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2791  type I restriction-modification system, S subunit  25.49 
 
 
418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2415  restriction modification system DNA specificity domain  25.49 
 
 
418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.589349  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7555  Restriction endonuclease S subunits-like protein  25.35 
 
 
402 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2364  restriction modification system DNA specificity subunit  29.92 
 
 
413 aa  113  7.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.188022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1978  restriction modification system DNA specificity subunit  37.2 
 
 
616 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17660  restriction endonuclease S subunit  27.55 
 
 
416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  27.39 
 
 
425 aa  111  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2285  hypothetical protein  26.06 
 
 
425 aa  111  3e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0313194  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.82 
 
 
427 aa  110  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4472  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.54 
 
 
428 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  23.44 
 
 
456 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0448  restriction modification system DNA specificity domain  34.64 
 
 
435 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000159098 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1095  hypothetical protein  27.9 
 
 
401 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4778  restriction modification system DNA specificity subunit  27.09 
 
 
415 aa  109  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16943  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4241  restriction modification system DNA specificity subunit  25.18 
 
 
411 aa  106  8e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.491612  hitchhiker  0.00127278 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1122  restriction endonuclease S subunits-like  26.4 
 
 
428 aa  105  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.878738  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0836  type I restriction-modification system S subunit  25.44 
 
 
416 aa  104  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2665  type I restriction-modification system specificity subunit  27.93 
 
 
446 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0650221  normal  0.332066 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0878  type I restriction modification system methylase  25.66 
 
 
424 aa  104  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.707045 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1941  restriction endonuclease S subunits-like  22.04 
 
 
451 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0182546  normal  0.0682578 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0132  restriction modification system DNA specificity subunit  23.54 
 
 
427 aa  102  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.47299 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5276  restriction modification system DNA specificity subunit  30.52 
 
 
418 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3382  restriction modification system DNA specificity subunit  25.49 
 
 
485 aa  101  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1095  restriction modification system DNA specificity subunit  32.88 
 
 
450 aa  101  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1170  restriction modification system DNA specificity subunit  35.54 
 
 
402 aa  100  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.249165  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1360  restriction modification system DNA specificity subunit  25.88 
 
 
453 aa  99.4  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4007  restriction endonuclease S subunits-like  22.61 
 
 
412 aa  99  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1536  hypothetical protein  27.71 
 
 
380 aa  97.8  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00344436  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3550  restriction modification system DNA specificity subunit  27.36 
 
 
417 aa  95.5  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257959  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0549  restriction modification system DNA specificity subunit  27.46 
 
 
385 aa  96.3  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  38.46 
 
 
834 aa  95.5  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.54 
 
 
422 aa  94.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2016  restriction modification system DNA specificity subunit  28.12 
 
 
417 aa  94.4  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0839323  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3499  restriction modification system DNA specificity subunit  26.85 
 
 
405 aa  94  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.082109 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  32.93 
 
 
846 aa  93.6  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3757  restriction modification system S subunit  25.61 
 
 
436 aa  92.8  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.386531  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1087  type I restriction-modification system, S subunit  24.67 
 
 
422 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247708  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3540  restriction modification system DNA specificity subunit  31.64 
 
 
387 aa  92  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3297  restriction modification system DNA specificity subunit  22.33 
 
 
430 aa  92  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000489204 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  23.73 
 
 
438 aa  91.3  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1195  type II restriction-modification enzyme  31.94 
 
 
1343 aa  90.9  4e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.26 
 
 
477 aa  90.5  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003235  type I restriction-modification system specificity subunit S  29.21 
 
 
437 aa  90.1  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0005  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.86 
 
 
378 aa  89.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2097  restriction modification system DNA specificity subunit  27.78 
 
 
393 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2467  restriction modification system DNA specificity domain  25.43 
 
 
438 aa  87  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4042  restriction modification system DNA specificity subunit  24.69 
 
 
428 aa  87  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3953  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.55 
 
 
413 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0504  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.89 
 
 
408 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1808  restriction modification system DNA specificity subunit  25.91 
 
 
483 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.300643  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3089  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.03 
 
 
520 aa  84.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0193  type I restriction-modification system specificity determinant  26.88 
 
 
416 aa  84.3  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4454  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.23 
 
 
406 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.859615  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0223  putative HsdS protein  23.25 
 
 
438 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0414  restriction modification system DNA specificity subunit  23.31 
 
 
439 aa  84.3  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.405933  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0006  restriction modification system, type I  25.36 
 
 
412 aa  82.8  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  24.55 
 
 
439 aa  82  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3109  restriction modification system DNA specificity subunit  25.15 
 
 
426 aa  82.4  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0035  hypothetical protein  26.47 
 
 
400 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2673  restriction modification system DNA specificity subunit  34.67 
 
 
415 aa  79.7  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.574489 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0368  type I restriction-modification system, S subunit, putative  28.63 
 
 
562 aa  78.6  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1894  restriction modification system DNA specificity subunit  24.82 
 
 
409 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.850685  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1176  restriction modification system DNA specificity subunit  25.23 
 
 
408 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.882603  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4821  type I restriction-modification system, endonuclease S subunit  29.82 
 
 
382 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2237  restriction modification system DNA specificity subunit  26.55 
 
 
412 aa  79  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1859  restriction modification system DNA specificity subunit  24.82 
 
 
409 aa  78.2  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.777891  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  26.34 
 
 
422 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>