223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1496 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  100 
 
 
427 aa  870    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  45.41 
 
 
456 aa  340  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0959  restriction modification system DNA specificity domain protein  48.14 
 
 
442 aa  295  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0414  restriction modification system DNA specificity subunit  47.31 
 
 
439 aa  250  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.405933  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0076  type I restriction-modification system subunit S  36.43 
 
 
464 aa  239  8e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3777  restriction endonuclease S subunits-like protein  33.49 
 
 
419 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3850  restriction endonuclease S subunits-like protein  33.49 
 
 
419 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3940  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.63 
 
 
453 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0487  restriction modification system DNA specificity subunit  34.09 
 
 
438 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  0.0187002 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2869  type I restriction-modification system, S subunit  44.57 
 
 
448 aa  157  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0947716  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1064  type I restriction-modification  31.25 
 
 
453 aa  156  5.0000000000000005e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000898872  normal  0.027841 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  27.46 
 
 
422 aa  149  8e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0599  type I restriction-modification system, S subunit  31.51 
 
 
458 aa  146  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3989  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.21 
 
 
456 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0737122 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2226  restriction modification system DNA specificity subunit  31.82 
 
 
451 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.890862  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0193  type I restriction-modification system specificity determinant  31.28 
 
 
416 aa  139  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0233  restriction modification system DNA specificity subunit  32.63 
 
 
461 aa  137  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0967889  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0750  putative type I restriction-modification system  33.23 
 
 
436 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.769779  normal  0.272821 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003235  type I restriction-modification system specificity subunit S  31.29 
 
 
437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3358  restriction modification system DNA specificity subunit  30.54 
 
 
429 aa  133  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0521612  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1791  restriction modification system DNA specificity subunit  29.58 
 
 
419 aa  133  6.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365715  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1153  restriction modification system DNA specificity subunit  35.34 
 
 
429 aa  132  9e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0132  restriction modification system DNA specificity subunit  30.77 
 
 
427 aa  129  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.47299 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0416  type I restriction-modification system S subunit  31.82 
 
 
457 aa  129  8.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0531711 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2607  restriction modification system DNA specificity subunit  29.05 
 
 
462 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2606  restriction modification system DNA specificity subunit  29.65 
 
 
429 aa  126  6e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2688  restriction endonuclease S subunits-like  31.44 
 
 
487 aa  123  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.165356  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1015  hypothetical protein  28.27 
 
 
477 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.67 
 
 
462 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1911  hypothetical protein  24.57 
 
 
453 aa  120  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.568524  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0640  restriction modification system DNA specificity subunit  27.74 
 
 
447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1860  type I restriction enzyme, S subunit  28.35 
 
 
474 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0504746  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  25.71 
 
 
456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6260  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.73 
 
 
441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0277  hypothetical protein  31.92 
 
 
474 aa  111  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4761  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  27.53 
 
 
428 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01116  hypothetical protein  31.4 
 
 
400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  26.82 
 
 
432 aa  110  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.4 
 
 
457 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1481  restriction endonuclease S subunits-like protein  26.37 
 
 
443 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3653  type I restriction enzyme StySPI specificity protein  23.82 
 
 
460 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.234587  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1327  restriction modification system DNA specificity subunit  30.82 
 
 
431 aa  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.280518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4472  restriction modification system DNA specificity subunit  29.57 
 
 
415 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.270866  normal  0.0902542 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2682  putative restriction endonuclease S subunit  31.29 
 
 
400 aa  104  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.845062  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.74 
 
 
429 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3550  restriction modification system DNA specificity subunit  26.24 
 
 
417 aa  103  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257959  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0796  restriction modification system DNA specificity domain  24.92 
 
 
441 aa  100  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343889 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0842  type I restriction-modification enzyme, S subunit, putative  29.27 
 
 
476 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2268  putative type I restriction enzyme, S subunit  29.41 
 
 
457 aa  99.4  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2200  type I restriction-modification system specificity subunit  29.25 
 
 
461 aa  98.2  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.844306  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  33.73 
 
 
429 aa  97.8  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1170  restriction modification system DNA specificity subunit  30.41 
 
 
402 aa  97.8  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.249165  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1366  hypothetical protein  27.51 
 
 
462 aa  96.7  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3443  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.58 
 
 
445 aa  96.3  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  27.13 
 
 
549 aa  96.3  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2097  restriction modification system DNA specificity subunit  31.18 
 
 
393 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0277  restriction modification system DNA specificity subunit  25.2 
 
 
413 aa  92.8  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  22.3 
 
 
438 aa  91.7  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2939  type I restriction-modification system  27.84 
 
 
432 aa  92  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0304782 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0658  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.84 
 
 
473 aa  90.9  4e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3571  hypothetical protein  27.05 
 
 
458 aa  90.1  7e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1221  restriction modification system DNA specificity subunit  22.85 
 
 
463 aa  89  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0504  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.55 
 
 
408 aa  87.4  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19070  hypothetical protein  26.96 
 
 
425 aa  85.9  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0871344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1783  restriction modification system DNA specificity subunit  28.57 
 
 
448 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20210  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.8 
 
 
565 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266778  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  24.13 
 
 
429 aa  84.3  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0508  restriction modification system DNA specificity subunit  26.73 
 
 
511 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1103  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.2 
 
 
400 aa  83.6  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0442932  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1095  restriction modification system DNA specificity subunit  29.7 
 
 
450 aa  83.2  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2909  restriction modification system DNA specificity subunit  23.69 
 
 
440 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3129  restriction modification system DNA specificity subunit  25.28 
 
 
416 aa  82  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.343622  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13680  hypothetical protein  28.36 
 
 
354 aa  81.6  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.247083  normal  0.424884 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1307  restriction modification system DNA specificity subunit  26.85 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3540  restriction modification system DNA specificity subunit  29.34 
 
 
387 aa  80.5  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0149  restriction modification system DNA specificity subunit  23.2 
 
 
400 aa  80.5  0.00000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.58 
 
 
477 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0287  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  29.56 
 
 
471 aa  79.7  0.00000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  31.14 
 
 
834 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2176  restriction modification system DNA specificity subunit  25.34 
 
 
444 aa  78.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.962317  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5276  restriction modification system DNA specificity subunit  23.08 
 
 
418 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1516  restriction modification system DNA specificity subunit  26.91 
 
 
395 aa  77.8  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.205219 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0829  type I restriction-modification system, S subunit  24.75 
 
 
409 aa  77.4  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232689  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  24.73 
 
 
425 aa  76.6  0.0000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  26.15 
 
 
426 aa  76.6  0.0000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3525  restriction modification system DNA specificity subunit  21.82 
 
 
420 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1095  hypothetical protein  26.18 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1219  restriction modification system DNA specificity domain  24.5 
 
 
412 aa  74.7  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0842  hypothetical protein  23.71 
 
 
446 aa  74.7  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.229597  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  23.16 
 
 
447 aa  74.3  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3109  restriction modification system DNA specificity subunit  29.29 
 
 
426 aa  74.3  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4163  restriction modification system DNA specificity subunit  24.13 
 
 
405 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.864984  normal  0.0584456 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3089  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.19 
 
 
520 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2698  restriction modification system DNA specificity subunit  24.02 
 
 
267 aa  72.8  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0854775  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0637  restriction modification system DNA specificity domain  21.3 
 
 
422 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1978  restriction modification system DNA specificity subunit  27.53 
 
 
616 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1027  restriction modification system DNA specificity subunit  28.14 
 
 
420 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3132  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.55 
 
 
424 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.474681 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  25.18 
 
 
435 aa  71.6  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0605  restriction modification system DNA specificity subunit  21.71 
 
 
453 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>