243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1911 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1911  hypothetical protein  100 
 
 
453 aa  919    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.568524  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  24.42 
 
 
456 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  54.01 
 
 
390 aa  140  3e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000269296  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  28.3 
 
 
432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20210  restriction modification system DNA specificity domain protein  37.38 
 
 
565 aa  129  9.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266778  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0842  type I restriction-modification enzyme, S subunit, putative  32.5 
 
 
476 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  30.19 
 
 
429 aa  123  6e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2607  restriction modification system DNA specificity subunit  35.34 
 
 
462 aa  123  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0508  restriction modification system DNA specificity subunit  35.32 
 
 
511 aa  122  9e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  25.83 
 
 
447 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.57 
 
 
427 aa  120  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  28.35 
 
 
422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.01 
 
 
429 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0959  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.87 
 
 
442 aa  114  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1095  restriction modification system DNA specificity subunit  32.78 
 
 
450 aa  113  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3989  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.26 
 
 
456 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0737122 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2097  restriction modification system DNA specificity subunit  32.51 
 
 
393 aa  110  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1890  type I restriction-modification system, S subunit  22 
 
 
416 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0149  restriction modification system DNA specificity subunit  25.93 
 
 
400 aa  107  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3653  type I restriction enzyme StySPI specificity protein  22.95 
 
 
460 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.234587  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  36.6 
 
 
834 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0614  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.74 
 
 
401 aa  102  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0287  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  31.05 
 
 
471 aa  102  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2652  Restriction endonuclease S subunits-like protein  31.46 
 
 
413 aa  100  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.252104  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4163  restriction modification system DNA specificity subunit  26.9 
 
 
405 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.864984  normal  0.0584456 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0605  restriction modification system DNA specificity subunit  24.89 
 
 
453 aa  96.3  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3940  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.04 
 
 
453 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  23.82 
 
 
438 aa  95.1  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0504  restriction modification system DNA specificity domain protein  25 
 
 
408 aa  94  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3914  Restriction endonuclease S subunit  24.49 
 
 
405 aa  94  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2421  restriction modification system DNA specificity subunit  25.45 
 
 
402 aa  93.6  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2722  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.81 
 
 
385 aa  93.2  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0227  restriction modification system DNA specificity domain  23.79 
 
 
395 aa  92  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2909  restriction modification system DNA specificity subunit  22.25 
 
 
440 aa  92  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3129  restriction modification system DNA specificity subunit  23.77 
 
 
416 aa  89  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.343622  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3540  restriction modification system DNA specificity subunit  30.89 
 
 
387 aa  88.6  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1576  type I restriction-modification system, S subunit  24.89 
 
 
399 aa  87.8  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.200835  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1103  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.83 
 
 
400 aa  87.4  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0442932  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.81 
 
 
457 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0132  restriction modification system DNA specificity subunit  24.63 
 
 
427 aa  86.3  9e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.47299 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3525  restriction modification system DNA specificity subunit  24.35 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3272  type I restriction-modification system specificity subunit  23.89 
 
 
492 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425878  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0808  specificity determinant HsdS-like  28.08 
 
 
363 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.361917  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2249  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.94 
 
 
384 aa  84.3  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  23.38 
 
 
456 aa  83.6  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0414  restriction modification system DNA specificity subunit  23.13 
 
 
439 aa  83.6  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.405933  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0845  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.49 
 
 
495 aa  83.2  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31571e-19 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2452  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  26.89 
 
 
419 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.587532 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0871  restriction modification system DNA specificity subunit  29.6 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1170  restriction modification system DNA specificity subunit  25.23 
 
 
402 aa  80.5  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.249165  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  25 
 
 
477 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0637  restriction modification system DNA specificity domain  24.86 
 
 
422 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  25.36 
 
 
426 aa  78.6  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3550  restriction modification system DNA specificity subunit  23.98 
 
 
417 aa  78.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257959  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  20.46 
 
 
549 aa  78.2  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1015  hypothetical protein  22.01 
 
 
477 aa  77  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0829  type I restriction-modification system, S subunit  25.75 
 
 
409 aa  77  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232689  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3132  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.9 
 
 
424 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.474681 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1064  type I restriction-modification  22.62 
 
 
453 aa  76.6  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000898872  normal  0.027841 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1635  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.19 
 
 
419 aa  76.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0235263  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0599  type I restriction-modification system, S subunit  22.69 
 
 
458 aa  75.5  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3569  restriction modification system DNA specificity domain  29.11 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185936  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0658  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.07 
 
 
473 aa  74.3  0.000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1502  restriction modification system DNA specificity domain  27.81 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1220  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.05 
 
 
620 aa  73.9  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.95 
 
 
422 aa  73.6  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3199  restriction modification system DNA specificity subunit  22.75 
 
 
400 aa  73.6  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365834  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0448  restriction modification system DNA specificity domain  23.04 
 
 
435 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000159098 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0268  restriction endonuclease S subunits  25.24 
 
 
444 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277222  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5008  Restriction endonuclease S subunits-like protein  26.29 
 
 
465 aa  71.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  21.4 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2409  restriction modification system DNA specificity subunit  23.96 
 
 
442 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  28.37 
 
 
429 aa  70.1  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1452  restriction modification system DNA specificity domain  24.61 
 
 
392 aa  69.7  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0462219  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1991  restriction modification system DNA specificity domain  25.05 
 
 
490 aa  68.6  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120232  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2093  restriction modification system DNA specificity subunit  22.38 
 
 
477 aa  68.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4083  restriction modification system DNA specificity subunit  23.57 
 
 
409 aa  68.6  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1132  restriction modification system DNA specificity subunit  30.54 
 
 
556 aa  67.4  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.817215  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3443  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.3 
 
 
445 aa  67  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1027  restriction modification system DNA specificity subunit  24.24 
 
 
420 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2277  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.2 
 
 
433 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  hitchhiker  0.00000677276 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2548  restriction modification system DNA specificity domain  23.24 
 
 
405 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0223  putative HsdS protein  22.59 
 
 
438 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1778  type I restriction-modification system specificity subunit  22.89 
 
 
419 aa  64.7  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.926504  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1195  type II restriction-modification enzyme  24.07 
 
 
1343 aa  63.9  0.000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1307  restriction modification system DNA specificity subunit  24.3 
 
 
285 aa  63.9  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  29.14 
 
 
611 aa  63.9  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184495 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4462  restriction modification system DNA specificity subunit  23.24 
 
 
349 aa  63.9  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1131  restriction modification system DNA specificity subunit  29.19 
 
 
413 aa  63.5  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1672  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.73 
 
 
493 aa  63.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2939  type I restriction-modification system  23.74 
 
 
432 aa  63.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0304782 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1791  restriction modification system DNA specificity subunit  21.18 
 
 
419 aa  63.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365715  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0735  restriction modification system DNA specificity subunit  20.85 
 
 
392 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2028  restriction modification system DNA specificity subunit  26.09 
 
 
391 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000400239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7555  Restriction endonuclease S subunits-like protein  23.12 
 
 
402 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0487  restriction modification system DNA specificity subunit  22.74 
 
 
438 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  0.0187002 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2978  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.88 
 
 
194 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1122  restriction endonuclease S subunits-like  26.35 
 
 
428 aa  62  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.878738  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1060  restriction modification system DNA specificity subunit  22.87 
 
 
397 aa  62.4  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1015  restriction modification system DNA specificity subunit  23.5 
 
 
575 aa  62.4  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>