103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2978 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2978  restriction modification system DNA specificity domain protein  100 
 
 
194 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1635  restriction modification system DNA specificity domain protein  43.46 
 
 
419 aa  137  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0235263  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3132  restriction modification system DNA specificity domain protein  43.01 
 
 
424 aa  128  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.474681 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  42.2 
 
 
425 aa  111  7.000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1170  restriction modification system DNA specificity subunit  30.6 
 
 
402 aa  88.6  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.249165  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.21 
 
 
422 aa  87  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  29.32 
 
 
429 aa  85.5  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4778  restriction modification system DNA specificity subunit  28.14 
 
 
415 aa  84.7  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16943  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0448  restriction modification system DNA specificity domain  31.91 
 
 
435 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000159098 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0864  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.61 
 
 
413 aa  83.2  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  30.54 
 
 
456 aa  78.6  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4042  restriction modification system DNA specificity subunit  28.72 
 
 
428 aa  77  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.32 
 
 
457 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1307  restriction modification system DNA specificity subunit  30.46 
 
 
285 aa  73.6  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1176  restriction modification system DNA specificity subunit  31.11 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.882603  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  28.12 
 
 
426 aa  73.9  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0829  type I restriction-modification system, S subunit  28.12 
 
 
409 aa  73.6  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232689  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0508  restriction modification system DNA specificity subunit  34.75 
 
 
511 aa  72  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1015  restriction modification system DNA specificity subunit  30.37 
 
 
575 aa  72  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  33.06 
 
 
432 aa  72  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2397  restriction modification system DNA specificity domain  29.95 
 
 
417 aa  68.9  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3540  restriction modification system DNA specificity subunit  30.51 
 
 
387 aa  67  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2257  restriction endonuclease S subunits-like protein  36.17 
 
 
413 aa  66.6  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  29.05 
 
 
456 aa  65.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2097  restriction modification system DNA specificity subunit  27.84 
 
 
393 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3089  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.93 
 
 
520 aa  66.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3129  restriction modification system DNA specificity subunit  28.57 
 
 
416 aa  64.7  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.343622  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3525  restriction modification system DNA specificity subunit  31.37 
 
 
420 aa  63.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1911  hypothetical protein  24.88 
 
 
453 aa  62.4  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.568524  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3075  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.42 
 
 
388 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.40504  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2724  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.9 
 
 
409 aa  61.6  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20210  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.8 
 
 
565 aa  60.5  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266778  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0504  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.1 
 
 
408 aa  60.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  28.96 
 
 
438 aa  60.5  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1060  restriction modification system DNA specificity subunit  26.59 
 
 
397 aa  58.9  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2452  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  31.48 
 
 
419 aa  58.2  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.587532 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1027  restriction modification system DNA specificity subunit  28.68 
 
 
420 aa  57.4  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0287  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  25.54 
 
 
471 aa  57.4  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4083  restriction modification system DNA specificity subunit  26.6 
 
 
409 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0637  restriction modification system DNA specificity domain  29.29 
 
 
422 aa  57.4  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2722  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.92 
 
 
385 aa  57.8  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003235  type I restriction-modification system specificity subunit S  25.77 
 
 
437 aa  57.4  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3550  restriction modification system DNA specificity subunit  24.57 
 
 
417 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257959  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0842  type I restriction-modification enzyme, S subunit, putative  27.78 
 
 
476 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  23.67 
 
 
549 aa  55.8  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1219  restriction modification system DNA specificity domain  31.25 
 
 
412 aa  55.8  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2909  restriction modification system DNA specificity subunit  24.62 
 
 
440 aa  55.5  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1095  hypothetical protein  23.71 
 
 
401 aa  55.5  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2673  restriction modification system DNA specificity subunit  30.89 
 
 
415 aa  55.1  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.574489 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.78 
 
 
462 aa  55.1  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3953  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.33 
 
 
413 aa  54.7  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2423  restriction modification system DNA specificity subunit  28.67 
 
 
426 aa  54.3  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.57431  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.97 
 
 
477 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0871  restriction modification system DNA specificity subunit  26.88 
 
 
211 aa  53.5  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2194  restriction modification system DNA specificity subunit  32 
 
 
427 aa  53.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.122675  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2086  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.35 
 
 
417 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000683293 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.12 
 
 
427 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1220  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.08 
 
 
620 aa  53.1  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0414  restriction modification system DNA specificity subunit  24.55 
 
 
439 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.405933  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0198  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.34 
 
 
386 aa  52.8  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.719886  decreased coverage  0.000218103 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0951  restriction modification system DNA specificity subunit  33.06 
 
 
419 aa  52  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000406123 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.03 
 
 
429 aa  51.6  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  26.62 
 
 
447 aa  51.2  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1566  restriction modification system DNA specificity subunit  28.32 
 
 
403 aa  51.2  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0293394  unclonable  0.0000192379 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1978  restriction modification system DNA specificity subunit  24.86 
 
 
616 aa  51.2  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4394  restriction modification system DNA specificity subunit  32.46 
 
 
414 aa  49.7  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.536192  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0403  restriction modification system DNA specificity subunit  25.77 
 
 
402 aa  50.1  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0132  restriction modification system DNA specificity subunit  28.95 
 
 
427 aa  49.3  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.47299 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1710  restriction modification system DNA specificity subunit  26.78 
 
 
414 aa  49.3  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0564  restriction modification system DNA specificity subunit  32.48 
 
 
415 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00017151  decreased coverage  6.20122e-17 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3653  type I restriction enzyme StySPI specificity protein  26.45 
 
 
460 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.234587  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3109  restriction modification system DNA specificity subunit  27.49 
 
 
426 aa  48.9  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3425  restriction endonuclease S subunits-like  20.93 
 
 
390 aa  48.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835151  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0959  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.9 
 
 
442 aa  48.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0102  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.46 
 
 
442 aa  48.1  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1954  restriction modification system DNA specificity subunit  33.33 
 
 
406 aa  47.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2926  restriction modification system DNA specificity subunit  33.33 
 
 
434 aa  47.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4821  type I restriction-modification system, endonuclease S subunit  26.25 
 
 
382 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2415  restriction modification system DNA specificity domain  29.77 
 
 
418 aa  47.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.589349  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2791  type I restriction-modification system, S subunit  29.77 
 
 
418 aa  47.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1195  type II restriction-modification enzyme  29.75 
 
 
1343 aa  46.6  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0035  hypothetical protein  34.38 
 
 
400 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17660  restriction endonuclease S subunit  34.48 
 
 
416 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  29 
 
 
834 aa  46.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7555  Restriction endonuclease S subunits-like protein  23.28 
 
 
402 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0836  type I restriction-modification system S subunit  30.16 
 
 
416 aa  45.4  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1536  hypothetical protein  25.29 
 
 
380 aa  45.4  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00344436  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  24.23 
 
 
433 aa  45.4  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2598  type I restriction-modification enzyme, S subunit  25 
 
 
417 aa  45.1  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0133376  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0605  restriction modification system DNA specificity subunit  25 
 
 
453 aa  44.7  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0149  restriction modification system DNA specificity subunit  23.33 
 
 
400 aa  44.7  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5276  restriction modification system DNA specificity subunit  30.58 
 
 
418 aa  44.7  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1502  restriction modification system DNA specificity domain  24.86 
 
 
393 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0599  type I restriction-modification system, S subunit  30 
 
 
458 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1851  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  28.1 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  25.85 
 
 
429 aa  42.4  0.004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3599  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.34 
 
 
532 aa  42.4  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.743632  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0615  restriction modification system DNA specificity subunit  29.32 
 
 
417 aa  42.4  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0545068  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1890  type I restriction-modification system, S subunit  30.43 
 
 
416 aa  42  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1103  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.03 
 
 
400 aa  41.6  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0442932  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>