267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_04450 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  100 
 
 
422 aa  845    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  36.28 
 
 
433 aa  217  4e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2689  restriction modification system DNA specificity subunit  44.4 
 
 
290 aa  212  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.841682  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3132  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.92 
 
 
424 aa  195  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.474681 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1158  restriction modification system DNA specificity subunit  32.95 
 
 
454 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000117149  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0334  restriction modification system DNA specificity domain  45.36 
 
 
430 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.284396 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  35.43 
 
 
425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  27.42 
 
 
456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.44 
 
 
477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1805  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.47 
 
 
423 aa  143  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.745604  normal  0.535567 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2086  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.81 
 
 
417 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000683293 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  35.78 
 
 
429 aa  140  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2598  type I restriction-modification enzyme, S subunit  32.2 
 
 
417 aa  139  7e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0133376  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1671  restriction modification system DNA specificity subunit  29.8 
 
 
442 aa  139  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.517259  hitchhiker  0.00037426 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  34.78 
 
 
374 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4042  restriction modification system DNA specificity subunit  26.11 
 
 
428 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1170  restriction modification system DNA specificity subunit  28.88 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.249165  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  29.68 
 
 
425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  32.22 
 
 
429 aa  127  4.0000000000000003e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  26.01 
 
 
426 aa  126  8.000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2346  restriction modification system DNA specificity subunit  28.01 
 
 
392 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104931  normal  0.0105772 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  34.66 
 
 
439 aa  124  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  28.01 
 
 
435 aa  124  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0504  restriction modification system DNA specificity domain protein  43.23 
 
 
408 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2467  restriction modification system DNA specificity domain  28.62 
 
 
438 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0160  restriction modification system DNA specificity subunit  31.09 
 
 
399 aa  120  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3425  restriction endonuclease S subunits-like  36.18 
 
 
390 aa  119  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835151  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2924  restriction endonuclease S subunit  35.68 
 
 
394 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0829  type I restriction-modification system, S subunit  31.17 
 
 
409 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232689  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  26.27 
 
 
425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2792  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.04 
 
 
423 aa  114  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313089  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0988  type I restriction-modification system, S subunit  28.01 
 
 
401 aa  114  5e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2397  restriction modification system DNA specificity domain  26.54 
 
 
417 aa  113  7.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0368  type I restriction-modification system, S subunit, putative  26.49 
 
 
562 aa  112  9e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0842  type I restriction-modification enzyme, S subunit, putative  26.33 
 
 
476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1091  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.16 
 
 
444 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17387  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2673  restriction modification system DNA specificity subunit  26.59 
 
 
415 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.574489 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2097  restriction modification system DNA specificity subunit  23.27 
 
 
393 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0508  restriction modification system DNA specificity subunit  38.55 
 
 
511 aa  107  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1093  restriction modification system DNA specificity subunit  35.6 
 
 
394 aa  107  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1153  restriction modification system DNA specificity subunit  26.41 
 
 
429 aa  106  9e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2926  restriction modification system DNA specificity subunit  31.66 
 
 
434 aa  105  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0006  type I restriction-modification system, S subunit, EcoA family  27.41 
 
 
435 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0844  restriction endonuclease S subunits-like protein  30.34 
 
 
386 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0102  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.06 
 
 
442 aa  101  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3173  restriction modification system, type I  31.87 
 
 
394 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000000252983 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1027  restriction modification system DNA specificity subunit  37.34 
 
 
420 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0333  restriction modification system DNA specificity subunit  25.4 
 
 
371 aa  98.6  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.86 
 
 
457 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3985  restriction modification system DNA specificity subunit  34.62 
 
 
401 aa  97.8  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4348  restriction modification system DNA specificity subunit  32.95 
 
 
363 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2548  restriction modification system DNA specificity domain  28.71 
 
 
405 aa  97.1  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  27.74 
 
 
438 aa  96.3  9e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0615  restriction modification system DNA specificity subunit  24.6 
 
 
417 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0545068  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1260  restriction modification system DNA specificity subunit  22.75 
 
 
385 aa  94.4  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  23.54 
 
 
432 aa  94.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1516  restriction modification system DNA specificity subunit  25.97 
 
 
395 aa  94.4  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.205219 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  34.45 
 
 
422 aa  94  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2423  restriction modification system DNA specificity subunit  24.71 
 
 
426 aa  93.2  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.57431  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0403  restriction modification system DNA specificity subunit  28.17 
 
 
402 aa  92.8  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3550  restriction modification system DNA specificity subunit  32.31 
 
 
417 aa  91.3  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257959  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0132  restriction modification system DNA specificity subunit  32.18 
 
 
427 aa  91.3  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.47299 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0605  restriction modification system DNA specificity subunit  29.42 
 
 
453 aa  90.9  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0951  restriction modification system DNA specificity subunit  26.19 
 
 
419 aa  90.5  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000406123 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2257  restriction endonuclease S subunits-like protein  26.96 
 
 
413 aa  90.5  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3358  restriction modification system DNA specificity subunit  28.86 
 
 
429 aa  90.5  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0521612  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1060  restriction modification system DNA specificity subunit  24.87 
 
 
397 aa  90.1  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1791  restriction modification system DNA specificity subunit  25 
 
 
419 aa  89.4  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365715  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0249  restriction modification system DNA specificity subunit  25.75 
 
 
393 aa  88.2  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4880  putative type I restriction-modification system S subunit  33.54 
 
 
571 aa  87  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.960431 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3089  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.21 
 
 
520 aa  87  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4821  type I restriction-modification system, endonuclease S subunit  29.41 
 
 
382 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2978  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.21 
 
 
194 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3075  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.23 
 
 
388 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.40504  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3940  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.86 
 
 
453 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4454  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.7 
 
 
406 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.859615  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0098  restriction endonuclease S subunits  28.88 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0277  restriction modification system DNA specificity subunit  29.1 
 
 
413 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3607  restriction modification system, type I  27.72 
 
 
396 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  22.47 
 
 
846 aa  84.3  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0149  restriction modification system DNA specificity subunit  31.35 
 
 
400 aa  83.6  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2268  putative type I restriction enzyme, S subunit  24.62 
 
 
457 aa  83.2  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1954  restriction modification system DNA specificity subunit  26.35 
 
 
406 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0080  restriction modification system DNA specificity subunit  26.5 
 
 
392 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0564  restriction modification system DNA specificity subunit  24.76 
 
 
415 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00017151  decreased coverage  6.20122e-17 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2722  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.08 
 
 
385 aa  82  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1635  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.39 
 
 
419 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0235263  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.61 
 
 
462 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0864  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.96 
 
 
413 aa  82.4  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2277  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.84 
 
 
433 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  hitchhiker  0.00000677276 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1281  restriction modification system DNA specificity subunit  27.73 
 
 
398 aa  80.9  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0745  restriction modification system DNA specificity domain  34.35 
 
 
411 aa  80.9  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.189202  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20210  restriction modification system DNA specificity domain protein  33.5 
 
 
565 aa  80.5  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266778  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0264  restriction modification system DNA specificity subunit  26.16 
 
 
407 aa  79.7  0.00000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1195  type II restriction-modification enzyme  35.67 
 
 
1343 aa  79.7  0.00000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1122  restriction endonuclease S subunits-like  27.87 
 
 
428 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.878738  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3540  restriction modification system DNA specificity subunit  28.67 
 
 
387 aa  78.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4241  restriction modification system DNA specificity subunit  22.76 
 
 
411 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.491612  hitchhiker  0.00127278 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0448  restriction modification system DNA specificity domain  31.09 
 
 
435 aa  77.4  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000159098 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1502  restriction modification system DNA specificity domain  22.36 
 
 
393 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>