232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2277 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2277  restriction modification system DNA specificity domain protein  100 
 
 
433 aa  892    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  hitchhiker  0.00000677276 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  39.39 
 
 
435 aa  272  9e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3109  restriction modification system DNA specificity subunit  35.35 
 
 
426 aa  252  1e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  43.92 
 
 
457 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2893  restriction modification system DNA specificity domain protein  44.9 
 
 
237 aa  179  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1158  restriction modification system DNA specificity subunit  30.19 
 
 
454 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000117149  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0735  restriction modification system DNA specificity subunit  39.8 
 
 
392 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  34.8 
 
 
456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2852  restriction endonuclease S subunits-like protein  25.42 
 
 
412 aa  144  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1095  restriction modification system DNA specificity subunit  44.9 
 
 
180 aa  143  7e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0307222  normal  0.460019 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0035  hypothetical protein  41.14 
 
 
400 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4189  restriction modification system DNA specificity domain protein  33.67 
 
 
401 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1095  hypothetical protein  43.53 
 
 
401 aa  132  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0334  restriction modification system DNA specificity domain  35.09 
 
 
430 aa  130  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.284396 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  33.55 
 
 
426 aa  130  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  29.43 
 
 
433 aa  130  7.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3129  restriction modification system DNA specificity subunit  37.63 
 
 
416 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.343622  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0844  restriction endonuclease S subunits-like protein  34.24 
 
 
386 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0223  putative HsdS protein  36.46 
 
 
438 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2869  type I restriction-modification system, S subunit  25.4 
 
 
448 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0947716  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1671  restriction modification system DNA specificity subunit  32.27 
 
 
442 aa  120  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.517259  hitchhiker  0.00037426 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0599  type I restriction-modification system, S subunit  24.66 
 
 
458 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4012  restriction modification system DNA specificity subunit  31.21 
 
 
436 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.848484  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1452  restriction modification system DNA specificity domain  33.33 
 
 
392 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0462219  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3382  restriction modification system DNA specificity subunit  32.06 
 
 
485 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1091  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.38 
 
 
444 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2792  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.9 
 
 
423 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313089  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1808  restriction modification system DNA specificity subunit  35.75 
 
 
483 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.300643  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  31.05 
 
 
425 aa  106  9e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1566  restriction modification system DNA specificity subunit  31.02 
 
 
403 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0293394  unclonable  0.0000192379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0829  type I restriction-modification system, S subunit  51.96 
 
 
409 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232689  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2598  type I restriction-modification enzyme, S subunit  28.52 
 
 
417 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0133376  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3515  restriction modification system DNA specificity domain  30.84 
 
 
514 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1778  type I restriction-modification system specificity subunit  23.92 
 
 
419 aa  101  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.926504  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  27.92 
 
 
374 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0804  restriction modification system DNA specificity subunit  31.52 
 
 
368 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.526121  normal  0.427419 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0951  restriction modification system DNA specificity subunit  26.94 
 
 
419 aa  99.4  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000406123 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1398  restriction modification system DNA specificity subunit  30.65 
 
 
557 aa  96.3  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  25.99 
 
 
439 aa  94.4  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0900  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.51 
 
 
471 aa  93.6  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.963501 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  23.61 
 
 
425 aa  91.7  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1176  restriction modification system DNA specificity subunit  28.12 
 
 
408 aa  91.3  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.882603  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1087  restriction modification system DNA specificity subunit  29.1 
 
 
437 aa  90.9  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0762586  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1526  restriction endonuclease S subunits-like  32.34 
 
 
386 aa  90.1  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3569  restriction modification system DNA specificity domain  31.96 
 
 
395 aa  89.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185936  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  27.78 
 
 
422 aa  89.4  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3227  restriction modification system DNA specificity subunit  28.04 
 
 
575 aa  89.4  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2421  restriction modification system DNA specificity subunit  25.06 
 
 
402 aa  87.8  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5008  Restriction endonuclease S subunits-like protein  21.89 
 
 
465 aa  86.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0006  type I restriction-modification system, S subunit, EcoA family  25 
 
 
435 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2689  restriction modification system DNA specificity subunit  30.15 
 
 
290 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.841682  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4139  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.5 
 
 
238 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0086  restriction modification system DNA specificity protein  30.05 
 
 
538 aa  84.7  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4042  restriction modification system DNA specificity subunit  25.53 
 
 
428 aa  84  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03610  type I site-specific deoxyribonuclease  32.34 
 
 
360 aa  83.6  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2409  restriction modification system DNA specificity subunit  30.13 
 
 
442 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  26.67 
 
 
438 aa  83.2  0.000000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  23.81 
 
 
425 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1015  hypothetical protein  24.66 
 
 
477 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1805  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.56 
 
 
423 aa  82  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.745604  normal  0.535567 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4761  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  27.64 
 
 
428 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.84 
 
 
422 aa  80.9  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0102  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.1 
 
 
442 aa  80.5  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3358  restriction modification system DNA specificity subunit  26.4 
 
 
429 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0521612  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1015  restriction modification system DNA specificity subunit  25.51 
 
 
575 aa  79  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3719  restriction modification system DNA specificity subunit  25.98 
 
 
585 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5859  putative type I restriction-modification system, S subunit  25.98 
 
 
584 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05614  type I restriction-modification system S subunit  23 
 
 
432 aa  74.7  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02074  HsdS polypeptide, part of CfrA family  38.24 
 
 
151 aa  74.3  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1087  type I restriction-modification system, S subunit  21.51 
 
 
422 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247708  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  25.98 
 
 
429 aa  73.6  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2226  restriction modification system DNA specificity subunit  25.24 
 
 
451 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.890862  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1643  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.19 
 
 
428 aa  71.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  26.87 
 
 
429 aa  70.9  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1060  restriction modification system DNA specificity subunit  28.78 
 
 
397 aa  69.7  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4622  Restriction endonuclease S subunits-like protein  22.04 
 
 
411 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.156513 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2665  type I restriction-modification system specificity subunit  24.76 
 
 
446 aa  69.7  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0650221  normal  0.332066 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1221  restriction modification system DNA specificity subunit  23.47 
 
 
463 aa  67.8  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2328  type I restriction-modification system specificity subunit  21.83 
 
 
404 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1911  hypothetical protein  25.2 
 
 
453 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.568524  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2926  restriction modification system DNA specificity subunit  25.6 
 
 
434 aa  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.78 
 
 
427 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1204  restriction modification system DNA specificity subunit  28.89 
 
 
547 aa  65.1  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340549  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0944  restriction modification system DNA specificity subunit  24.08 
 
 
420 aa  65.1  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000962716  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0605  restriction modification system DNA specificity subunit  25.95 
 
 
453 aa  65.5  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0854  restriction modification system DNA specificity subunit  27.62 
 
 
595 aa  65.1  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221182  normal  0.0643125 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  26.59 
 
 
456 aa  65.1  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0564  restriction modification system DNA specificity subunit  22.69 
 
 
415 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00017151  decreased coverage  6.20122e-17 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0160  restriction modification system DNA specificity subunit  23.77 
 
 
399 aa  64.3  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2939  type I restriction-modification system  23.95 
 
 
432 aa  63.9  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0304782 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2378  type I restriction-modification system, S subunit  26.64 
 
 
383 aa  64.3  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1536  hypothetical protein  23.81 
 
 
380 aa  63.9  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00344436  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0842  type I restriction-modification enzyme, S subunit, putative  23.6 
 
 
476 aa  63.5  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2009  restriction modification system DNA specificity domain  26.55 
 
 
423 aa  63.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.999718  normal  0.91224 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1991  restriction modification system DNA specificity domain  26.73 
 
 
490 aa  62.4  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120232  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0249  restriction modification system DNA specificity subunit  22.68 
 
 
393 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4472  restriction modification system DNA specificity subunit  25 
 
 
415 aa  60.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.270866  normal  0.0902542 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1237  restriction modification system DNA specificity subunit  25.77 
 
 
633 aa  60.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2607  restriction modification system DNA specificity subunit  26.6 
 
 
462 aa  60.1  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3199  restriction modification system DNA specificity subunit  17.11 
 
 
400 aa  59.7  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365834  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>