132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1991 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1991  restriction modification system DNA specificity domain  100 
 
 
490 aa  989    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120232  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0845  restriction modification system DNA specificity domain protein  33.27 
 
 
495 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31571e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0842  type I restriction-modification enzyme, S subunit, putative  32.87 
 
 
476 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.73 
 
 
477 aa  199  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1492  restriction modification system DNA specificity subunit  36.75 
 
 
479 aa  193  5e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2093  restriction modification system DNA specificity subunit  36.24 
 
 
477 aa  188  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2862  restriction modification system DNA specificity subunit  29.27 
 
 
589 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3272  type I restriction-modification system specificity subunit  30.46 
 
 
492 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425878  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0854  restriction modification system DNA specificity subunit  29.2 
 
 
595 aa  163  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221182  normal  0.0643125 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3777  restriction endonuclease S subunits-like protein  30 
 
 
419 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3850  restriction endonuclease S subunits-like protein  30 
 
 
419 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1414  restriction modification system DNA specificity domain  30.6 
 
 
447 aa  147  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00014984  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  27.59 
 
 
611 aa  146  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184495 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0900  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.21 
 
 
471 aa  145  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.963501 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0390  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.33 
 
 
642 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000219621 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1204  restriction modification system DNA specificity subunit  26.82 
 
 
547 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340549  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4611  restriction modification system DNA specificity subunit  23.21 
 
 
561 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.483614  hitchhiker  0.0000795371 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3649  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.91 
 
 
464 aa  125  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0086  restriction modification system DNA specificity protein  23.72 
 
 
538 aa  125  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2875  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.71 
 
 
390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4714  restriction modification system DNA specificity domain  37.12 
 
 
380 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.232226  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3515  restriction modification system DNA specificity domain  24.9 
 
 
514 aa  111  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1095  restriction modification system DNA specificity subunit  26.92 
 
 
450 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4012  restriction modification system DNA specificity subunit  22.73 
 
 
436 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.848484  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2409  restriction modification system DNA specificity subunit  23.13 
 
 
442 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1032  restriction modification system DNA specificity subunit  26.23 
 
 
457 aa  96.3  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41908  normal  0.322454 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1061  putative type I restriction-modification system, S subunit  23.78 
 
 
528 aa  95.1  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3227  restriction modification system DNA specificity subunit  23.6 
 
 
575 aa  94.7  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1225  hypothetical protein  28.95 
 
 
459 aa  91.3  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.438073 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0268  restriction endonuclease S subunits  24.82 
 
 
444 aa  90.5  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277222  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2744  type I restriction-modification system, S subunit  23.04 
 
 
532 aa  89.4  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0181132  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1160  restriction modification system DNA specificity subunit  29.9 
 
 
407 aa  89.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2976  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.67 
 
 
238 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2496  subunit S of type I restriction-modification system  24.8 
 
 
565 aa  87  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00268922  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4761  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  25.82 
 
 
428 aa  86.7  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  29.28 
 
 
435 aa  85.9  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02063  type I restriction-modification system, S subunit  23.19 
 
 
501 aa  85.9  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  26.07 
 
 
390 aa  84.7  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000269296  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5008  Restriction endonuclease S subunits-like protein  29.65 
 
 
465 aa  83.6  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3089  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.31 
 
 
520 aa  82.4  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5859  putative type I restriction-modification system, S subunit  21.96 
 
 
584 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4930  type I restriction enzyme StySJI specificity protein  23.7 
 
 
469 aa  80.5  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1060  restriction modification system DNA specificity subunit  23.82 
 
 
397 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.91 
 
 
457 aa  80.1  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2988  restriction modification system DNA specificity domain protein  29 
 
 
386 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3719  restriction modification system DNA specificity subunit  22.2 
 
 
585 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4264  type I restriction-modification system, S subunit  27.02 
 
 
495 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3180  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.16 
 
 
390 aa  75.1  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1398  restriction modification system DNA specificity subunit  21.44 
 
 
557 aa  74.7  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3653  type I restriction enzyme StySPI specificity protein  25.79 
 
 
460 aa  73.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.234587  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  21.72 
 
 
456 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1132  restriction modification system DNA specificity subunit  23.27 
 
 
556 aa  72  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.817215  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0735  restriction modification system DNA specificity subunit  22.09 
 
 
392 aa  72  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2421  restriction modification system DNA specificity subunit  24.38 
 
 
402 aa  71.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2960  restriction modification system DNA specificity subunit  21.89 
 
 
587 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2893  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.61 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3673  restriction modification system DNA specificity domain protein  35.12 
 
 
459 aa  69.7  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2226  restriction modification system DNA specificity subunit  20.15 
 
 
451 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.890862  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1911  hypothetical protein  25.05 
 
 
453 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.568524  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04178  hypothetical protein  28.29 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.695524  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1237  restriction modification system DNA specificity subunit  28.88 
 
 
633 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1015  restriction modification system DNA specificity subunit  20.92 
 
 
575 aa  67.4  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03610  type I site-specific deoxyribonuclease  24.72 
 
 
360 aa  66.6  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0102  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.5 
 
 
442 aa  66.6  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3358  restriction modification system DNA specificity subunit  22.07 
 
 
429 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0521612  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  26.24 
 
 
435 aa  65.9  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1526  restriction endonuclease S subunits-like  23.78 
 
 
386 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0371  type I restriction-modification system S subunit  25.23 
 
 
323 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0501  restriction modification system DNA specificity subunit  27.63 
 
 
612 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.435558 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1672  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.04 
 
 
493 aa  64.7  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4139  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.86 
 
 
238 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0822  restriction modification system DNA specificity subunit  25.12 
 
 
577 aa  63.9  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1978  restriction modification system DNA specificity subunit  27.96 
 
 
616 aa  63.5  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4742  type I restriction-modification system, S subunit  21.15 
 
 
576 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266617  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  26.34 
 
 
433 aa  62.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2277  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.73 
 
 
433 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  hitchhiker  0.00000677276 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0640  restriction modification system DNA specificity subunit  23.48 
 
 
447 aa  60.5  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0727  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.21 
 
 
400 aa  60.5  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0968972 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1941  restriction endonuclease S subunits-like  22.15 
 
 
451 aa  60.1  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0182546  normal  0.0682578 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0951  restriction modification system DNA specificity subunit  25.16 
 
 
419 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000406123 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3199  restriction modification system DNA specificity subunit  22.37 
 
 
400 aa  59.3  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365834  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  21.91 
 
 
425 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0804  restriction modification system DNA specificity subunit  24.77 
 
 
368 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.526121  normal  0.427419 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20210  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.77 
 
 
565 aa  58.9  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266778  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1643  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.5 
 
 
428 aa  58.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1144  restriction modification system DNA specificity subunit  24 
 
 
473 aa  57.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1027  restriction modification system DNA specificity subunit  24.55 
 
 
420 aa  57.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2688  restriction endonuclease S subunits-like  24.89 
 
 
487 aa  57.4  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.165356  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1311  restriction modification system DNA specificity subunit  23.5 
 
 
578 aa  57  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3030  restriction modification system DNA specificity subunit  24.64 
 
 
564 aa  56.2  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2652  Restriction endonuclease S subunits-like protein  22.8 
 
 
413 aa  56.6  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.252104  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4240  Restriction endonuclease S subunits-like protein  24.24 
 
 
436 aa  55.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0959  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.15 
 
 
442 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4454  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.08 
 
 
406 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.859615  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0515  type I restriction-modification system (specificity subunit)  27.87 
 
 
263 aa  53.5  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1064  type I restriction-modification  25.35 
 
 
453 aa  52.4  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000898872  normal  0.027841 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1635  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.07 
 
 
419 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0235263  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0686  type I restriction-modification system, S subunit, putative  20.95 
 
 
561 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.840975  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0835  restriction modification system DNA specificity domain  20.95 
 
 
563 aa  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.835919  normal  0.945638 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0564  restriction modification system DNA specificity subunit  32.5 
 
 
415 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00017151  decreased coverage  6.20122e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>