219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1897 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  100 
 
 
433 aa  875    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2689  restriction modification system DNA specificity subunit  56.35 
 
 
290 aa  297  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.841682  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  36.67 
 
 
435 aa  224  3e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  36.28 
 
 
422 aa  217  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  35.51 
 
 
425 aa  206  6e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1091  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.97 
 
 
444 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17387  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1805  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.47 
 
 
423 aa  189  8e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.745604  normal  0.535567 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1671  restriction modification system DNA specificity subunit  38.87 
 
 
442 aa  180  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.517259  hitchhiker  0.00037426 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1158  restriction modification system DNA specificity subunit  30.28 
 
 
454 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000117149  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0334  restriction modification system DNA specificity domain  41.49 
 
 
430 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.284396 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2277  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.43 
 
 
433 aa  130  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  hitchhiker  0.00000677276 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1153  restriction modification system DNA specificity subunit  25.58 
 
 
429 aa  121  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.03 
 
 
457 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  33.45 
 
 
426 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  31.91 
 
 
456 aa  117  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2924  restriction endonuclease S subunit  36.96 
 
 
394 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2598  type I restriction-modification enzyme, S subunit  27.61 
 
 
417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0133376  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  30.96 
 
 
429 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  26.22 
 
 
439 aa  108  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2792  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.44 
 
 
423 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313089  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1094  restriction modification system DNA specificity domain protein  35.84 
 
 
205 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0782363  normal  0.473834 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2926  restriction modification system DNA specificity subunit  30.14 
 
 
434 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  23.11 
 
 
425 aa  101  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3425  restriction endonuclease S subunits-like  36.2 
 
 
390 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835151  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0844  restriction endonuclease S subunits-like protein  31.67 
 
 
386 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2467  restriction modification system DNA specificity domain  22.83 
 
 
438 aa  100  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  24.09 
 
 
425 aa  99  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  30.32 
 
 
429 aa  97.8  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  27.83 
 
 
374 aa  96.3  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3109  restriction modification system DNA specificity subunit  26.98 
 
 
426 aa  94  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0988  type I restriction-modification system, S subunit  25.87 
 
 
401 aa  93.6  6e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0615  restriction modification system DNA specificity subunit  25.34 
 
 
417 aa  92  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0545068  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0951  restriction modification system DNA specificity subunit  23.42 
 
 
419 aa  90.9  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000406123 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1791  restriction modification system DNA specificity subunit  26.83 
 
 
419 aa  90.1  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365715  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1093  restriction modification system DNA specificity subunit  31.91 
 
 
394 aa  90.1  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3173  restriction modification system, type I  29.78 
 
 
394 aa  90.1  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000000252983 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0944  restriction modification system DNA specificity subunit  26.27 
 
 
420 aa  88.2  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000962716  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4348  restriction modification system DNA specificity subunit  32.91 
 
 
363 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3985  restriction modification system DNA specificity subunit  29.5 
 
 
401 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3607  restriction modification system, type I  26.4 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0333  restriction modification system DNA specificity subunit  25.75 
 
 
371 aa  82.8  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1643  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.38 
 
 
428 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0508  restriction modification system DNA specificity subunit  29.41 
 
 
511 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1566  restriction modification system DNA specificity subunit  27.81 
 
 
403 aa  82.8  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0293394  unclonable  0.0000192379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0829  type I restriction-modification system, S subunit  50.59 
 
 
409 aa  82  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232689  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4042  restriction modification system DNA specificity subunit  23.34 
 
 
428 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0277  restriction modification system DNA specificity subunit  30.17 
 
 
413 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0564  restriction modification system DNA specificity subunit  23.26 
 
 
415 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00017151  decreased coverage  6.20122e-17 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2268  putative type I restriction enzyme, S subunit  24.46 
 
 
457 aa  80.5  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6260  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.7 
 
 
441 aa  80.5  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0102  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.38 
 
 
442 aa  79.7  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0006  type I restriction-modification system, S subunit, EcoA family  25.67 
 
 
435 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  35.03 
 
 
429 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0745  restriction modification system DNA specificity domain  35.11 
 
 
411 aa  79.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.189202  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4821  type I restriction-modification system, endonuclease S subunit  25.77 
 
 
382 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0160  restriction modification system DNA specificity subunit  26.39 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3358  restriction modification system DNA specificity subunit  27.78 
 
 
429 aa  77.8  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0521612  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2194  restriction modification system DNA specificity subunit  25.06 
 
 
427 aa  77  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.122675  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4880  putative type I restriction-modification system S subunit  31.76 
 
 
571 aa  77  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.960431 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3297  restriction modification system DNA specificity subunit  22.15 
 
 
430 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000489204 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1516  restriction modification system DNA specificity subunit  25.76 
 
 
395 aa  75.5  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.205219 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2508  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  22.98 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.700746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1281  restriction modification system DNA specificity subunit  34.43 
 
 
398 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1176  restriction modification system DNA specificity subunit  25.59 
 
 
408 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.882603  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  23.58 
 
 
432 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0076  type I restriction-modification system subunit S  24.03 
 
 
464 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2673  restriction modification system DNA specificity subunit  21.77 
 
 
415 aa  73.9  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.574489 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2742  type I restriction-modification system specificity determinant  23.13 
 
 
398 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971087  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0836  type I restriction-modification system S subunit  22.59 
 
 
416 aa  72  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2086  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.46 
 
 
417 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000683293 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4761  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  25.75 
 
 
428 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0249  restriction modification system DNA specificity subunit  23.58 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3989  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.44 
 
 
456 aa  71.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0737122 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5276  restriction modification system DNA specificity subunit  29.56 
 
 
418 aa  70.1  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0006  restriction modification system, type I  22.12 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3081  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.96 
 
 
415 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3075  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.65 
 
 
388 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.40504  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  26.2 
 
 
438 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2397  restriction modification system DNA specificity domain  24.46 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3940  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.39 
 
 
453 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  25.66 
 
 
422 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0080  restriction modification system DNA specificity subunit  24.34 
 
 
392 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4012  restriction modification system DNA specificity subunit  22.25 
 
 
436 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.848484  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.88 
 
 
477 aa  67.8  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1260  restriction modification system DNA specificity subunit  23.1 
 
 
385 aa  67.4  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0727  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.47 
 
 
400 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0968972 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3550  restriction modification system DNA specificity subunit  28.78 
 
 
417 aa  65.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257959  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1032  restriction modification system DNA specificity subunit  21.89 
 
 
457 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41908  normal  0.322454 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2688  restriction endonuclease S subunits-like  24.13 
 
 
487 aa  65.1  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.165356  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05614  type I restriction-modification system S subunit  24.03 
 
 
432 aa  65.5  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2869  type I restriction-modification system, S subunit  22.73 
 
 
448 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0947716  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  22.93 
 
 
435 aa  64.3  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0500  restriction modification system DNA specificity subunit  25.09 
 
 
413 aa  63.9  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.565018  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5008  Restriction endonuclease S subunits-like protein  21 
 
 
465 aa  63.5  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  31.82 
 
 
549 aa  63.5  0.000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1991  restriction modification system DNA specificity domain  26.34 
 
 
490 aa  62.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120232  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3129  restriction modification system DNA specificity subunit  22.7 
 
 
416 aa  63.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.343622  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2409  restriction modification system DNA specificity subunit  21.76 
 
 
442 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0041  restriction modification system DNA specificity subunit  23.64 
 
 
397 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3010  restriction endonuclease S subunits-like protein  24.87 
 
 
388 aa  62  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116402  normal  0.20864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>