115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1516 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1516  restriction modification system DNA specificity subunit  100 
 
 
395 aa  822    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.205219 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0414  restriction modification system DNA specificity subunit  33.74 
 
 
439 aa  202  6e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.405933  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  53.67 
 
 
799 aa  197  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1221  restriction modification system DNA specificity subunit  46.12 
 
 
463 aa  192  8e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0264  restriction modification system DNA specificity subunit  31.07 
 
 
407 aa  187  3e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4472  restriction modification system DNA specificity subunit  27.75 
 
 
415 aa  172  9e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.270866  normal  0.0902542 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1783  restriction modification system DNA specificity subunit  30.02 
 
 
448 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6260  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.19 
 
 
441 aa  162  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1153  restriction modification system DNA specificity subunit  28.26 
 
 
429 aa  150  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3443  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.25 
 
 
445 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19070  hypothetical protein  30.05 
 
 
425 aa  146  7.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0871344 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1366  hypothetical protein  28.6 
 
 
462 aa  145  9e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2200  type I restriction-modification system specificity subunit  26.01 
 
 
461 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.844306  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  26.05 
 
 
422 aa  140  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2682  putative restriction endonuclease S subunit  25.7 
 
 
400 aa  137  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.845062  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1015  hypothetical protein  27.8 
 
 
477 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0796  restriction modification system DNA specificity domain  26.48 
 
 
441 aa  127  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343889 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0640  restriction modification system DNA specificity subunit  24.61 
 
 
447 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0416  type I restriction-modification system S subunit  25.95 
 
 
457 aa  124  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0531711 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2939  type I restriction-modification system  26.29 
 
 
432 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0304782 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2688  restriction endonuclease S subunits-like  27.33 
 
 
487 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.165356  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0277  hypothetical protein  31.34 
 
 
474 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3940  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.36 
 
 
453 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2869  type I restriction-modification system, S subunit  31.29 
 
 
448 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0947716  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1366  putative type I site-specific restriction-modification system, S subunit  26.34 
 
 
422 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0493853  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0487  restriction modification system DNA specificity subunit  26.73 
 
 
438 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  0.0187002 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.94 
 
 
462 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4761  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  25.89 
 
 
428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3989  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.67 
 
 
456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0737122 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1481  restriction endonuclease S subunits-like protein  25.17 
 
 
443 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4455  restriction modification system DNA specificity subunit  27.75 
 
 
388 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.353509  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0076  type I restriction-modification system subunit S  25.34 
 
 
464 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3358  restriction modification system DNA specificity subunit  26.42 
 
 
429 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0521612  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003235  type I restriction-modification system specificity subunit S  29.24 
 
 
437 aa  107  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2226  restriction modification system DNA specificity subunit  25.39 
 
 
451 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.890862  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  24.44 
 
 
456 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0842  hypothetical protein  23.52 
 
 
446 aa  100  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.229597  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2607  restriction modification system DNA specificity subunit  24.24 
 
 
462 aa  99.8  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0233  restriction modification system DNA specificity subunit  23.93 
 
 
461 aa  99.8  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0967889  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1791  restriction modification system DNA specificity subunit  26.21 
 
 
419 aa  99.4  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365715  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0599  type I restriction-modification system, S subunit  26.81 
 
 
458 aa  98.2  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1860  type I restriction enzyme, S subunit  28 
 
 
474 aa  97.4  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0504746  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0277  restriction modification system DNA specificity subunit  24.94 
 
 
413 aa  95.9  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.97 
 
 
422 aa  94.4  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0750  putative type I restriction-modification system  29.79 
 
 
436 aa  92.8  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.769779  normal  0.272821 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1064  type I restriction-modification  23.15 
 
 
453 aa  89.4  9e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000898872  normal  0.027841 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3571  hypothetical protein  25 
 
 
458 aa  89.4  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2268  putative type I restriction enzyme, S subunit  24.44 
 
 
457 aa  88.2  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0193  type I restriction-modification system specificity determinant  29.67 
 
 
416 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2176  restriction modification system DNA specificity subunit  27.52 
 
 
444 aa  85.5  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.962317  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0951  restriction modification system DNA specificity subunit  23.24 
 
 
419 aa  83.6  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000406123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2194  restriction modification system DNA specificity subunit  27.84 
 
 
427 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.122675  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2606  restriction modification system DNA specificity subunit  25.65 
 
 
429 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0102  restriction modification system DNA specificity domain protein  19.66 
 
 
442 aa  80.1  0.00000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.91 
 
 
427 aa  77.8  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0658  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.54 
 
 
473 aa  77  0.0000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  25.76 
 
 
433 aa  75.5  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1327  restriction modification system DNA specificity subunit  47.37 
 
 
431 aa  75.5  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.280518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0959  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.44 
 
 
442 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2689  restriction modification system DNA specificity subunit  26.72 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.841682  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0249  restriction modification system DNA specificity subunit  30.32 
 
 
393 aa  72  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3075  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.25 
 
 
388 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.40504  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.07 
 
 
457 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0455  restriction modification system DNA specificity subunit  28.34 
 
 
403 aa  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0467  restriction modification system DNA specificity subunit  28.34 
 
 
403 aa  63.9  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  23.12 
 
 
439 aa  63.2  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0041  restriction modification system DNA specificity subunit  26.67 
 
 
397 aa  63.2  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2743  type I restriction-modification system, S subunit, truncation  30.25 
 
 
175 aa  62.8  0.000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.441032  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1160  restriction modification system DNA specificity subunit  24.03 
 
 
407 aa  62  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13680  hypothetical protein  30 
 
 
354 aa  61.6  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.247083  normal  0.424884 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  22.22 
 
 
390 aa  60.1  0.00000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000269296  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0864  restriction modification system DNA specificity domain protein  20.51 
 
 
413 aa  60.1  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4810  putative type I restriction-modification system specificity subunit  28.57 
 
 
360 aa  59.7  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0750  restriction endonuclease S subunit  24.87 
 
 
387 aa  58.9  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0987  restriction modification system DNA specificity subunit  29.08 
 
 
390 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  24.84 
 
 
435 aa  58.9  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1037  restriction modification system DNA specificity domain  26.28 
 
 
364 aa  57.8  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0890662  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  23.16 
 
 
425 aa  57  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2698  restriction modification system DNA specificity subunit  45.1 
 
 
267 aa  56.6  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0854775  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1671  restriction modification system DNA specificity subunit  27.14 
 
 
442 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.517259  hitchhiker  0.00037426 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0808  specificity determinant HsdS-like  24.43 
 
 
363 aa  55.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.361917  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1091  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.16 
 
 
444 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17387  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0804  restriction modification system DNA specificity subunit  21.51 
 
 
368 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.526121  normal  0.427419 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  21.98 
 
 
438 aa  55.1  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1672  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.57 
 
 
493 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22810  hypothetical protein  23.84 
 
 
418 aa  54.3  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1094  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.94 
 
 
205 aa  53.9  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0782363  normal  0.473834 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2598  type I restriction-modification enzyme, S subunit  29.63 
 
 
417 aa  53.1  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0133376  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4930  type I restriction enzyme StySJI specificity protein  29.37 
 
 
469 aa  53.1  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  37.35 
 
 
374 aa  52.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2910  putative type I restriction-modification system, S subunit  29.51 
 
 
373 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  23.26 
 
 
425 aa  52.8  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0735  restriction modification system DNA specificity subunit  24.78 
 
 
392 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2792  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.21 
 
 
423 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313089  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6044  type I restriction-modification system subunit S  27.59 
 
 
547 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.061065  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2093  restriction modification system DNA specificity subunit  31.82 
 
 
477 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0005  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.89 
 
 
378 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4348  restriction modification system DNA specificity subunit  27.81 
 
 
363 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1218  restriction modification system DNA specificity subunit  29.51 
 
 
351 aa  49.7  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.67755  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4264  type I restriction-modification system, S subunit  30.39 
 
 
495 aa  49.3  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>