205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_3940 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3940  restriction modification system DNA specificity domain protein  100 
 
 
453 aa  927    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1015  hypothetical protein  61.29 
 
 
477 aa  271  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1481  restriction endonuclease S subunits-like protein  59.11 
 
 
443 aa  251  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3989  restriction modification system DNA specificity domain protein  50.96 
 
 
456 aa  246  6e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0737122 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  32.96 
 
 
456 aa  220  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0599  type I restriction-modification system, S subunit  31.8 
 
 
458 aa  210  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0076  type I restriction-modification system subunit S  34.5 
 
 
464 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1153  restriction modification system DNA specificity subunit  34.01 
 
 
429 aa  199  7e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0416  type I restriction-modification system S subunit  33.12 
 
 
457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0531711 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2869  type I restriction-modification system, S subunit  30.61 
 
 
448 aa  195  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0947716  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0487  restriction modification system DNA specificity subunit  33.33 
 
 
438 aa  187  5e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  0.0187002 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0796  restriction modification system DNA specificity domain  31.1 
 
 
441 aa  184  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343889 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2607  restriction modification system DNA specificity subunit  33.05 
 
 
462 aa  184  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2688  restriction endonuclease S subunits-like  31.28 
 
 
487 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.165356  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.63 
 
 
427 aa  182  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003235  type I restriction-modification system specificity subunit S  30.54 
 
 
437 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1064  type I restriction-modification  30.57 
 
 
453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000898872  normal  0.027841 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0277  restriction modification system DNA specificity subunit  30.82 
 
 
413 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0414  restriction modification system DNA specificity subunit  31.45 
 
 
439 aa  180  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.405933  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3075  restriction modification system DNA specificity domain protein  42.06 
 
 
388 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.40504  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0233  restriction modification system DNA specificity subunit  31.24 
 
 
461 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0967889  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4472  restriction modification system DNA specificity subunit  31.49 
 
 
415 aa  170  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.270866  normal  0.0902542 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  35.74 
 
 
422 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2939  type I restriction-modification system  32.41 
 
 
432 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0304782 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1327  restriction modification system DNA specificity subunit  32.98 
 
 
431 aa  166  9e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.280518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6260  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.41 
 
 
441 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0750  putative type I restriction-modification system  29.48 
 
 
436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.769779  normal  0.272821 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1791  restriction modification system DNA specificity subunit  30.65 
 
 
419 aa  164  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365715  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.82 
 
 
462 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2226  restriction modification system DNA specificity subunit  28.82 
 
 
451 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.890862  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1860  type I restriction enzyme, S subunit  27.98 
 
 
474 aa  153  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0504746  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1366  hypothetical protein  29.09 
 
 
462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19070  hypothetical protein  28.98 
 
 
425 aa  147  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0871344 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0640  restriction modification system DNA specificity subunit  27.51 
 
 
447 aa  146  8.000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1859  restriction modification system DNA specificity subunit  31.74 
 
 
409 aa  146  9e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.777891  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1894  restriction modification system DNA specificity subunit  31.74 
 
 
409 aa  146  9e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.850685  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4761  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  33.33 
 
 
428 aa  144  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0277  hypothetical protein  26.54 
 
 
474 aa  143  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  41.36 
 
 
611 aa  143  8e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184495 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2606  restriction modification system DNA specificity subunit  29.75 
 
 
429 aa  137  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3443  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.56 
 
 
445 aa  136  8e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0959  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.44 
 
 
442 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1366  putative type I site-specific restriction-modification system, S subunit  27.78 
 
 
422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0493853  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1783  restriction modification system DNA specificity subunit  28.82 
 
 
448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2268  putative type I restriction enzyme, S subunit  26.96 
 
 
457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0842  hypothetical protein  28.05 
 
 
446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.229597  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3953  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.03 
 
 
413 aa  131  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1221  restriction modification system DNA specificity subunit  26.05 
 
 
463 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2176  restriction modification system DNA specificity subunit  26.27 
 
 
444 aa  130  6e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.962317  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3358  restriction modification system DNA specificity subunit  29.75 
 
 
429 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0521612  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3571  hypothetical protein  27.1 
 
 
458 aa  127  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2698  restriction modification system DNA specificity subunit  35.92 
 
 
267 aa  128  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0854775  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2200  type I restriction-modification system specificity subunit  25.42 
 
 
461 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.844306  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0193  type I restriction-modification system specificity determinant  26.02 
 
 
416 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3673  restriction modification system DNA specificity subunit  33.85 
 
 
410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1516  restriction modification system DNA specificity subunit  26.36 
 
 
395 aa  117  5e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.205219 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3549  restriction modification system DNA specificity subunit  35.68 
 
 
296 aa  117  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348533  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2682  putative restriction endonuclease S subunit  29.53 
 
 
400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.845062  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1433  restriction modification system DNA specificity subunit  34.59 
 
 
372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0264  restriction modification system DNA specificity subunit  24.5 
 
 
407 aa  108  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  26.03 
 
 
438 aa  107  5e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2028  restriction modification system DNA specificity subunit  36.09 
 
 
391 aa  104  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000400239 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3569  restriction modification system DNA specificity domain  34.91 
 
 
395 aa  101  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185936  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2421  restriction modification system DNA specificity subunit  25.51 
 
 
402 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  24.55 
 
 
425 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1911  hypothetical protein  24.04 
 
 
453 aa  95.1  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.568524  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3272  type I restriction-modification system specificity subunit  23.38 
 
 
492 aa  91.3  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425878  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0658  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.16 
 
 
473 aa  89.4  1e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  32.47 
 
 
834 aa  88.2  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  30 
 
 
425 aa  87.4  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1219  restriction modification system DNA specificity domain  27.93 
 
 
412 aa  85.5  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.86 
 
 
422 aa  85.5  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  24.78 
 
 
435 aa  84  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4455  restriction modification system DNA specificity subunit  23.19 
 
 
388 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.353509  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  30.51 
 
 
775 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1551  type I restriction enzyme  27.21 
 
 
439 aa  81.3  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0504  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.97 
 
 
408 aa  80.1  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0845  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.79 
 
 
495 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31571e-19 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2409  restriction modification system DNA specificity subunit  23.15 
 
 
442 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  24.28 
 
 
432 aa  77  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3653  type I restriction enzyme StySPI specificity protein  20.46 
 
 
460 aa  75.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.234587  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  27.83 
 
 
429 aa  75.1  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0944  restriction modification system DNA specificity subunit  24.94 
 
 
420 aa  75.1  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000962716  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1237  restriction modification system DNA specificity subunit  26.9 
 
 
633 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05614  type I restriction-modification system S subunit  28.57 
 
 
432 aa  72.8  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  28.92 
 
 
425 aa  73.2  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4917  restriction modification system DNA specificity subunit  24.55 
 
 
412 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.544675 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  26.51 
 
 
429 aa  72  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0023  type I restriction-modification system specificity subunit  26.88 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0031  type I restriction-modification system specificity subunit  26.88 
 
 
411 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404176  normal  0.032892 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  28.03 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000269296  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  24.73 
 
 
439 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2346  restriction modification system DNA specificity subunit  29.28 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104931  normal  0.0105772 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  24.03 
 
 
426 aa  70.1  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3132  restriction modification system DNA specificity domain protein  25 
 
 
424 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.474681 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0829  type I restriction-modification system, S subunit  24.1 
 
 
409 aa  69.7  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232689  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  25.39 
 
 
433 aa  68.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  23.03 
 
 
456 aa  68.2  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0605  restriction modification system DNA specificity subunit  25.45 
 
 
453 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5008  Restriction endonuclease S subunits-like protein  22.73 
 
 
465 aa  67.8  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.441656 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>