93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1366 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1366  hypothetical protein  100 
 
 		 462 aa  959    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1783  restriction modification system DNA specificity subunit  53.27 
 
 		 448 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6260  restriction modification system DNA specificity domain protein  35.91 
 
 		 441 aa  231  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2682  putative restriction endonuclease S subunit  42.16 
 
 		 400 aa  229  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.845062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2200  type I restriction-modification system specificity subunit  32.29 
 
 		 461 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.844306  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2176  restriction modification system DNA specificity subunit  51.28 
 
 		 444 aa  206  7e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.962317  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1860  type I restriction enzyme, S subunit  49.52 
 
 		 474 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0504746  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2688  restriction endonuclease S subunits-like  31.64 
 
 		 487 aa  188  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.165356  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003235  type I restriction-modification system specificity subunit S  33.05 
 
 		 437 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0264  restriction modification system DNA specificity subunit  32.09 
 
 		 407 aa  182  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19070  hypothetical protein  29.66 
 
 		 425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0871344 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2939  type I restriction-modification system  31.91 
 
 		 432 aa  171  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0304782 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3989  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.25 
 
 		 456 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0737122 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3940  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.09 
 
 		 453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4472  restriction modification system DNA specificity subunit  32.53 
 
 		 415 aa  147  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.270866  normal  0.0902542 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1516  restriction modification system DNA specificity subunit  28.6 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.205219 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1015  hypothetical protein  27.79 
 
 		 477 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0277  restriction modification system DNA specificity subunit  27.21 
 
 		 413 aa  138  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1064  type I restriction-modification  25.11 
 
 		 453 aa  134  5e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000898872  normal  0.027841 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0796  restriction modification system DNA specificity domain  26.01 
 
 		 441 aa  133  5e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343889 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  26.76 
 
 		 422 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0599  type I restriction-modification system, S subunit  27.57 
 
 		 458 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1481  restriction endonuclease S subunits-like protein  27.31 
 
 		 443 aa  131  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2869  type I restriction-modification system, S subunit  26.97 
 
 		 448 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0947716  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0414  restriction modification system DNA specificity subunit  26.42 
 
 		 439 aa  128  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.405933  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  24.3 
 
 		 456 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1153  restriction modification system DNA specificity subunit  26.73 
 
 		 429 aa  126  9e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0416  type I restriction-modification system S subunit  27.25 
 
 		 457 aa  124  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0531711 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0076  type I restriction-modification system subunit S  26.74 
 
 		 464 aa  123  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1327  restriction modification system DNA specificity subunit  27.62 
 
 		 431 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280518 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0487  restriction modification system DNA specificity subunit  24.54 
 
 		 438 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  0.0187002 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0277  hypothetical protein  23.8 
 
 		 474 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1221  restriction modification system DNA specificity subunit  26.18 
 
 		 463 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1791  restriction modification system DNA specificity subunit  25.87 
 
 		 419 aa  117  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3571  hypothetical protein  24.95 
 
 		 458 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0842  hypothetical protein  32.84 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.229597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.93 
 
 		 462 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2268  putative type I restriction enzyme, S subunit  21.95 
 
 		 457 aa  106  7e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2226  restriction modification system DNA specificity subunit  24.84 
 
 		 451 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.890862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4761  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  28.38 
 
 		 428 aa  104  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2606  restriction modification system DNA specificity subunit  28.41 
 
 		 429 aa  104  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3443  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.05 
 
 		 445 aa  104  4e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2607  restriction modification system DNA specificity subunit  30.71 
 
 		 462 aa  103  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0640  restriction modification system DNA specificity subunit  24.73 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1366  putative type I site-specific restriction-modification system, S subunit  26.22 
 
 		 422 aa  100  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0493853  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0193  type I restriction-modification system specificity determinant  30.69 
 
 		 416 aa  96.7  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.51 
 
 		 427 aa  96.7  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1551  type I restriction enzyme  34.02 
 
 		 439 aa  95.9  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0233  restriction modification system DNA specificity subunit  24.67 
 
 		 461 aa  95.5  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0967889  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3358  restriction modification system DNA specificity subunit  26.59 
 
 		 429 aa  92.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0521612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0750  putative type I restriction-modification system  32.85 
 
 		 436 aa  90.1  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.769779  normal  0.272821 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0658  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.38 
 
 		 473 aa  85.9  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2652  Restriction endonuclease S subunits-like protein  23.13 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.252104  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  24.4 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1160  restriction modification system DNA specificity subunit  24.24 
 
 		 407 aa  70.1  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0262  type I restriction-modification system specificity determinant  26.05 
 
 		 360 aa  69.3  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.874092  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2698  restriction modification system DNA specificity subunit  24.71 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0854775  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  24.94 
 
 		 439 aa  63.5  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0455  restriction modification system DNA specificity subunit  24.5 
 
 		 403 aa  63.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0467  restriction modification system DNA specificity subunit  24.5 
 
 		 403 aa  63.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.4 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2689  restriction modification system DNA specificity subunit  23.24 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.841682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.24 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0854  restriction modification system DNA specificity subunit  29.48 
 
 		 595 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221182  normal  0.0643125 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4455  restriction modification system DNA specificity subunit  22.99 
 
 		 388 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.353509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0232  restriction endonuclease S subunit-like protein  26.97 
 
 		 192 aa  55.5  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03180  hypothetical protein  40.96 
 
 		 159 aa  55.8  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000950219 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0098  restriction endonuclease S subunits  22.67 
 
 		 315 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  23.28 
 
 		 433 aa  53.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  24.74 
 
 		 799 aa  53.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1414  restriction modification system DNA specificity domain  26.48 
 
 		 447 aa  52.8  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00014984  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0615  restriction modification system DNA specificity subunit  20.89 
 
 		 417 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0545068  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0513  hypothetical protein  33.93 
 
 		 153 aa  50.1  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2792  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.95 
 
 		 423 aa  50.1  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4917  restriction modification system DNA specificity subunit  20.78 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.544675 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0102  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.45 
 
 		 442 aa  49.3  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13680  hypothetical protein  23.22 
 
 		 354 aa  49.3  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.247083  normal  0.424884 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1158  restriction modification system DNA specificity subunit  22.34 
 
 		 454 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000117149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03130  hypothetical protein  23.53 
 
 		 208 aa  47.4  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0551237  hitchhiker  0.00000000000000986658 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  24.5 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22810  hypothetical protein  22.5 
 
 		 418 aa  46.6  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2722  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.05 
 
 		 385 aa  45.8  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0988  type I restriction-modification system, S subunit  22.17 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0959  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.01 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4714  restriction modification system DNA specificity domain  26.05 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.232226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  24.3 
 
 		 425 aa  44.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3109  restriction modification system DNA specificity subunit  24.51 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2009  restriction modification system DNA specificity domain  31.13 
 
 		 423 aa  44.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.999718  normal  0.91224 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2378  type I restriction-modification system, S subunit  31.13 
 
 		 383 aa  44.3  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0268  restriction endonuclease S subunits  24.82 
 
 		 444 aa  44.3  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  21.85 
 
 		 374 aa  43.5  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.47 
 
 		 477 aa  43.1  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  25.96 
 
 		 432 aa  43.1  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>