32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0232 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0232  restriction endonuclease S subunit-like protein  100 
 
 		 192 aa  395  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0262  type I restriction-modification system specificity determinant  88.95 
 
 		 360 aa  354  5e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.874092  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2652  Restriction endonuclease S subunits-like protein  39.23 
 
 		 413 aa  118  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.252104  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0513  hypothetical protein  37.96 
 
 		 153 aa  87  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3109  restriction modification system DNA specificity subunit  29.53 
 
 		 426 aa  72  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0829  type I restriction-modification system, S subunit  33.04 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232689  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  33.04 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.75 
 
 		 457 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1366  hypothetical protein  26.97 
 
 		 462 aa  55.5  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  31.25 
 
 		 456 aa  55.8  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1566  restriction modification system DNA specificity subunit  43.08 
 
 		 403 aa  54.3  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0293394  unclonable  0.0000192379 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0334  restriction modification system DNA specificity domain  29.51 
 
 		 430 aa  53.9  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.284396 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1176  restriction modification system DNA specificity subunit  44.83 
 
 		 408 aa  53.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.882603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2277  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.93 
 
 		 433 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  hitchhiker  0.00000677276 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5008  Restriction endonuclease S subunits-like protein  23.65 
 
 		 465 aa  48.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2688  restriction endonuclease S subunits-like  25 
 
 		 487 aa  47.8  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.165356  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05614  type I restriction-modification system S subunit  26.92 
 
 		 432 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1158  restriction modification system DNA specificity subunit  25.42 
 
 		 454 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000117149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2875  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.92 
 
 		 390 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2792  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.91 
 
 		 423 aa  46.2  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1091  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.07 
 
 		 444 aa  43.5  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17387  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  23.2 
 
 		 425 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1805  restriction modification system DNA specificity domain protein  25 
 
 		 423 aa  42.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.745604  normal  0.535567 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0900  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.17 
 
 		 471 aa  42.4  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.963501 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.7 
 
 		 477 aa  42  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  21.43 
 
 		 435 aa  42  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1225  hypothetical protein  32.04 
 
 		 459 aa  42  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.438073 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03610  type I site-specific deoxyribonuclease  21.71 
 
 		 360 aa  41.6  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4714  restriction modification system DNA specificity domain  24.06 
 
 		 380 aa  41.6  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.232226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3180  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.28 
 
 		 390 aa  41.6  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0390  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.13 
 
 		 642 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219621 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0854  restriction modification system DNA specificity subunit  23.12 
 
 		 595 aa  41.2  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221182  normal  0.0643125 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>