117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0842 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0842  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  920    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.229597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0264  restriction modification system DNA specificity subunit  55.21 
 
 		 407 aa  224  3e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003235  type I restriction-modification system specificity subunit S  32.79 
 
 		 437 aa  206  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1221  restriction modification system DNA specificity subunit  33.69 
 
 		 463 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1783  restriction modification system DNA specificity subunit  48.44 
 
 		 448 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2939  type I restriction-modification system  30.09 
 
 		 432 aa  181  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0304782 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0487  restriction modification system DNA specificity subunit  30.23 
 
 		 438 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  0.0187002 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2176  restriction modification system DNA specificity subunit  31.74 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.962317  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1860  type I restriction enzyme, S subunit  29.26 
 
 		 474 aa  173  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0504746  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19070  hypothetical protein  30.41 
 
 		 425 aa  172  1e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0871344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0193  type I restriction-modification system specificity determinant  28.41 
 
 		 416 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3443  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.73 
 
 		 445 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3571  hypothetical protein  31.21 
 
 		 458 aa  150  4e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2200  type I restriction-modification system specificity subunit  28.12 
 
 		 461 aa  149  9e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.844306  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0233  restriction modification system DNA specificity subunit  27.09 
 
 		 461 aa  147  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0967889  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2268  putative type I restriction enzyme, S subunit  28.07 
 
 		 457 aa  145  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0796  restriction modification system DNA specificity domain  28.86 
 
 		 441 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343889 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1327  restriction modification system DNA specificity subunit  29.79 
 
 		 431 aa  145  2e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280518 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0277  restriction modification system DNA specificity subunit  26.9 
 
 		 413 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4761  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  28.71 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0277  hypothetical protein  29.38 
 
 		 474 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0416  type I restriction-modification system S subunit  26.97 
 
 		 457 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0531711 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0658  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.62 
 
 		 473 aa  141  3e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2688  restriction endonuclease S subunits-like  26.2 
 
 		 487 aa  138  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.165356  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0750  putative type I restriction-modification system  30.3 
 
 		 436 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.769779  normal  0.272821 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3940  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.05 
 
 		 453 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0640  restriction modification system DNA specificity subunit  30.3 
 
 		 447 aa  131  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1015  hypothetical protein  27.46 
 
 		 477 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3989  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.77 
 
 		 456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0737122 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1366  putative type I site-specific restriction-modification system, S subunit  27.19 
 
 		 422 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0493853  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  26.09 
 
 		 422 aa  126  9e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1153  restriction modification system DNA specificity subunit  26.36 
 
 		 429 aa  123  8e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0076  type I restriction-modification system subunit S  23.75 
 
 		 464 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2869  type I restriction-modification system, S subunit  26.39 
 
 		 448 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0947716  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2226  restriction modification system DNA specificity subunit  25.33 
 
 		 451 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.890862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  23.21 
 
 		 456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0414  restriction modification system DNA specificity subunit  25.11 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.405933  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1366  hypothetical protein  32.84 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4472  restriction modification system DNA specificity subunit  26.71 
 
 		 415 aa  107  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.270866  normal  0.0902542 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0599  type I restriction-modification system, S subunit  24.57 
 
 		 458 aa  107  5e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1064  type I restriction-modification  22.77 
 
 		 453 aa  102  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000898872  normal  0.027841 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1791  restriction modification system DNA specificity subunit  23.24 
 
 		 419 aa  101  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1544  restriction modification system DNA specificity domain protein  41.72 
 
 		 374 aa  100  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1516  restriction modification system DNA specificity subunit  23.52 
 
 		 395 aa  100  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.205219 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3358  restriction modification system DNA specificity subunit  22.88 
 
 		 429 aa  100  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0521612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1551  type I restriction enzyme  32.66 
 
 		 439 aa  100  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6260  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.28 
 
 		 441 aa  99.8  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0455  restriction modification system DNA specificity subunit  34.78 
 
 		 403 aa  95.9  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0467  restriction modification system DNA specificity subunit  34.78 
 
 		 403 aa  95.9  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2682  putative restriction endonuclease S subunit  30.1 
 
 		 400 aa  94.7  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.845062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1671  restriction modification system DNA specificity subunit  25.71 
 
 		 442 aa  92.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.517259  hitchhiker  0.00037426 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2607  restriction modification system DNA specificity subunit  23.99 
 
 		 462 aa  92.8  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.61 
 
 		 462 aa  92  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1481  restriction endonuclease S subunits-like protein  23.98 
 
 		 443 aa  88.2  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2606  restriction modification system DNA specificity subunit  24.6 
 
 		 429 aa  87  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2621  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.04 
 
 		 400 aa  79  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  25.7 
 
 		 425 aa  79  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0959  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.84 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0988  type I restriction-modification system, S subunit  31.93 
 
 		 401 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.71 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2698  restriction modification system DNA specificity subunit  25.88 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0854775  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2397  restriction modification system DNA specificity domain  24.84 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0768  N-6 DNA methylase  26.37 
 
 		 799 aa  67.8  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.161666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2194  restriction modification system DNA specificity subunit  25.73 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.122675  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03180  hypothetical protein  33.59 
 
 		 159 aa  66.2  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000950219 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1960  restriction endonuclease S subunit  21.34 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.323459  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0556  type I restriction enzyme, specificity subunit  26.22 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0239636  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0841  type I restriction-modification system, S subunit  26.84 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0789  type I restriction-modification system, S subunit  22.54 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190219  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1220  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.21 
 
 		 620 aa  62.4  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1536  restriction modification system DNA specificity domain  20.16 
 
 		 364 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0500  restriction modification system DNA specificity subunit  22.8 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.565018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4455  restriction modification system DNA specificity subunit  29.44 
 
 		 388 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.353509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0005  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.89 
 
 		 378 aa  59.3  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.39 
 
 		 457 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1225  hypothetical protein  33.04 
 
 		 459 aa  59.3  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.438073 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  24.15 
 
 		 390 aa  59.7  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000269296  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13680  hypothetical protein  24.36 
 
 		 354 aa  57  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.247083  normal  0.424884 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1160  restriction modification system DNA specificity subunit  29.93 
 
 		 407 aa  57  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1216  restriction modification system DNA specificity subunit  21.01 
 
 		 427 aa  57  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  26.26 
 
 		 429 aa  57  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2009  restriction modification system DNA specificity domain  20.2 
 
 		 423 aa  57  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.999718  normal  0.91224 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3550  restriction modification system DNA specificity subunit  22.15 
 
 		 417 aa  55.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257959  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03130  hypothetical protein  23.78 
 
 		 208 aa  55.8  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0551237  hitchhiker  0.00000000000000986658 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3109  restriction modification system DNA specificity subunit  23.75 
 
 		 426 aa  54.7  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1526  restriction endonuclease S subunits-like  37.08 
 
 		 386 aa  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0249  restriction modification system DNA specificity subunit  21.89 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0808  specificity determinant HsdS-like  23 
 
 		 363 aa  51.2  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.361917  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2378  type I restriction-modification system, S subunit  20.1 
 
 		 383 aa  50.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  21.99 
 
 		 435 aa  50.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3515  restriction modification system DNA specificity domain  26.59 
 
 		 514 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1842  restriction modification system DNA specificity subunit  24.11 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  21.66 
 
 		 439 aa  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3055  restriction modification system DNA specificity subunit  25.35 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.363566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2689  restriction modification system DNA specificity subunit  26.85 
 
 		 290 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.841682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0041  restriction modification system DNA specificity subunit  24.69 
 
 		 397 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1643  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.17 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1091  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.94 
 
 		 444 aa  47.4  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17387  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  25.68 
 
 		 374 aa  47.4  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  23.08 
 
 		 429 aa  47.4  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>