112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_A0789 on replicon NC_009504
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0841  type I restriction-modification system, S subunit  99.75 
 
 		 407 aa  835    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0789  type I restriction-modification system, S subunit  100 
 
 		 407 aa  838    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190219  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  28.3 
 
 		 425 aa  153  5e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3425  restriction endonuclease S subunits-like  32.82 
 
 		 390 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835151  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1176  restriction modification system DNA specificity subunit  31.08 
 
 		 408 aa  119  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.882603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1671  restriction modification system DNA specificity subunit  23.99 
 
 		 442 aa  111  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.517259  hitchhiker  0.00037426 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0198  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.77 
 
 		 386 aa  107  5e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.719886  decreased coverage  0.000218103 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3550  restriction modification system DNA specificity subunit  27.75 
 
 		 417 aa  95.1  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257959  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0988  type I restriction-modification system, S subunit  22.57 
 
 		 401 aa  93.2  6e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0599  type I restriction-modification system, S subunit  28.36 
 
 		 458 aa  93.2  7e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  21.11 
 
 		 438 aa  90.5  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.26 
 
 		 457 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  25.58 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7555  Restriction endonuclease S subunits-like protein  25.85 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1502  restriction modification system DNA specificity domain  28.4 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003235  type I restriction-modification system specificity subunit S  21.56 
 
 		 437 aa  76.6  0.0000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1095  hypothetical protein  27.79 
 
 		 401 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  24.73 
 
 		 456 aa  74.7  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  23.61 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3129  restriction modification system DNA specificity subunit  28 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.343622  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0448  restriction modification system DNA specificity domain  24.05 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000159098 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  23.27 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  26.15 
 
 		 435 aa  71.2  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2621  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.29 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2397  restriction modification system DNA specificity domain  27.39 
 
 		 417 aa  69.7  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1566  restriction modification system DNA specificity subunit  24.62 
 
 		 403 aa  67.4  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0293394  unclonable  0.0000192379 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2452  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  25.35 
 
 		 419 aa  67  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.587532 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2939  type I restriction-modification system  28.7 
 
 		 432 aa  66.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0304782 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3953  restriction modification system DNA specificity domain protein  36.21 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1216  restriction modification system DNA specificity subunit  22.28 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2673  restriction modification system DNA specificity subunit  27.98 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.574489 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0277  hypothetical protein  28.5 
 
 		 474 aa  64.7  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3120  hypothetical protein  28.5 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.239583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3540  restriction modification system DNA specificity subunit  27.59 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2268  putative type I restriction enzyme, S subunit  27.96 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4821  type I restriction-modification system, endonuclease S subunit  22.04 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0842  hypothetical protein  22.54 
 
 		 446 aa  63.5  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.229597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2909  restriction modification system DNA specificity subunit  23.73 
 
 		 440 aa  63.2  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1091  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.67 
 
 		 444 aa  62.8  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17387  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  22.95 
 
 		 549 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0864  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.89 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0102  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.33 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2724  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.51 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3132  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.46 
 
 		 424 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.474681 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2009  restriction modification system DNA specificity domain  25.82 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.999718  normal  0.91224 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17660  restriction endonuclease S subunit  33.66 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1160  restriction modification system DNA specificity subunit  25.79 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0842  type I restriction-modification enzyme, S subunit, putative  25.45 
 
 		 476 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  27.81 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0455  restriction modification system DNA specificity subunit  24.32 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0467  restriction modification system DNA specificity subunit  24.32 
 
 		 403 aa  58.9  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0287  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  30.53 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3109  restriction modification system DNA specificity subunit  22.02 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  21.5 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2097  restriction modification system DNA specificity subunit  31.18 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2346  restriction modification system DNA specificity subunit  25.13 
 
 		 392 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104931  normal  0.0105772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0035  hypothetical protein  24.69 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0504  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.27 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.81 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0487  restriction modification system DNA specificity subunit  22.38 
 
 		 438 aa  56.6  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  0.0187002 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0193  type I restriction-modification system specificity determinant  22.49 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1095  restriction modification system DNA specificity subunit  26.96 
 
 		 450 aa  55.8  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1960  restriction endonuclease S subunit  24.61 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.323459  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.46 
 
 		 462 aa  55.8  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03150  hypothetical protein  27.81 
 
 		 182 aa  55.8  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.223184  hitchhiker  0.0000000000000424002 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0829  type I restriction-modification system, S subunit  24.02 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232689  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  20.66 
 
 		 425 aa  53.9  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  21.05 
 
 		 425 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1103  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.74 
 
 		 400 aa  54.3  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0442932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0132  restriction modification system DNA specificity subunit  23.48 
 
 		 427 aa  53.9  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47299 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4042  restriction modification system DNA specificity subunit  22.2 
 
 		 428 aa  53.5  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3571  hypothetical protein  28.38 
 
 		 458 aa  53.5  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0160  restriction modification system DNA specificity subunit  36.17 
 
 		 399 aa  53.1  0.000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4083  restriction modification system DNA specificity subunit  24.07 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1805  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.69 
 
 		 423 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.745604  normal  0.535567 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1220  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.79 
 
 		 620 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2378  type I restriction-modification system, S subunit  25.49 
 
 		 383 aa  51.2  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  23.33 
 
 		 422 aa  50.8  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1037  restriction modification system DNA specificity domain  24.38 
 
 		 364 aa  50.8  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0890662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2257  restriction endonuclease S subunits-like protein  22.01 
 
 		 413 aa  50.4  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1978  restriction modification system DNA specificity subunit  27.17 
 
 		 616 aa  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  21.64 
 
 		 433 aa  50.1  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03130  hypothetical protein  24.23 
 
 		 208 aa  50.1  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0551237  hitchhiker  0.00000000000000986658 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2792  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.13 
 
 		 423 aa  50.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1307  restriction modification system DNA specificity subunit  21.45 
 
 		 285 aa  49.7  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1643  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.26 
 
 		 428 aa  49.7  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0508  restriction modification system DNA specificity subunit  27.59 
 
 		 511 aa  49.7  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0149  restriction modification system DNA specificity subunit  20.87 
 
 		 400 aa  49.7  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1576  type I restriction-modification system, S subunit  23.14 
 
 		 399 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.200835  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0871  restriction modification system DNA specificity subunit  25.4 
 
 		 211 aa  47.8  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0745  restriction modification system DNA specificity domain  21.76 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.189202  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5276  restriction modification system DNA specificity subunit  28.44 
 
 		 418 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0878  type I restriction modification system methylase  35 
 
 		 424 aa  47  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.707045 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1859  restriction modification system DNA specificity subunit  23.44 
 
 		 409 aa  47  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.777891  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1894  restriction modification system DNA specificity subunit  23.44 
 
 		 409 aa  47  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.850685  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1551  type I restriction enzyme  22.69 
 
 		 439 aa  47  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0264  restriction modification system DNA specificity subunit  24.75 
 
 		 407 aa  46.6  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3297  restriction modification system DNA specificity subunit  23.5 
 
 		 430 aa  46.6  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489204 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3525  restriction modification system DNA specificity subunit  20.27 
 
 		 420 aa  45.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2689  restriction modification system DNA specificity subunit  27.92 
 
 		 290 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.841682  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>