118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_17660 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_17660  restriction endonuclease S subunit  100 
 
 
416 aa  857    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  28.44 
 
 
432 aa  120  6e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  47.33 
 
 
775 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1502  restriction modification system DNA specificity domain  28.45 
 
 
393 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7555  Restriction endonuclease S subunits-like protein  36.11 
 
 
402 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2097  restriction modification system DNA specificity subunit  25.12 
 
 
393 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3540  restriction modification system DNA specificity subunit  24.33 
 
 
387 aa  98.6  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1176  restriction modification system DNA specificity subunit  30.71 
 
 
408 aa  90.9  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.882603  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3471  restriction modification system DNA specificity domain protein  38.46 
 
 
419 aa  90.1  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4241  restriction modification system DNA specificity subunit  24.71 
 
 
411 aa  87  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.491612  hitchhiker  0.00127278 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  24.64 
 
 
426 aa  86.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2421  restriction modification system DNA specificity subunit  35.75 
 
 
402 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.44 
 
 
429 aa  84  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4472  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.25 
 
 
428 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3425  restriction endonuclease S subunits-like  32.41 
 
 
390 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835151  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  25 
 
 
425 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1060  restriction modification system DNA specificity subunit  27.23 
 
 
397 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0829  type I restriction-modification system, S subunit  24.75 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232689  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1433  restriction modification system DNA specificity subunit  23.46 
 
 
372 aa  77.4  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1170  restriction modification system DNA specificity subunit  28.21 
 
 
402 aa  73.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.249165  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  22.62 
 
 
456 aa  72  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3953  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.83 
 
 
413 aa  70.9  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.76 
 
 
462 aa  69.3  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0750  restriction endonuclease S subunit  39.17 
 
 
387 aa  68.6  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.48 
 
 
457 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  22.22 
 
 
447 aa  67  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.86 
 
 
477 aa  67  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4454  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.52 
 
 
406 aa  67  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.859615  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0448  restriction modification system DNA specificity domain  36.63 
 
 
435 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000159098 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3550  restriction modification system DNA specificity subunit  29.08 
 
 
417 aa  65.1  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257959  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2652  Restriction endonuclease S subunits-like protein  23.17 
 
 
413 aa  65.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.252104  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2397  restriction modification system DNA specificity domain  28.19 
 
 
417 aa  65.5  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0836  type I restriction-modification system S subunit  23.53 
 
 
416 aa  64.7  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444813  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0871  restriction modification system DNA specificity subunit  27.23 
 
 
211 aa  64.3  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3109  restriction modification system DNA specificity subunit  21.26 
 
 
426 aa  64.3  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1941  restriction endonuclease S subunits-like  23.01 
 
 
451 aa  64.3  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0182546  normal  0.0682578 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3525  restriction modification system DNA specificity subunit  26.43 
 
 
420 aa  64.3  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2364  restriction modification system DNA specificity subunit  22.35 
 
 
413 aa  62.4  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.188022 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3382  restriction modification system DNA specificity subunit  23.16 
 
 
485 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1536  hypothetical protein  22.72 
 
 
380 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00344436  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1219  restriction modification system DNA specificity domain  33.93 
 
 
412 aa  62.4  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2665  type I restriction-modification system specificity subunit  25.59 
 
 
446 aa  62.4  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0650221  normal  0.332066 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4778  restriction modification system DNA specificity subunit  23.13 
 
 
415 aa  62  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16943  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1643  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.58 
 
 
428 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3129  restriction modification system DNA specificity subunit  22.82 
 
 
416 aa  60.8  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.343622  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1220  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.05 
 
 
620 aa  60.8  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2285  hypothetical protein  23.72 
 
 
425 aa  60.8  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0313194  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3144  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.79 
 
 
412 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527027  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2452  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  23.14 
 
 
419 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.587532 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0845  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.48 
 
 
495 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31571e-19 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0599  type I restriction-modification system, S subunit  42.35 
 
 
458 aa  60.5  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0841  type I restriction-modification system, S subunit  33.66 
 
 
407 aa  60.1  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0789  type I restriction-modification system, S subunit  33.66 
 
 
407 aa  60.1  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190219  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0637  restriction modification system DNA specificity domain  24.16 
 
 
422 aa  60.1  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0041  restriction modification system DNA specificity subunit  23.15 
 
 
397 aa  60.1  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2237  restriction modification system DNA specificity subunit  24.37 
 
 
412 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  26.19 
 
 
390 aa  57  0.0000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000269296  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1307  restriction modification system DNA specificity subunit  26.88 
 
 
285 aa  56.6  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3132  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.83 
 
 
424 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.474681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3089  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.27 
 
 
520 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1635  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.94 
 
 
419 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0235263  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3549  restriction modification system DNA specificity subunit  24.2 
 
 
296 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348533  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4821  type I restriction-modification system, endonuclease S subunit  28.18 
 
 
382 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0005  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.19 
 
 
378 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1015  hypothetical protein  26.74 
 
 
477 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20210  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.77 
 
 
565 aa  52.4  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266778  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0987  restriction modification system DNA specificity subunit  24.88 
 
 
390 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0287  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  22.8 
 
 
471 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5276  restriction modification system DNA specificity subunit  25.83 
 
 
418 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2415  restriction modification system DNA specificity domain  23.2 
 
 
418 aa  52.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.589349  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2791  type I restriction-modification system, S subunit  23.2 
 
 
418 aa  52.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0504  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.87 
 
 
408 aa  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1195  type II restriction-modification enzyme  28.83 
 
 
1343 aa  51.2  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0149  restriction modification system DNA specificity subunit  24.73 
 
 
400 aa  51.6  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  24.22 
 
 
438 aa  51.2  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2722  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.63 
 
 
385 aa  51.6  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3757  restriction modification system S subunit  22.42 
 
 
436 aa  51.2  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.386531  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2909  restriction modification system DNA specificity subunit  21.2 
 
 
440 aa  50.8  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04178  hypothetical protein  28.74 
 
 
236 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.695524  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3940  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.83 
 
 
453 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1201  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.49 
 
 
572 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  30.25 
 
 
549 aa  50.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1566  restriction modification system DNA specificity subunit  25.48 
 
 
403 aa  50.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0293394  unclonable  0.0000192379 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3297  restriction modification system DNA specificity subunit  22.95 
 
 
430 aa  50.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000489204 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0035  hypothetical protein  43.1 
 
 
400 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.89444 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0508  restriction modification system DNA specificity subunit  33.04 
 
 
511 aa  50.1  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05614  type I restriction-modification system S subunit  19.55 
 
 
432 aa  49.7  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1087  type I restriction-modification system, S subunit  21.85 
 
 
422 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.247708  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2724  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.01 
 
 
409 aa  49.7  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0223  putative HsdS protein  21.77 
 
 
438 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2016  restriction modification system DNA specificity subunit  22.67 
 
 
417 aa  48.9  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0839323  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3599  hypothetical protein  30.77 
 
 
482 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0864  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.7 
 
 
413 aa  47.8  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  20.83 
 
 
425 aa  47.8  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0333  restriction modification system DNA specificity subunit  23.02 
 
 
371 aa  47.4  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1027  restriction modification system DNA specificity subunit  23.57 
 
 
420 aa  47.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3246  hypothetical protein  23.87 
 
 
454 aa  47.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2978  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.48 
 
 
194 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.79 
 
 
422 aa  47  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2328  type I restriction-modification system specificity subunit  26.22 
 
 
404 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>