46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3599 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3599  hypothetical protein  100 
 
 		 482 aa  990    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3246  hypothetical protein  26.56 
 
 		 454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5291  hypothetical protein  28.69 
 
 		 555 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.673527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1144  restriction modification system DNA specificity subunit  27.29 
 
 		 473 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0545  hypothetical protein  24.11 
 
 		 701 aa  103  5e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0845  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.39 
 
 		 495 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31571e-19 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0501  restriction modification system DNA specificity subunit  34.43 
 
 		 612 aa  89  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.435558 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  40.57 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000269296  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0686  type I restriction-modification system, S subunit, putative  34.18 
 
 		 561 aa  79  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.840975  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0835  restriction modification system DNA specificity domain  34.18 
 
 		 563 aa  79  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.835919  normal  0.945638 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2875  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.19 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3199  restriction modification system DNA specificity subunit  30 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1061  putative type I restriction-modification system, S subunit  29.65 
 
 		 528 aa  71.2  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02063  type I restriction-modification system, S subunit  31.54 
 
 		 501 aa  67.8  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2173  hypothetical protein  35.34 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.11275  normal  0.026924 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0920  hypothetical protein  22.96 
 
 		 460 aa  60.8  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  27.46 
 
 		 425 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0727  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.62 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0968972 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0102  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.95 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  28.22 
 
 		 425 aa  56.6  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0564  restriction modification system DNA specificity subunit  26.01 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00017151  decreased coverage  6.20122e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0355  restriction modification system DNA specificity subunit  30.2 
 
 		 590 aa  54.7  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3272  type I restriction-modification system specificity subunit  25.71 
 
 		 492 aa  54.3  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425878  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2237  restriction modification system DNA specificity subunit  23.97 
 
 		 412 aa  53.9  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2467  restriction modification system DNA specificity domain  29.71 
 
 		 438 aa  52.8  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1201  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.66 
 
 		 572 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1032  restriction modification system DNA specificity subunit  25.12 
 
 		 457 aa  52  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41908  normal  0.322454 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  27.34 
 
 		 429 aa  51.2  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3537  putative type I restriction-modification system, S subunit  32.75 
 
 		 419 aa  50.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4163  restriction modification system DNA specificity subunit  34.81 
 
 		 405 aa  50.8  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.864984  normal  0.0584456 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04178  hypothetical protein  28.15 
 
 		 236 aa  50.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.695524  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5244  restriction modification system DNA specificity domain  30.41 
 
 		 422 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  26.27 
 
 		 438 aa  49.7  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1481  restriction endonuclease S subunits-like protein  24.19 
 
 		 443 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2194  restriction modification system DNA specificity subunit  24.19 
 
 		 427 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.122675  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.91 
 
 		 427 aa  48.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0076  type I restriction-modification system subunit S  25 
 
 		 464 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7555  Restriction endonuclease S subunits-like protein  27.16 
 
 		 402 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0637  restriction modification system DNA specificity domain  23.19 
 
 		 422 aa  47  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0268  restriction endonuclease S subunits  27.85 
 
 		 444 aa  47  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0233  restriction modification system DNA specificity subunit  21.5 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0967889  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0878  type I restriction modification system methylase  32.39 
 
 		 424 aa  44.7  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.707045 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17660  restriction endonuclease S subunit  29.66 
 
 		 416 aa  43.9  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3711  hypothetical protein  37.5 
 
 		 92 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2366  N-6 DNA methylase  26.53 
 
 		 600 aa  43.5  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.192506 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2364  restriction modification system DNA specificity subunit  28.57 
 
 		 413 aa  43.5  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.188022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>