140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_04178 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012892  B21_04178  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.695524  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4264  type I restriction-modification system, S subunit  45.99 
 
 		 495 aa  206  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4930  type I restriction enzyme StySJI specificity protein  55.66 
 
 		 469 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3649  restriction modification system DNA specificity domain protein  52.97 
 
 		 464 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1672  restriction modification system DNA specificity domain protein  53.49 
 
 		 493 aa  189  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2960  restriction modification system DNA specificity subunit  45.33 
 
 		 587 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3673  restriction modification system DNA specificity domain protein  45.45 
 
 		 459 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  56.15 
 
 		 435 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4742  type I restriction-modification system, S subunit  35.18 
 
 		 576 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266617  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02063  type I restriction-modification system, S subunit  38.03 
 
 		 501 aa  123  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0822  restriction modification system DNA specificity subunit  32.11 
 
 		 577 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0845  restriction modification system DNA specificity domain protein  33.63 
 
 		 495 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31571e-19 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3540  restriction modification system DNA specificity subunit  33.52 
 
 		 387 aa  99.8  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0614  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.26 
 
 		 401 aa  94  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1032  restriction modification system DNA specificity subunit  34.68 
 
 		 457 aa  89.7  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41908  normal  0.322454 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1551  type I restriction enzyme  28.89 
 
 		 439 aa  89  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2093  restriction modification system DNA specificity subunit  31.37 
 
 		 477 aa  85.5  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3272  type I restriction-modification system specificity subunit  30.54 
 
 		 492 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425878  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3199  restriction modification system DNA specificity subunit  32.35 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4454  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.95 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.859615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1095  restriction modification system DNA specificity subunit  26.72 
 
 		 450 aa  76.6  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3653  type I restriction enzyme StySPI specificity protein  31.13 
 
 		 460 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.234587  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2421  restriction modification system DNA specificity subunit  28.24 
 
 		 402 aa  75.9  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1492  restriction modification system DNA specificity subunit  26.15 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0501  restriction modification system DNA specificity subunit  30.77 
 
 		 612 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.435558 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1204  restriction modification system DNA specificity subunit  27.5 
 
 		 547 aa  73.2  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3089  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.95 
 
 		 520 aa  72.4  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2652  Restriction endonuclease S subunits-like protein  28.16 
 
 		 413 aa  72  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.252104  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0900  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.98 
 
 		 471 aa  72  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.963501 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3180  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.44 
 
 		 390 aa  69.3  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0854  restriction modification system DNA specificity subunit  29.13 
 
 		 595 aa  68.9  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221182  normal  0.0643125 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1237  restriction modification system DNA specificity subunit  27.38 
 
 		 633 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1991  restriction modification system DNA specificity domain  28.29 
 
 		 490 aa  67.8  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120232  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0686  type I restriction-modification system, S subunit, putative  27.38 
 
 		 561 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.840975  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3030  restriction modification system DNA specificity subunit  29.48 
 
 		 564 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0086  restriction modification system DNA specificity protein  42.7 
 
 		 538 aa  67.4  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3599  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.73 
 
 		 532 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.743632  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0835  restriction modification system DNA specificity domain  27.38 
 
 		 563 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.835919  normal  0.945638 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2744  type I restriction-modification system, S subunit  29.11 
 
 		 532 aa  66.6  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0181132  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2097  restriction modification system DNA specificity subunit  24.71 
 
 		 393 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  26.18 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000269296  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3471  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.28 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0508  restriction modification system DNA specificity subunit  29.55 
 
 		 511 aa  63.2  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1635  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.37 
 
 		 419 aa  62.4  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0235263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4611  restriction modification system DNA specificity subunit  23.16 
 
 		 561 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.483614  hitchhiker  0.0000795371 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1398  restriction modification system DNA specificity subunit  25.62 
 
 		 557 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  33.6 
 
 		 775 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0727  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.09 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0968972 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1414  restriction modification system DNA specificity domain  30.08 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00014984  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2862  restriction modification system DNA specificity subunit  26.26 
 
 		 589 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  26.61 
 
 		 611 aa  60.1  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184495 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1061  putative type I restriction-modification system, S subunit  26.63 
 
 		 528 aa  59.7  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3515  restriction modification system DNA specificity domain  26 
 
 		 514 aa  59.3  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2875  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.69 
 
 		 390 aa  58.9  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1859  restriction modification system DNA specificity subunit  32.41 
 
 		 409 aa  58.9  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.777891  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1894  restriction modification system DNA specificity subunit  32.41 
 
 		 409 aa  58.9  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.850685  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0745  restriction modification system DNA specificity domain  31.2 
 
 		 411 aa  58.9  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.189202  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0268  restriction endonuclease S subunits  24.64 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1481  restriction endonuclease S subunits-like protein  25.14 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0605  restriction modification system DNA specificity subunit  28.12 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1060  restriction modification system DNA specificity subunit  31.69 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.41 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  28.49 
 
 		 425 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0233  restriction modification system DNA specificity subunit  23.2 
 
 		 461 aa  57  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0967889  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1160  restriction modification system DNA specificity subunit  25.86 
 
 		 407 aa  56.6  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1170  restriction modification system DNA specificity subunit  26.36 
 
 		 402 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.249165  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1911  hypothetical protein  30.08 
 
 		 453 aa  56.2  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.568524  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0285  N-6 DNA methylase  27.56 
 
 		 634 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  26.52 
 
 		 730 aa  55.8  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0735  restriction modification system DNA specificity subunit  28.4 
 
 		 392 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0878  type I restriction modification system methylase  27.45 
 
 		 424 aa  55.5  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.707045 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2740  type I restriction-modification system, S subunit, truncation  27.08 
 
 		 162 aa  55.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0987272  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4139  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.7 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3940  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.86 
 
 		 453 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03610  type I site-specific deoxyribonuclease  24.29 
 
 		 360 aa  55.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  23.5 
 
 		 425 aa  53.9  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1261  N-6 DNA methylase  28.91 
 
 		 1362 aa  53.1  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3440  N-6 DNA methylase  27.49 
 
 		 629 aa  52.8  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000836739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1015  hypothetical protein  23.84 
 
 		 477 aa  52.4  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2893  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.44 
 
 		 237 aa  52.4  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1201  restriction modification system DNA specificity domain protein  25 
 
 		 572 aa  52  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1502  restriction modification system DNA specificity domain  25.86 
 
 		 393 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0842  type I restriction-modification enzyme, S subunit, putative  25.9 
 
 		 476 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1360  restriction modification system DNA specificity subunit  26.7 
 
 		 453 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2364  restriction modification system DNA specificity subunit  28.87 
 
 		 413 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.188022 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1778  type I restriction-modification system specificity subunit  21.71 
 
 		 419 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.926504  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17660  restriction endonuclease S subunit  28.74 
 
 		 416 aa  50.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0355  restriction modification system DNA specificity subunit  25.55 
 
 		 590 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3599  hypothetical protein  28.15 
 
 		 482 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1978  restriction modification system DNA specificity subunit  27.27 
 
 		 616 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0149  restriction modification system DNA specificity subunit  31.4 
 
 		 400 aa  49.3  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0564  restriction modification system DNA specificity subunit  26.49 
 
 		 415 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00017151  decreased coverage  6.20122e-17 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0076  type I restriction-modification system subunit S  19.9 
 
 		 464 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2409  restriction modification system DNA specificity subunit  26.23 
 
 		 442 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1015  restriction modification system DNA specificity subunit  21.39 
 
 		 575 aa  47.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6044  type I restriction-modification system subunit S  29.9 
 
 		 547 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.061065  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1281  restriction modification system DNA specificity subunit  32.53 
 
 		 398 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.2 
 
 		 462 aa  47.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1500  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.62 
 
 		 398 aa  47.8  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.100633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4622  Restriction endonuclease S subunits-like protein  24.85 
 
 		 411 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.156513 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>