190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1492 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1492  restriction modification system DNA specificity subunit  100 
 
 		 479 aa  983    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2093  restriction modification system DNA specificity subunit  41.85 
 
 		 477 aa  281  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0508  restriction modification system DNA specificity subunit  38.11 
 
 		 511 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1414  restriction modification system DNA specificity domain  39.66 
 
 		 447 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00014984  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0854  restriction modification system DNA specificity subunit  36.58 
 
 		 595 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221182  normal  0.0643125 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3272  type I restriction-modification system specificity subunit  36.88 
 
 		 492 aa  242  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425878  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4611  restriction modification system DNA specificity subunit  32.19 
 
 		 561 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.483614  hitchhiker  0.0000795371 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1204  restriction modification system DNA specificity subunit  33.53 
 
 		 547 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340549  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0086  restriction modification system DNA specificity protein  35.32 
 
 		 538 aa  205  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1991  restriction modification system DNA specificity domain  36.75 
 
 		 490 aa  193  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120232  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3515  restriction modification system DNA specificity domain  29.52 
 
 		 514 aa  160  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4714  restriction modification system DNA specificity domain  30.43 
 
 		 380 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.232226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0822  restriction modification system DNA specificity subunit  26.54 
 
 		 577 aa  146  9e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0845  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.01 
 
 		 495 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31571e-19 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1032  restriction modification system DNA specificity subunit  25 
 
 		 457 aa  139  7.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41908  normal  0.322454 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02063  type I restriction-modification system, S subunit  31.09 
 
 		 501 aa  139  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3649  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.96 
 
 		 464 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3777  restriction endonuclease S subunits-like protein  28.29 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3850  restriction endonuclease S subunits-like protein  28.29 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.85 
 
 		 477 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2862  restriction modification system DNA specificity subunit  27.09 
 
 		 589 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0900  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.49 
 
 		 471 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.963501 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2960  restriction modification system DNA specificity subunit  26.65 
 
 		 587 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2409  restriction modification system DNA specificity subunit  26.45 
 
 		 442 aa  126  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0842  type I restriction-modification enzyme, S subunit, putative  26.63 
 
 		 476 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4264  type I restriction-modification system, S subunit  25.75 
 
 		 495 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  27.01 
 
 		 611 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184495 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1160  restriction modification system DNA specificity subunit  35.15 
 
 		 407 aa  117  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3089  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.91 
 
 		 520 aa  116  8.999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1095  restriction modification system DNA specificity subunit  25.92 
 
 		 450 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2976  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.88 
 
 		 238 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1237  restriction modification system DNA specificity subunit  29.11 
 
 		 633 aa  102  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3717  restriction modification system DNA specificity subunit  25.92 
 
 		 427 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3719  restriction modification system DNA specificity subunit  23.19 
 
 		 585 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1015  restriction modification system DNA specificity subunit  21.37 
 
 		 575 aa  93.6  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20210  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.77 
 
 		 565 aa  93.2  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266778  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  29.19 
 
 		 435 aa  93.2  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2496  subunit S of type I restriction-modification system  24.54 
 
 		 565 aa  93.2  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00268922  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3144  restriction modification system DNA specificity domain protein  36.09 
 
 		 412 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4930  type I restriction enzyme StySJI specificity protein  25.13 
 
 		 469 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0268  restriction endonuclease S subunits  26.07 
 
 		 444 aa  90.9  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2378  type I restriction-modification system, S subunit  32.4 
 
 		 383 aa  90.5  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2009  restriction modification system DNA specificity domain  32.77 
 
 		 423 aa  90.1  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.999718  normal  0.91224 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1398  restriction modification system DNA specificity subunit  22.46 
 
 		 557 aa  89.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2875  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.58 
 
 		 390 aa  89.7  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4012  restriction modification system DNA specificity subunit  22.83 
 
 		 436 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.848484  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  24.54 
 
 		 390 aa  87  6e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000269296  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1672  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.99 
 
 		 493 aa  87  7e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1225  hypothetical protein  31.25 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.438073 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1201  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.57 
 
 		 572 aa  83.2  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2226  restriction modification system DNA specificity subunit  20.6 
 
 		 451 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.890862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3227  restriction modification system DNA specificity subunit  23.68 
 
 		 575 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2744  type I restriction-modification system, S subunit  26.17 
 
 		 532 aa  81.6  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0181132  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1132  restriction modification system DNA specificity subunit  24.24 
 
 		 556 aa  81.6  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.817215  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1311  restriction modification system DNA specificity subunit  24.86 
 
 		 578 aa  81.3  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1978  restriction modification system DNA specificity subunit  30.63 
 
 		 616 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4742  type I restriction-modification system, S subunit  21.85 
 
 		 576 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266617  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3267  restriction modification system DNA specificity subunit  22.65 
 
 		 557 aa  78.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0920403  decreased coverage  0.00535253 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03610  type I site-specific deoxyribonuclease  23.06 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0390  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.1 
 
 		 642 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219621 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5859  putative type I restriction-modification system, S subunit  24.68 
 
 		 584 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0735  restriction modification system DNA specificity subunit  21.78 
 
 		 392 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2415  restriction modification system DNA specificity domain  26.18 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.589349  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2791  type I restriction-modification system, S subunit  26.18 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3673  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.22 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0223  putative HsdS protein  34.07 
 
 		 438 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4007  restriction endonuclease S subunits-like  26.78 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3757  restriction modification system S subunit  27.37 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.386531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04178  hypothetical protein  26.15 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.695524  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1635  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.38 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0235263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2893  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.84 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0549  restriction modification system DNA specificity subunit  26.84 
 
 		 385 aa  73.6  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2665  type I restriction-modification system specificity subunit  26.63 
 
 		 446 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0650221  normal  0.332066 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3653  type I restriction enzyme StySPI specificity protein  26.56 
 
 		 460 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.234587  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4880  putative type I restriction-modification system S subunit  25.43 
 
 		 571 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.960431 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1060  restriction modification system DNA specificity subunit  22.82 
 
 		 397 aa  71.2  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2988  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.06 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3569  restriction modification system DNA specificity domain  23.97 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185936  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4454  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.37 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.859615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2285  hypothetical protein  28.8 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0313194  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3358  restriction modification system DNA specificity subunit  21.2 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0521612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1015  hypothetical protein  22.27 
 
 		 477 aa  70.1  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0355  restriction modification system DNA specificity subunit  25.84 
 
 		 590 aa  69.7  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1526  restriction endonuclease S subunits-like  21.99 
 
 		 386 aa  67  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0804  restriction modification system DNA specificity subunit  22.16 
 
 		 368 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.526121  normal  0.427419 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4139  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.08 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0873  restriction modification system DNA specificity subunit  27.72 
 
 		 375 aa  66.6  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0416  type I restriction-modification system S subunit  21.86 
 
 		 457 aa  65.9  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0531711 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4761  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  25.11 
 
 		 428 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3989  restriction modification system DNA specificity domain protein  20.45 
 
 		 456 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0737122 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0501  restriction modification system DNA specificity subunit  23.36 
 
 		 612 aa  64.7  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.435558 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  21.74 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3199  restriction modification system DNA specificity subunit  22.79 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1061  putative type I restriction-modification system, S subunit  20.43 
 
 		 528 aa  63.5  0.000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3030  restriction modification system DNA specificity subunit  22.9 
 
 		 564 aa  63.2  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0959  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.88 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  22.13 
 
 		 439 aa  61.6  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0614  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.07 
 
 		 401 aa  62  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0640  restriction modification system DNA specificity subunit  20.38 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1170  restriction modification system DNA specificity subunit  21.88 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.249165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>