170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_4454 on replicon NC_011668
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011668  Sbal223_4454  restriction modification system DNA specificity domain protein  100 
 
 		 406 aa  816    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.859615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0745  restriction modification system DNA specificity domain  32.47 
 
 		 411 aa  152  8e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.189202  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4930  type I restriction enzyme StySJI specificity protein  35.4 
 
 		 469 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.15 
 
 		 477 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1778  type I restriction-modification system specificity subunit  41.36 
 
 		 419 aa  123  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.926504  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2086  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.11 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000683293 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0842  type I restriction-modification enzyme, S subunit, putative  26.47 
 
 		 476 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1060  restriction modification system DNA specificity subunit  25.25 
 
 		 397 aa  104  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0873  restriction modification system DNA specificity subunit  35 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1635  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.35 
 
 		 419 aa  96.7  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0235263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  29.35 
 
 		 426 aa  94  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2698  restriction modification system DNA specificity subunit  30.14 
 
 		 267 aa  94  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0854775  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1502  restriction modification system DNA specificity domain  23.56 
 
 		 393 aa  90.5  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  30.74 
 
 		 390 aa  89  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000269296  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0487  restriction modification system DNA specificity subunit  28.3 
 
 		 438 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  0.0187002 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  29.41 
 
 		 422 aa  87.8  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4083  restriction modification system DNA specificity subunit  31.25 
 
 		 409 aa  87.8  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20210  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.78 
 
 		 565 aa  87.4  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266778  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0829  type I restriction-modification system, S subunit  30.49 
 
 		 409 aa  87  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232689  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0614  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.07 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.7 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1095  restriction modification system DNA specificity subunit  23.17 
 
 		 450 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  27.23 
 
 		 432 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2097  restriction modification system DNA specificity subunit  24.25 
 
 		 393 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3267  restriction modification system DNA specificity subunit  30.17 
 
 		 557 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0920403  decreased coverage  0.00535253 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1170  restriction modification system DNA specificity subunit  24.29 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.249165  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0508  restriction modification system DNA specificity subunit  27.27 
 
 		 511 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02063  type I restriction-modification system, S subunit  24.46 
 
 		 501 aa  79.3  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1393  restriction and modification enzyme CjeI  26.04 
 
 		 1285 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  24.7 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0287  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  23.88 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04178  hypothetical protein  30.95 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.695524  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1978  restriction modification system DNA specificity subunit  28.43 
 
 		 616 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4821  type I restriction-modification system, endonuclease S subunit  31.9 
 
 		 382 aa  76.3  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2909  restriction modification system DNA specificity subunit  27.41 
 
 		 440 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1037  restriction modification system DNA specificity domain  29.38 
 
 		 364 aa  75.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0890662  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4264  type I restriction-modification system, S subunit  23.63 
 
 		 495 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0149  restriction modification system DNA specificity subunit  25.36 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4163  restriction modification system DNA specificity subunit  26.8 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.864984  normal  0.0584456 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3540  restriction modification system DNA specificity subunit  22.11 
 
 		 387 aa  72  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1260  restriction modification system DNA specificity subunit  19.71 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3272  type I restriction-modification system specificity subunit  24.78 
 
 		 492 aa  70.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425878  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1492  restriction modification system DNA specificity subunit  24.37 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0198  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.11 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.719886  decreased coverage  0.000218103 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4778  restriction modification system DNA specificity subunit  25.25 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0864  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.6 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0735  restriction modification system DNA specificity subunit  22.54 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1710  restriction modification system DNA specificity subunit  26.2 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0845  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.38 
 
 		 495 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31571e-19 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2421  restriction modification system DNA specificity subunit  27.93 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.318068 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0227  restriction modification system DNA specificity domain  23.98 
 
 		 395 aa  69.3  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3525  restriction modification system DNA specificity subunit  25.51 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1576  type I restriction-modification system, S subunit  30.81 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.200835  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3109  restriction modification system DNA specificity subunit  27 
 
 		 426 aa  68.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2093  restriction modification system DNA specificity subunit  24.09 
 
 		 477 aa  68.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1195  type II restriction-modification enzyme  27.68 
 
 		 1343 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1061  putative type I restriction-modification system, S subunit  27.78 
 
 		 528 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2893  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.22 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  27.81 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2652  Restriction endonuclease S subunits-like protein  26.67 
 
 		 413 aa  67  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.252104  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17660  restriction endonuclease S subunit  24.04 
 
 		 416 aa  67  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1536  hypothetical protein  21.84 
 
 		 380 aa  67  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00344436  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0504  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.6 
 
 		 408 aa  66.6  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.09 
 
 		 429 aa  66.2  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  26.51 
 
 		 456 aa  66.2  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1566  restriction modification system DNA specificity subunit  27.48 
 
 		 403 aa  66.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0293394  unclonable  0.0000192379 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1132  restriction modification system DNA specificity subunit  28.74 
 
 		 556 aa  66.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.817215  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.38 
 
 		 457 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3132  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.06 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.474681 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2452  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  24.63 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.587532 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4394  restriction modification system DNA specificity subunit  25.82 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.536192  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1219  restriction modification system DNA specificity domain  24.24 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1027  restriction modification system DNA specificity subunit  30.82 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0808  specificity determinant HsdS-like  25.62 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.361917  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0268  restriction endonuclease S subunits  30.99 
 
 		 444 aa  63.2  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2722  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.87 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3471  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.79 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3673  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.85 
 
 		 459 aa  62.8  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0233  restriction modification system DNA specificity subunit  23.77 
 
 		 461 aa  62  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0967889  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3199  restriction modification system DNA specificity subunit  23.61 
 
 		 400 aa  62  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0637  restriction modification system DNA specificity domain  24.37 
 
 		 422 aa  61.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0822  restriction modification system DNA specificity subunit  27.33 
 
 		 577 aa  61.2  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  20.98 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  25 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1307  restriction modification system DNA specificity subunit  26 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  25.73 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1015  hypothetical protein  23.41 
 
 		 477 aa  59.7  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1911  hypothetical protein  23.86 
 
 		 453 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.568524  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  33.06 
 
 		 775 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4742  type I restriction-modification system, S subunit  29.25 
 
 		 576 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266617  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0086  restriction modification system DNA specificity protein  26.6 
 
 		 538 aa  57.8  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.97 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3089  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.85 
 
 		 520 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003235  type I restriction-modification system specificity subunit S  24.02 
 
 		 437 aa  57  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.54 
 
 		 462 aa  57  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3599  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.71 
 
 		 532 aa  57.4  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.743632  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4042  restriction modification system DNA specificity subunit  20.39 
 
 		 428 aa  57  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3569  restriction modification system DNA specificity domain  22.55 
 
 		 395 aa  57  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185936  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2423  restriction modification system DNA specificity subunit  21.65 
 
 		 426 aa  56.6  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.57431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2673  restriction modification system DNA specificity subunit  26.25 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.574489 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>