192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0030 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  100 
 
 
435 aa  891    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3272  type I restriction-modification system specificity subunit  51.44 
 
 
492 aa  236  6e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425878  normal  0.243207 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3649  restriction modification system DNA specificity domain protein  36.06 
 
 
464 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4930  type I restriction enzyme StySJI specificity protein  35.56 
 
 
469 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4264  type I restriction-modification system, S subunit  38.65 
 
 
495 aa  189  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3673  restriction modification system DNA specificity domain protein  41.28 
 
 
459 aa  176  5e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  43.6 
 
 
477 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1536  restriction modification system DNA specificity domain  36.33 
 
 
364 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1954  restriction modification system DNA specificity subunit  33.91 
 
 
406 aa  150  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1327  restriction modification system DNA specificity subunit  38.67 
 
 
431 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.280518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3653  type I restriction enzyme StySPI specificity protein  28.63 
 
 
460 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.234587  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3571  hypothetical protein  30.23 
 
 
458 aa  134  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1672  restriction modification system DNA specificity domain protein  61.61 
 
 
493 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04178  hypothetical protein  56.15 
 
 
236 aa  131  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.695524  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2960  restriction modification system DNA specificity subunit  65.69 
 
 
587 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1544  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.03 
 
 
374 aa  127  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0500  restriction modification system DNA specificity subunit  33.98 
 
 
413 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.565018  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6044  type I restriction-modification system subunit S  36.57 
 
 
547 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.061065  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1643  restriction modification system DNA specificity domain protein  37.04 
 
 
428 aa  122  9e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3599  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.03 
 
 
532 aa  120  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.743632  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0005  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.11 
 
 
378 aa  119  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01116  hypothetical protein  35.11 
 
 
400 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2621  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.32 
 
 
400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0287  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  34.78 
 
 
471 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  36.93 
 
 
390 aa  105  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000269296  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1414  restriction modification system DNA specificity domain  31.82 
 
 
447 aa  103  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00014984  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4611  restriction modification system DNA specificity subunit  34.33 
 
 
561 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.483614  hitchhiker  0.0000795371 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2093  restriction modification system DNA specificity subunit  30.65 
 
 
477 aa  98.6  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1095  restriction modification system DNA specificity subunit  25.61 
 
 
450 aa  95.9  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5008  Restriction endonuclease S subunits-like protein  38.2 
 
 
465 aa  93.6  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1492  restriction modification system DNA specificity subunit  29.19 
 
 
479 aa  93.2  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3777  restriction endonuclease S subunits-like protein  30.37 
 
 
419 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3850  restriction endonuclease S subunits-like protein  30.37 
 
 
419 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2665  type I restriction-modification system specificity subunit  31.5 
 
 
446 aa  90.9  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0650221  normal  0.332066 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2862  restriction modification system DNA specificity subunit  30.2 
 
 
589 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4083  restriction modification system DNA specificity subunit  26.47 
 
 
409 aa  87.4  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3180  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.54 
 
 
390 aa  86.3  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0845  restriction modification system DNA specificity domain protein  25 
 
 
495 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31571e-19 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1991  restriction modification system DNA specificity domain  29.28 
 
 
490 aa  85.9  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120232  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  28.36 
 
 
611 aa  85.5  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00184495 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02063  type I restriction-modification system, S subunit  38.22 
 
 
501 aa  84.7  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0808  specificity determinant HsdS-like  26.79 
 
 
363 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.361917  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4761  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  26.96 
 
 
428 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2893  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.44 
 
 
237 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1204  restriction modification system DNA specificity subunit  27.23 
 
 
547 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340549  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0515  type I restriction-modification system (specificity subunit)  29.38 
 
 
263 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4454  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.7 
 
 
406 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.859615  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0900  restriction modification system DNA specificity domain protein  33.33 
 
 
471 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.963501 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0854  restriction modification system DNA specificity subunit  31.39 
 
 
595 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221182  normal  0.0643125 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0416  type I restriction-modification system S subunit  26.21 
 
 
457 aa  75.9  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0531711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3089  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.39 
 
 
520 aa  75.9  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1061  putative type I restriction-modification system, S subunit  25.82 
 
 
528 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1032  restriction modification system DNA specificity subunit  26.07 
 
 
457 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41908  normal  0.322454 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0086  restriction modification system DNA specificity protein  25.12 
 
 
538 aa  73.6  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  26.64 
 
 
435 aa  73.6  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1132  restriction modification system DNA specificity subunit  27.23 
 
 
556 aa  73.2  0.000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.817215  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03610  type I site-specific deoxyribonuclease  25 
 
 
360 aa  73.2  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.22 
 
 
457 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4012  restriction modification system DNA specificity subunit  25.7 
 
 
436 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.848484  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2409  restriction modification system DNA specificity subunit  24.1 
 
 
442 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2744  type I restriction-modification system, S subunit  25 
 
 
532 aa  68.6  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0181132  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2226  restriction modification system DNA specificity subunit  20.05 
 
 
451 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.890862  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1551  type I restriction enzyme  26.34 
 
 
439 aa  67.4  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3227  restriction modification system DNA specificity subunit  23.88 
 
 
575 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0686  type I restriction-modification system, S subunit, putative  27.53 
 
 
561 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.840975  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2598  type I restriction-modification enzyme, S subunit  25.38 
 
 
417 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0133376  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0835  restriction modification system DNA specificity domain  27.53 
 
 
563 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.835919  normal  0.945638 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0390  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.48 
 
 
642 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000219621 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3081  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.88 
 
 
415 aa  64.7  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  22.93 
 
 
433 aa  64.3  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2086  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.81 
 
 
417 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000683293 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  25.35 
 
 
422 aa  63.9  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1218  restriction modification system DNA specificity subunit  25.29 
 
 
351 aa  63.9  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.67755  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0334  restriction modification system DNA specificity domain  20.15 
 
 
430 aa  63.2  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.284396 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  23.11 
 
 
429 aa  62.4  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1635  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.32 
 
 
419 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0235263  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0149  restriction modification system DNA specificity subunit  26.52 
 
 
400 aa  62.4  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0508  restriction modification system DNA specificity subunit  30.97 
 
 
511 aa  61.6  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0615  restriction modification system DNA specificity subunit  25.25 
 
 
417 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0545068  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0076  type I restriction-modification system subunit S  24.39 
 
 
464 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  22.54 
 
 
439 aa  61.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1160  restriction modification system DNA specificity subunit  29.14 
 
 
407 aa  60.8  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2682  putative restriction endonuclease S subunit  27.45 
 
 
400 aa  60.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.845062  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1015  restriction modification system DNA specificity subunit  25.67 
 
 
575 aa  60.1  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2976  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.5 
 
 
238 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3569  restriction modification system DNA specificity domain  21.41 
 
 
395 aa  59.7  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185936  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4742  type I restriction-modification system, S subunit  25 
 
 
576 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.266617  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3940  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.51 
 
 
453 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  24.75 
 
 
425 aa  59.7  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3443  restriction modification system DNA specificity domain protein  20.49 
 
 
445 aa  59.7  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0403  restriction modification system DNA specificity subunit  24.33 
 
 
402 aa  59.3  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1237  restriction modification system DNA specificity subunit  23.03 
 
 
633 aa  58.9  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3351  type I site-specific deoxyribonuclease S subunit  29.41 
 
 
354 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00146581  normal  0.0102246 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4455  restriction modification system DNA specificity subunit  27.16 
 
 
388 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.353509  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0599  type I restriction-modification system, S subunit  23.89 
 
 
458 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0822  restriction modification system DNA specificity subunit  26.19 
 
 
577 aa  58.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3199  restriction modification system DNA specificity subunit  21.81 
 
 
400 aa  58.2  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365834  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3352  type I site-specific deoxyribonuclease S subunit  29.41 
 
 
303 aa  57.8  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000513186  normal  0.0100815 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05614  type I restriction-modification system S subunit  26.09 
 
 
432 aa  57.4  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0605  restriction modification system DNA specificity subunit  25.75 
 
 
453 aa  57.4  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>