139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0086 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0086  restriction modification system DNA specificity protein  100 
 
 		 538 aa  1112    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0900  restriction modification system DNA specificity domain protein  38.67 
 
 		 471 aa  324  3e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.963501 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3227  restriction modification system DNA specificity subunit  32.36 
 
 		 575 aa  257  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1204  restriction modification system DNA specificity subunit  44.09 
 
 		 547 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340549  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0854  restriction modification system DNA specificity subunit  40.3 
 
 		 595 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221182  normal  0.0643125 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1492  restriction modification system DNA specificity subunit  35.57 
 
 		 479 aa  210  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3515  restriction modification system DNA specificity domain  33.85 
 
 		 514 aa  207  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0508  restriction modification system DNA specificity subunit  35.76 
 
 		 511 aa  199  9e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3272  type I restriction-modification system specificity subunit  30.23 
 
 		 492 aa  187  5e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425878  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2409  restriction modification system DNA specificity subunit  43.94 
 
 		 442 aa  159  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4930  type I restriction enzyme StySJI specificity protein  25.43 
 
 		 469 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3030  restriction modification system DNA specificity subunit  24.61 
 
 		 564 aa  144  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2606  restriction modification system DNA specificity subunit  39.78 
 
 		 429 aa  139  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0899  restriction endonuclease S subunit  45.91 
 
 		 396 aa  137  4e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000681459  hitchhiker  0.00000169581 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  39.39 
 
 		 846 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2093  restriction modification system DNA specificity subunit  27 
 
 		 477 aa  134  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0845  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.2 
 
 		 495 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31571e-19 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02063  type I restriction-modification system, S subunit  25.75 
 
 		 501 aa  130  8.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0804  restriction modification system DNA specificity subunit  35.18 
 
 		 368 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.526121  normal  0.427419 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1991  restriction modification system DNA specificity domain  24.51 
 
 		 490 aa  126  9e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120232  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1253  Type I restriction enzyme EcoAI specificity protein  38.34 
 
 		 597 aa  124  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00376854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2688  restriction endonuclease S subunits-like  35.18 
 
 		 487 aa  123  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.165356  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20210  restriction modification system DNA specificity domain protein  38.18 
 
 		 565 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266778  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3673  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.78 
 
 		 459 aa  119  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1398  restriction modification system DNA specificity subunit  29.81 
 
 		 557 aa  118  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3180  restriction modification system DNA specificity domain protein  37.42 
 
 		 390 aa  117  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1414  restriction modification system DNA specificity domain  25.52 
 
 		 447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00014984  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1536  restriction modification system DNA specificity domain  33.53 
 
 		 364 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1015  restriction modification system DNA specificity subunit  28.42 
 
 		 575 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5859  putative type I restriction-modification system, S subunit  25.47 
 
 		 584 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3358  restriction modification system DNA specificity subunit  24.34 
 
 		 429 aa  109  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0521612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2226  restriction modification system DNA specificity subunit  29.52 
 
 		 451 aa  106  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.890862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1221  restriction modification system DNA specificity subunit  31.34 
 
 		 463 aa  106  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1672  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.36 
 
 		 493 aa  104  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0735  restriction modification system DNA specificity subunit  30.43 
 
 		 392 aa  104  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1526  restriction endonuclease S subunits-like  33.01 
 
 		 386 aa  103  8e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4917  restriction modification system DNA specificity subunit  32.95 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.544675 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03610  type I site-specific deoxyribonuclease  31.37 
 
 		 360 aa  100  6e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2285  hypothetical protein  26.45 
 
 		 425 aa  100  8e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0313194  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  35.48 
 
 		 429 aa  99.4  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1095  restriction modification system DNA specificity subunit  30.39 
 
 		 450 aa  100  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02074  HsdS polypeptide, part of CfrA family  43.93 
 
 		 151 aa  99.4  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4139  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.73 
 
 		 238 aa  98.2  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0842  type I restriction-modification enzyme, S subunit, putative  23.5 
 
 		 476 aa  97.1  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2862  restriction modification system DNA specificity subunit  30.36 
 
 		 589 aa  96.7  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4012  restriction modification system DNA specificity subunit  28.57 
 
 		 436 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.848484  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2926  restriction modification system DNA specificity subunit  35.03 
 
 		 434 aa  96.3  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2744  type I restriction-modification system, S subunit  29.03 
 
 		 532 aa  94.7  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0181132  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1091  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.26 
 
 		 444 aa  93.6  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17387  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  29.68 
 
 		 435 aa  94  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2893  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.13 
 
 		 237 aa  93.6  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1060  restriction modification system DNA specificity subunit  30.29 
 
 		 397 aa  92.8  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4264  type I restriction-modification system, S subunit  26.45 
 
 		 495 aa  90.5  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  27.33 
 
 		 549 aa  89.4  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2690  hypothetical protein  29.53 
 
 		 649 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3719  restriction modification system DNA specificity subunit  29.08 
 
 		 585 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3649  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.51 
 
 		 464 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2960  restriction modification system DNA specificity subunit  26.44 
 
 		 587 aa  87  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3109  restriction modification system DNA specificity subunit  28.64 
 
 		 426 aa  85.5  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3081  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.98 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3089  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.76 
 
 		 520 aa  85.1  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2277  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.05 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  hitchhiker  0.00000677276 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3297  restriction modification system DNA specificity subunit  29.22 
 
 		 430 aa  82.8  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489204 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.46 
 
 		 477 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1032  restriction modification system DNA specificity subunit  24.19 
 
 		 457 aa  82  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41908  normal  0.322454 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1237  restriction modification system DNA specificity subunit  26.78 
 
 		 633 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1095  restriction modification system DNA specificity subunit  27.5 
 
 		 180 aa  79  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0307222  normal  0.460019 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1671  restriction modification system DNA specificity subunit  25 
 
 		 442 aa  78.2  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.517259  hitchhiker  0.00037426 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3653  type I restriction enzyme StySPI specificity protein  30.74 
 
 		 460 aa  77  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.234587  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  26.72 
 
 		 611 aa  77  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184495 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1061  putative type I restriction-modification system, S subunit  24.7 
 
 		 528 aa  75.9  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2496  subunit S of type I restriction-modification system  23.11 
 
 		 565 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00268922  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2742  type I restriction-modification system specificity determinant  34.53 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971087  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0268  restriction endonuclease S subunits  21.64 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0822  restriction modification system DNA specificity subunit  25.33 
 
 		 577 aa  74.7  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2508  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  31.91 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.700746 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  25.12 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2910  putative type I restriction-modification system, S subunit  28.79 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0006  restriction modification system, type I  26.9 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4880  putative type I restriction-modification system S subunit  26.79 
 
 		 571 aa  70.5  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.960431 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4189  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.32 
 
 		 401 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1978  restriction modification system DNA specificity subunit  25.72 
 
 		 616 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04178  hypothetical protein  42.7 
 
 		 236 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.695524  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0501  restriction modification system DNA specificity subunit  22.73 
 
 		 612 aa  67  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.435558 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1087  restriction modification system DNA specificity subunit  25.45 
 
 		 437 aa  63.9  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0762586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0371  type I restriction-modification system S subunit  25.07 
 
 		 323 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3599  restriction modification system DNA specificity domain protein  38.89 
 
 		 532 aa  61.2  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.743632  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1635  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.79 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0235263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0599  type I restriction-modification system, S subunit  23.48 
 
 		 458 aa  60.1  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4761  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  21.05 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4611  restriction modification system DNA specificity subunit  25.37 
 
 		 561 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.483614  hitchhiker  0.0000795371 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  28.77 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000269296  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0844  restriction endonuclease S subunits-like protein  24.76 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4454  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.6 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.859615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3569  restriction modification system DNA specificity domain  27.36 
 
 		 395 aa  56.6  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185936  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6044  type I restriction-modification system subunit S  23.98 
 
 		 547 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.061065  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1311  restriction modification system DNA specificity subunit  25.85 
 
 		 578 aa  55.5  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  26.26 
 
 		 425 aa  55.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3777  restriction endonuclease S subunits-like protein  21.78 
 
 		 419 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3850  restriction endonuclease S subunits-like protein  21.78 
 
 		 419 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>