68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2690 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2690  hypothetical protein  100 
 
 		 649 aa  1286    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1598  hypothetical protein  97.36 
 
 		 417 aa  704    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1486  hypothetical protein  96.64 
 
 		 417 aa  701    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0978  hypothetical protein  95.68 
 
 		 417 aa  688    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.764358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1754  hypothetical protein  95.92 
 
 		 417 aa  684    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467768 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2547  hypothetical protein  98.32 
 
 		 417 aa  806    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0495707  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3158  transposase, IS4 family protein  94.96 
 
 		 416 aa  727    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4456  hypothetical protein  94.48 
 
 		 417 aa  675    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185829 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4509  hypothetical protein  97.6 
 
 		 417 aa  709    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326946 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1091  restriction modification system DNA specificity domain protein  66.67 
 
 		 444 aa  212  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17387  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1671  restriction modification system DNA specificity subunit  50.6 
 
 		 442 aa  150  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.517259  hitchhiker  0.00037426 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2292  hypothetical protein  40.78 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0900  restriction modification system DNA specificity domain protein  35.09 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.963501 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3030  restriction modification system DNA specificity subunit  37.82 
 
 		 564 aa  95.1  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1536  restriction modification system DNA specificity domain  37.21 
 
 		 364 aa  91.7  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0086  restriction modification system DNA specificity protein  29.53 
 
 		 538 aa  89.7  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0006  restriction modification system, type I  36.31 
 
 		 412 aa  88.2  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  34.38 
 
 		 846 aa  88.6  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3297  restriction modification system DNA specificity subunit  36.09 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000489204 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1221  restriction modification system DNA specificity subunit  27.93 
 
 		 463 aa  83.6  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20210  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.05 
 
 		 565 aa  83.2  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266778  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3180  restriction modification system DNA specificity domain protein  37.09 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2926  restriction modification system DNA specificity subunit  32.43 
 
 		 434 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0899  restriction endonuclease S subunit  30.77 
 
 		 396 aa  79.7  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000681459  hitchhiker  0.00000169581 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4930  type I restriction enzyme StySJI specificity protein  30.57 
 
 		 469 aa  80.1  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3227  restriction modification system DNA specificity subunit  33.97 
 
 		 575 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2606  restriction modification system DNA specificity subunit  32.89 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  34.21 
 
 		 549 aa  72.8  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1253  Type I restriction enzyme EcoAI specificity protein  32.5 
 
 		 597 aa  71.2  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00376854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.02 
 
 		 429 aa  70.1  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2742  type I restriction-modification system specificity determinant  34.84 
 
 		 398 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971087  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2688  restriction endonuclease S subunits-like  30.13 
 
 		 487 aa  68.2  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.165356  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3673  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.77 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2285  hypothetical protein  32.47 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0313194  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4917  restriction modification system DNA specificity subunit  31.88 
 
 		 412 aa  65.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.544675 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2910  putative type I restriction-modification system, S subunit  30.05 
 
 		 373 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3081  restriction modification system DNA specificity domain protein  39.09 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2689  restriction modification system DNA specificity subunit  30.17 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.841682  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2508  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  29.92 
 
 		 401 aa  55.5  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.700746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0444  transposase, IS4 family protein  26.27 
 
 		 372 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000119461  normal  0.0439577 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2890  transposase IS4 family protein  27.95 
 
 		 414 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0289371  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2461  transposase IS4 family protein  27.95 
 
 		 414 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250425  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0848  transposase IS4 family protein  27.95 
 
 		 414 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.253852  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1209  transposase IS4 family protein  27.95 
 
 		 414 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0722892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1934  transposase IS4 family protein  27.95 
 
 		 414 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000387173  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4720  transposase IS4 family protein  27.95 
 
 		 414 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.370488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3831  transposase IS4 family protein  27.95 
 
 		 414 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000386672  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3610  transposase IS4 family protein  27.95 
 
 		 414 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3532  transposase IS4 family protein  27.95 
 
 		 414 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000268669  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3427  transposase IS4 family protein  27.95 
 
 		 414 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000920727  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3220  transposase IS4 family protein  27.95 
 
 		 414 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.390647  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3071  transposase IS4 family protein  27.95 
 
 		 414 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.52529  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2872  transposase IS4 family protein  27.95 
 
 		 414 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0068  transposase, IS4 family protein  28.65 
 
 		 397 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.974421  normal  0.334707 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2039  transposase IS4 family protein  26.69 
 
 		 378 aa  50.8  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4089  transposase IS4 family protein  27.99 
 
 		 401 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.034496  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1094  transposase IS4 family protein  27.17 
 
 		 401 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0885817  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3939  transposase IS4 family protein  27.17 
 
 		 401 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0405  transposase IS4 family protein  27.43 
 
 		 383 aa  48.1  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00559123 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0411  transposase IS4 family protein  27.43 
 
 		 383 aa  48.1  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.215728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2873  hypothetical protein  51.28 
 
 		 86 aa  47.8  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1093  restriction modification system DNA specificity subunit  27.12 
 
 		 394 aa  47.8  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1805  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.58 
 
 		 423 aa  47.4  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.745604  normal  0.535567 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3112  transposase IS4 family protein  27.27 
 
 		 398 aa  47  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  25 
 
 		 422 aa  46.6  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2598  type I restriction-modification enzyme, S subunit  25.79 
 
 		 417 aa  45.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0133376  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5516  transposase IS4 family protein  22.28 
 
 		 387 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.378571 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5389  transposase IS4 family protein  22.28 
 
 		 387 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>