169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2086 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2086  restriction modification system DNA specificity domain protein  100 
 
 
417 aa  856    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000683293 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  33.56 
 
 
477 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3089  restriction modification system DNA specificity domain protein  51.89 
 
 
520 aa  179  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1260  restriction modification system DNA specificity subunit  32.52 
 
 
385 aa  168  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1060  restriction modification system DNA specificity subunit  32.69 
 
 
397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1027  restriction modification system DNA specificity subunit  37 
 
 
420 aa  160  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2988  restriction modification system DNA specificity domain protein  36.96 
 
 
386 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1791  restriction modification system DNA specificity subunit  27.55 
 
 
419 aa  147  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365715  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.81 
 
 
422 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1170  restriction modification system DNA specificity subunit  38.5 
 
 
402 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.249165  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1153  restriction modification system DNA specificity subunit  28.95 
 
 
429 aa  126  7e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1954  restriction modification system DNA specificity subunit  29.73 
 
 
406 aa  125  9e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2792  restriction modification system DNA specificity domain protein  35.08 
 
 
423 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313089  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0735  restriction modification system DNA specificity subunit  27.42 
 
 
392 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3267  restriction modification system DNA specificity subunit  33.64 
 
 
557 aa  123  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0920403  decreased coverage  0.00535253 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1195  type II restriction-modification enzyme  37.5 
 
 
1343 aa  120  3e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  41.88 
 
 
422 aa  121  3e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5276  restriction modification system DNA specificity subunit  36.32 
 
 
418 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3525  restriction modification system DNA specificity subunit  38.83 
 
 
420 aa  120  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4454  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.11 
 
 
406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.859615  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  41.24 
 
 
456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  36.07 
 
 
457 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3653  type I restriction enzyme StySPI specificity protein  34.17 
 
 
460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.234587  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1158  restriction modification system DNA specificity subunit  33.46 
 
 
454 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000117149  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0508  restriction modification system DNA specificity subunit  25.16 
 
 
511 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0448  restriction modification system DNA specificity domain  39.33 
 
 
435 aa  106  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000159098 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1978  restriction modification system DNA specificity subunit  33.65 
 
 
616 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  24.15 
 
 
846 aa  104  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  35.44 
 
 
438 aa  104  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0149  restriction modification system DNA specificity subunit  31.53 
 
 
400 aa  103  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1307  restriction modification system DNA specificity subunit  31.09 
 
 
285 aa  100  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1093  restriction modification system DNA specificity subunit  37.09 
 
 
394 aa  98.6  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.614941  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.78 
 
 
462 aa  93.6  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3132  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.81 
 
 
424 aa  93.6  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.474681 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0504  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.95 
 
 
408 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0842  type I restriction-modification enzyme, S subunit, putative  25.22 
 
 
476 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0864  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.95 
 
 
413 aa  84  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  30.29 
 
 
425 aa  84  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1064  type I restriction-modification  33.51 
 
 
453 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000898872  normal  0.027841 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1635  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.22 
 
 
419 aa  81.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0235263  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1219  restriction modification system DNA specificity domain  29.87 
 
 
412 aa  80.5  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2689  restriction modification system DNA specificity subunit  29.55 
 
 
290 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.841682  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2097  restriction modification system DNA specificity subunit  23.47 
 
 
393 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1220  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.52 
 
 
620 aa  77.8  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3471  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.54 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003235  type I restriction-modification system specificity subunit S  30.14 
 
 
437 aa  77  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0227  restriction modification system DNA specificity domain  22.17 
 
 
395 aa  76.6  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  27.23 
 
 
456 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  28.71 
 
 
432 aa  75.5  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0808  specificity determinant HsdS-like  23.53 
 
 
363 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.361917  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3599  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.61 
 
 
532 aa  73.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.743632  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0334  restriction modification system DNA specificity domain  28.12 
 
 
430 aa  73.2  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.284396 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20210  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.34 
 
 
565 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266778  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1095  restriction modification system DNA specificity subunit  23.53 
 
 
450 aa  72  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  23.46 
 
 
433 aa  71.2  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3010  restriction modification system DNA specificity subunit  26.79 
 
 
549 aa  70.1  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.340841  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.05 
 
 
427 aa  70.1  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3358  restriction modification system DNA specificity subunit  29.3 
 
 
429 aa  69.7  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0521612  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3550  restriction modification system DNA specificity subunit  25.37 
 
 
417 aa  69.7  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257959  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3569  restriction modification system DNA specificity domain  22.43 
 
 
395 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.32 
 
 
429 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3129  restriction modification system DNA specificity subunit  27.74 
 
 
416 aa  67.8  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.343622  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  23.27 
 
 
429 aa  68.2  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0277  restriction modification system DNA specificity subunit  32.79 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2467  restriction modification system DNA specificity domain  23.1 
 
 
438 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3425  restriction endonuclease S subunits-like  22.58 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835151  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0080  restriction modification system DNA specificity subunit  23.77 
 
 
392 aa  67  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1393  restriction and modification enzyme CjeI  27.01 
 
 
1285 aa  66.2  0.0000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3173  restriction modification system, type I  31.25 
 
 
394 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000000252983 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0132  restriction modification system DNA specificity subunit  25.64 
 
 
427 aa  66.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.47299 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2722  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.76 
 
 
385 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1132  restriction modification system DNA specificity subunit  25.39 
 
 
556 aa  65.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.817215  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  26.8 
 
 
426 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4880  putative type I restriction-modification system S subunit  30.33 
 
 
571 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.960431 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4394  restriction modification system DNA specificity subunit  30.64 
 
 
414 aa  65.1  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.536192  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1061  putative type I restriction-modification system, S subunit  24.29 
 
 
528 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0829  type I restriction-modification system, S subunit  25.96 
 
 
409 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232689  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0355  restriction modification system DNA specificity subunit  27.42 
 
 
590 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4348  restriction modification system DNA specificity subunit  27.53 
 
 
363 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  23.81 
 
 
435 aa  64.3  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2397  restriction modification system DNA specificity domain  27.23 
 
 
417 aa  63.5  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4163  restriction modification system DNA specificity subunit  29.68 
 
 
405 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.864984  normal  0.0584456 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3649  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.09 
 
 
464 aa  62  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0844  restriction endonuclease S subunits-like protein  28.49 
 
 
386 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  22.31 
 
 
834 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2909  restriction modification system DNA specificity subunit  31.53 
 
 
440 aa  61.2  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2673  restriction modification system DNA specificity subunit  23.53 
 
 
415 aa  61.2  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.574489 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0599  type I restriction-modification system, S subunit  25.35 
 
 
458 aa  60.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4821  type I restriction-modification system, endonuclease S subunit  28.29 
 
 
382 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3607  restriction modification system, type I  26.97 
 
 
396 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1576  type I restriction-modification system, S subunit  24.14 
 
 
399 aa  60.5  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.200835  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0871  restriction modification system DNA specificity subunit  33.82 
 
 
211 aa  60.5  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2452  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  26.95 
 
 
419 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.587532 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1502  restriction modification system DNA specificity domain  20.59 
 
 
393 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0487  restriction modification system DNA specificity subunit  31.21 
 
 
438 aa  60.5  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  0.0187002 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1911  hypothetical protein  22.36 
 
 
453 aa  60.1  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.568524  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3719  restriction modification system DNA specificity subunit  29.85 
 
 
585 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  25.47 
 
 
390 aa  60.1  0.00000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000269296  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4241  restriction modification system DNA specificity subunit  25.4 
 
 
411 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.491612  hitchhiker  0.00127278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1015  restriction modification system DNA specificity subunit  24.72 
 
 
575 aa  58.9  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>