More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1393 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1195  type II restriction-modification enzyme  49.82 
 
 		 1343 aa  970    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1393  restriction and modification enzyme CjeI  100 
 
 		 1285 aa  2603    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1564  restriction modification system DNA specificity domain protein  38.4 
 
 		 1134 aa  404  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0972  N-6 DNA methylase  23.49 
 
 		 911 aa  119  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.91965 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1061  putative type I restriction-modification system, S subunit  41.57 
 
 		 528 aa  116  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4821  type I restriction-modification system, endonuclease S subunit  35.37 
 
 		 382 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2673  restriction modification system DNA specificity subunit  33.33 
 
 		 415 aa  98.6  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.574489 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1710  restriction modification system DNA specificity subunit  31.75 
 
 		 414 aa  98.2  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1132  restriction modification system DNA specificity subunit  32.68 
 
 		 556 aa  93.6  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.817215  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1978  restriction modification system DNA specificity subunit  32.93 
 
 		 616 aa  93.2  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  25.56 
 
 		 498 aa  89  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  31.91 
 
 		 426 aa  88.2  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3178  N-6 DNA methylase  22.58 
 
 		 498 aa  87.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0125713  hitchhiker  0.0000000000157011 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4083  restriction modification system DNA specificity subunit  35.57 
 
 		 409 aa  87.8  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  23.62 
 
 		 799 aa  87.4  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  25.45 
 
 		 809 aa  86.7  0.000000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0850  N-6 DNA methylase  24.81 
 
 		 496 aa  86.7  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0865  type I restriction-modification system, M subunit  24.54 
 
 		 814 aa  83.6  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173727  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  23.7 
 
 		 799 aa  83.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0829  type I restriction-modification system, S subunit  34.16 
 
 		 409 aa  84  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232689  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3610  N-6 DNA methylase  25.19 
 
 		 500 aa  84  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.578876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1037  restriction modification system DNA specificity domain  38.85 
 
 		 364 aa  82.8  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0890662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  28.81 
 
 		 499 aa  83.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2003  type I restriction-modification system, M subunit  25.44 
 
 		 537 aa  82.4  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2372  type I restriction-modification system, M subunit  25.44 
 
 		 537 aa  82.4  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.728855  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  25.22 
 
 		 730 aa  82.4  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1576  type I restriction-modification system, S subunit  30.14 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.200835  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0128  N-6 DNA methylase  31.18 
 
 		 846 aa  81.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4454  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.42 
 
 		 406 aa  81.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.859615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3109  restriction modification system DNA specificity subunit  29.41 
 
 		 426 aa  80.5  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  25.39 
 
 		 808 aa  80.5  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1977  N-6 DNA methylase  25.37 
 
 		 500 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.850783  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1566  restriction modification system DNA specificity subunit  30.85 
 
 		 403 aa  80.1  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0293394  unclonable  0.0000192379 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0450  type I restriction-modification system, M subunit  25.78 
 
 		 537 aa  79.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003054 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1235  N-6 DNA methylase  25.18 
 
 		 501 aa  79.3  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0750  type I restriction-modification system, M subunit  23.47 
 
 		 544 aa  79.7  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  24.07 
 
 		 847 aa  79  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  25.37 
 
 		 810 aa  79.3  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  24.26 
 
 		 493 aa  79  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0198  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.05 
 
 		 386 aa  77.8  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.719886  decreased coverage  0.000218103 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1085  type I restriction-modification system, M subunit  26.24 
 
 		 547 aa  78.2  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  20.41 
 
 		 554 aa  77.8  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  22.51 
 
 		 508 aa  77  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0129  type I restriction-modification system, M subunit  24.41 
 
 		 537 aa  77  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  23.79 
 
 		 810 aa  76.3  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  22.51 
 
 		 523 aa  76.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4881  type I restriction-modification system M subunit  22.83 
 
 		 489 aa  76.3  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5860  type I restriction-modification system, M subunit  22.55 
 
 		 493 aa  75.9  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.822857 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1220  type I restriction-modification system, M subunit  25.78 
 
 		 540 aa  75.9  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.107175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3088  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  25.52 
 
 		 502 aa  76.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143322  normal  0.282714 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3546  type I restriction-modification system, M subunit  25.69 
 
 		 535 aa  75.5  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.831972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0925  type I restriction-modification system, M subunit  26.04 
 
 		 535 aa  75.1  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000528021  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1851  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  32.89 
 
 		 194 aa  75.1  0.000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  23.75 
 
 		 504 aa  75.1  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.66 
 
 		 477 aa  74.3  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  27.97 
 
 		 499 aa  74.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1092  N-6 DNA methylase  24.23 
 
 		 505 aa  73.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.299691  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2619  type I restriction-modification system, M subunit  26.33 
 
 		 584 aa  74.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0427  type I restriction-modification system, M subunit  24.44 
 
 		 827 aa  73.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1036  N-6 DNA methylase  24.4 
 
 		 527 aa  73.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00552327  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4741  type I restriction-modification system, M subunit  21.98 
 
 		 489 aa  73.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410686 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  22.58 
 
 		 871 aa  73.2  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  24.18 
 
 		 873 aa  73.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  27.14 
 
 		 429 aa  73.6  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0149  restriction modification system DNA specificity subunit  31.45 
 
 		 400 aa  73.2  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1130  N-6 DNA methylase  23.73 
 
 		 553 aa  72.8  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4612  N-6 DNA methylase  22.43 
 
 		 489 aa  72.8  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000590691 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  28.64 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6045  type I restriction-modification system subunit M  22.79 
 
 		 489 aa  72.8  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0475301  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0786  N-6 DNA methylase  24.09 
 
 		 710 aa  72.4  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.798778  normal  0.467887 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1170  restriction modification system DNA specificity subunit  27.15 
 
 		 402 aa  72  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.249165  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1454  N-6 DNA methylase  23.65 
 
 		 553 aa  72  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.330488  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0439  Type I restriction-modification system M subunit  23.61 
 
 		 534 aa  71.6  0.00000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00153392  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  21.5 
 
 		 481 aa  71.6  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2086  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.01 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000683293 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  23.44 
 
 		 500 aa  71.6  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3089  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.49 
 
 		 520 aa  71.6  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  22.68 
 
 		 489 aa  71.6  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0921  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 676 aa  71.2  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  22.99 
 
 		 477 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7556  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  21.43 
 
 		 544 aa  71.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0823  N-6 DNA methylase  21.66 
 
 		 493 aa  71.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2027  N-6 DNA methylase  24 
 
 		 513 aa  71.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000128967 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  23.08 
 
 		 494 aa  71.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  23.96 
 
 		 834 aa  71.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0324  N-6 DNA methylase  25 
 
 		 657 aa  70.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00528654  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0842  type I restriction-modification enzyme, S subunit, putative  26.74 
 
 		 476 aa  70.5  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4241  N-6 DNA methylase  21.4 
 
 		 570 aa  70.1  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20400  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  23.21 
 
 		 654 aa  70.1  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0518055 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3247  N-6 DNA methylase  22.44 
 
 		 748 aa  70.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  23.16 
 
 		 587 aa  70.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  21.85 
 
 		 505 aa  70.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0508  restriction modification system DNA specificity subunit  27.39 
 
 		 511 aa  69.7  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0821  type I restriction-modification system, M subunit  24.82 
 
 		 515 aa  68.6  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  23.58 
 
 		 495 aa  68.6  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0844  type I restriction enzyme EcoKI M protein  24.05 
 
 		 484 aa  68.2  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14895e-23 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1133  N-6 DNA methylase  23.08 
 
 		 490 aa  68.2  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.813419  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2672  N-6 DNA methylase  23.55 
 
 		 814 aa  68.6  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.29252  normal  0.213379 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0188  N-6 DNA methylase  26.51 
 
 		 775 aa  67.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.113729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3056  type I restriction-modification system, M subunit  23.44 
 
 		 515 aa  68.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.994596  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>