201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2397 on replicon NC_011061
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011061  Paes_2397  restriction modification system DNA specificity domain  100 
 
 		 417 aa  862    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2621  restriction modification system DNA specificity domain protein  68.56 
 
 		 400 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0132  restriction modification system DNA specificity subunit  37.14 
 
 		 427 aa  240  2.9999999999999997e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47299 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0988  type I restriction-modification system, S subunit  48.8 
 
 		 401 aa  237  3e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0446  restriction modification system DNA specificity subunit  36.36 
 
 		 434 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000807768  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2724  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.14 
 
 		 409 aa  202  7e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0745  restriction modification system DNA specificity domain  34.1 
 
 		 411 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.189202  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2009  restriction modification system DNA specificity domain  34.26 
 
 		 423 aa  176  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.999718  normal  0.91224 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1216  restriction modification system DNA specificity subunit  30.75 
 
 		 427 aa  169  8e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2378  type I restriction-modification system, S subunit  36.36 
 
 		 383 aa  163  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2722  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.23 
 
 		 385 aa  162  9e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3717  restriction modification system DNA specificity subunit  30.21 
 
 		 427 aa  159  7e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3549  restriction modification system DNA specificity subunit  37.19 
 
 		 296 aa  155  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1087  restriction modification system DNA specificity subunit  30.82 
 
 		 437 aa  153  5e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0762586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1160  restriction modification system DNA specificity subunit  29.79 
 
 		 407 aa  152  7e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0448  restriction modification system DNA specificity domain  30.27 
 
 		 435 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000159098 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4042  restriction modification system DNA specificity subunit  27.21 
 
 		 428 aa  130  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1960  restriction endonuclease S subunit  26.96 
 
 		 413 aa  129  7.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.323459  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0556  type I restriction enzyme, specificity subunit  40.98 
 
 		 183 aa  127  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0239636  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19070  hypothetical protein  28.22 
 
 		 425 aa  126  6e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0871344 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2939  type I restriction-modification system  31.86 
 
 		 432 aa  123  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0304782 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3540  restriction modification system DNA specificity subunit  26.2 
 
 		 387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0750  putative type I restriction-modification system  33.33 
 
 		 436 aa  116  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.769779  normal  0.272821 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0455  restriction modification system DNA specificity subunit  30.32 
 
 		 403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0467  restriction modification system DNA specificity subunit  30.32 
 
 		 403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.54 
 
 		 422 aa  113  7.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3953  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.15 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2673  restriction modification system DNA specificity subunit  24.65 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.574489 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  35.05 
 
 		 456 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4163  restriction modification system DNA specificity subunit  30.39 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.864984  normal  0.0584456 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3550  restriction modification system DNA specificity subunit  32.86 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257959  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0508  restriction modification system DNA specificity subunit  34.16 
 
 		 511 aa  104  3e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.78 
 
 		 477 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2097  restriction modification system DNA specificity subunit  25 
 
 		 393 aa  103  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  32.99 
 
 		 426 aa  103  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0829  type I restriction-modification system, S subunit  32.99 
 
 		 409 aa  102  9e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232689  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0842  type I restriction-modification enzyme, S subunit, putative  24.83 
 
 		 476 aa  99  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  29.17 
 
 		 429 aa  94.4  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  33.8 
 
 		 425 aa  93.6  6e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0554  hypothetical protein  39.39 
 
 		 133 aa  93.6  6e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0203297  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3673  restriction modification system DNA specificity subunit  23.98 
 
 		 410 aa  93.2  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  35.05 
 
 		 429 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20210  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.59 
 
 		 565 aa  91.3  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.266778  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1502  restriction modification system DNA specificity domain  30.43 
 
 		 393 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22810  hypothetical protein  41.82 
 
 		 418 aa  90.1  7e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.2219 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1170  restriction modification system DNA specificity subunit  26.34 
 
 		 402 aa  89.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.249165  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1914  restriction modification system DNA specificity domain  26.43 
 
 		 386 aa  87.8  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381757 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2682  putative restriction endonuclease S subunit  26.01 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.845062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0871  restriction modification system DNA specificity subunit  28.02 
 
 		 211 aa  85.5  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01116  hypothetical protein  24.18 
 
 		 400 aa  83.2  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  31.89 
 
 		 438 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.7 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0750  restriction endonuclease S subunit  22.88 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4462  restriction modification system DNA specificity subunit  22.54 
 
 		 349 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2423  restriction modification system DNA specificity subunit  28.22 
 
 		 426 aa  79  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.57431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1859  restriction modification system DNA specificity subunit  28 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.777891  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1894  restriction modification system DNA specificity subunit  28 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.850685  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0864  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.44 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3537  putative type I restriction-modification system, S subunit  22.62 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2346  restriction modification system DNA specificity subunit  23.22 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104931  normal  0.0105772 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0016  restriction modification system DNA specificity subunit  28.42 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0597513  hitchhiker  0.0012471 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2452  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  30.82 
 
 		 419 aa  76.3  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.587532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5244  restriction modification system DNA specificity domain  24.72 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0149  restriction modification system DNA specificity subunit  28.64 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1095  restriction modification system DNA specificity subunit  23.84 
 
 		 450 aa  74.3  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3951  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.11 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1307  restriction modification system DNA specificity subunit  28.64 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0599  type I restriction-modification system, S subunit  30 
 
 		 458 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003235  type I restriction-modification system specificity subunit S  29.32 
 
 		 437 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3089  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.21 
 
 		 520 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.497517  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03180  hypothetical protein  32.87 
 
 		 159 aa  71.6  0.00000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000950219 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3525  restriction modification system DNA specificity subunit  26.74 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03130  hypothetical protein  25.63 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0551237  hitchhiker  0.00000000000000986658 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4083  restriction modification system DNA specificity subunit  25.62 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1060  restriction modification system DNA specificity subunit  23.79 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.588803  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0841  type I restriction-modification system, S subunit  27.39 
 
 		 407 aa  70.1  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1176  restriction modification system DNA specificity subunit  27.27 
 
 		 408 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.882603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1027  restriction modification system DNA specificity subunit  30.43 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0789  type I restriction-modification system, S subunit  27.39 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190219  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0637  restriction modification system DNA specificity domain  31.08 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  28.48 
 
 		 834 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.57 
 
 		 462 aa  69.3  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0959  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.41 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  25.78 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2978  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.95 
 
 		 194 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3132  restriction modification system DNA specificity domain protein  28.57 
 
 		 424 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.474681 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  24.46 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1195  type II restriction-modification enzyme  26.02 
 
 		 1343 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2200  type I restriction-modification system specificity subunit  23.37 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.844306  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0944  restriction modification system DNA specificity subunit  25.18 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000962716  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0842  hypothetical protein  24.84 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.229597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1671  restriction modification system DNA specificity subunit  27.51 
 
 		 442 aa  67  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.517259  hitchhiker  0.00037426 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0615  restriction modification system DNA specificity subunit  25.76 
 
 		 417 aa  67  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0545068  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1954  restriction modification system DNA specificity subunit  24.06 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3075  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.26 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.40504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0504  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.37 
 
 		 408 aa  66.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  24.74 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0160  restriction modification system DNA specificity subunit  27.89 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4394  restriction modification system DNA specificity subunit  27.69 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.536192  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17660  restriction endonuclease S subunit  28.19 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>