105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3717 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3717  restriction modification system DNA specificity subunit  100 
 
 		 427 aa  889    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2009  restriction modification system DNA specificity domain  68.37 
 
 		 423 aa  285  8e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.999718  normal  0.91224 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2378  type I restriction-modification system, S subunit  68.37 
 
 		 383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0745  restriction modification system DNA specificity domain  32.7 
 
 		 411 aa  178  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.189202  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0132  restriction modification system DNA specificity subunit  31.4 
 
 		 427 aa  175  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47299 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0446  restriction modification system DNA specificity subunit  33.18 
 
 		 434 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000807768  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1216  restriction modification system DNA specificity subunit  32.96 
 
 		 427 aa  163  6e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2397  restriction modification system DNA specificity domain  30.21 
 
 		 417 aa  159  7e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3549  restriction modification system DNA specificity subunit  39.01 
 
 		 296 aa  158  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0822  restriction modification system DNA specificity subunit  40.67 
 
 		 577 aa  150  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0448  restriction modification system DNA specificity domain  32.49 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000159098 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1087  restriction modification system DNA specificity subunit  30.23 
 
 		 437 aa  140  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0762586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2621  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.23 
 
 		 400 aa  126  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2862  restriction modification system DNA specificity subunit  35.15 
 
 		 589 aa  106  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1914  restriction modification system DNA specificity domain  31.58 
 
 		 386 aa  106  8e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381757 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3144  restriction modification system DNA specificity domain protein  36.04 
 
 		 412 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05614  type I restriction-modification system S subunit  34.67 
 
 		 432 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1492  restriction modification system DNA specificity subunit  25.92 
 
 		 479 aa  100  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4462  restriction modification system DNA specificity subunit  24.32 
 
 		 349 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1960  restriction endonuclease S subunit  25.64 
 
 		 413 aa  98.2  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.323459  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2722  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.05 
 
 		 385 aa  98.6  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4083  restriction modification system DNA specificity subunit  25.14 
 
 		 409 aa  97.1  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  28.08 
 
 		 439 aa  91.3  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2724  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.56 
 
 		 409 aa  90.1  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3673  restriction modification system DNA specificity subunit  27.72 
 
 		 410 aa  87.4  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4163  restriction modification system DNA specificity subunit  27.54 
 
 		 405 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.864984  normal  0.0584456 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0249  restriction modification system DNA specificity subunit  24.39 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0944  restriction modification system DNA specificity subunit  27.08 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000962716  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01116  hypothetical protein  26.69 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3951  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.76 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0750  restriction endonuclease S subunit  23.04 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3537  putative type I restriction-modification system, S subunit  25.72 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  24.45 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4714  restriction modification system DNA specificity domain  23.81 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.232226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3075  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.03 
 
 		 388 aa  69.7  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.40504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0160  restriction modification system DNA specificity subunit  29.82 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3953  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.65 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4611  restriction modification system DNA specificity subunit  27.53 
 
 		 561 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.483614  hitchhiker  0.0000795371 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1842  restriction modification system DNA specificity subunit  25.52 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0403  restriction modification system DNA specificity subunit  26.38 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  22.68 
 
 		 374 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5244  restriction modification system DNA specificity domain  28.93 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  24.49 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1859  restriction modification system DNA specificity subunit  26.32 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.777891  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1894  restriction modification system DNA specificity subunit  26.32 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.850685  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3649  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.98 
 
 		 464 aa  62  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  24.09 
 
 		 433 aa  62  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  27.93 
 
 		 438 aa  62  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1778  type I restriction-modification system specificity subunit  25.29 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.926504  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0951  restriction modification system DNA specificity subunit  27.12 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000406123 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0988  type I restriction-modification system, S subunit  24.39 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0615  restriction modification system DNA specificity subunit  28.46 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0545068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0429  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.07 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2471  type I restriction-modification system S subunit  26.74 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0091078  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2277  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.97 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  hitchhiker  0.00000677276 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  25.51 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0549  restriction modification system DNA specificity subunit  26.46 
 
 		 385 aa  57  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  25.44 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3550  restriction modification system DNA specificity subunit  24.81 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257959  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2598  type I restriction-modification enzyme, S subunit  27.88 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0133376  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0605  restriction modification system DNA specificity subunit  23.86 
 
 		 453 aa  55.5  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0368  type I restriction-modification system, S subunit, putative  25.29 
 
 		 562 aa  54.3  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  24.82 
 
 		 425 aa  54.3  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4012  restriction modification system DNA specificity subunit  23.14 
 
 		 436 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.848484  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0102  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.18 
 
 		 442 aa  53.1  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3757  restriction modification system S subunit  28 
 
 		 436 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.386531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2852  restriction endonuclease S subunits-like protein  21.97 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3940  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.44 
 
 		 453 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4622  Restriction endonuclease S subunits-like protein  21.82 
 
 		 411 aa  53.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.156513 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1890  type I restriction-modification system, S subunit  25.65 
 
 		 416 aa  52.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  27.61 
 
 		 435 aa  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.534213  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3272  type I restriction-modification system specificity subunit  24.88 
 
 		 492 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425878  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1158  restriction modification system DNA specificity subunit  22.38 
 
 		 454 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000117149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4042  restriction modification system DNA specificity subunit  22.42 
 
 		 428 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0854  restriction modification system DNA specificity subunit  23.56 
 
 		 595 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221182  normal  0.0643125 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  27.65 
 
 		 425 aa  50.8  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1032  restriction modification system DNA specificity subunit  22.99 
 
 		 457 aa  50.4  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41908  normal  0.322454 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2285  hypothetical protein  23.33 
 
 		 425 aa  50.1  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0313194  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2673  restriction modification system DNA specificity subunit  22.41 
 
 		 415 aa  50.1  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.574489 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0864  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.31 
 
 		 413 aa  50.1  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1015  hypothetical protein  23.13 
 
 		 477 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4260  hypothetical protein  25.14 
 
 		 287 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0223  putative HsdS protein  20.12 
 
 		 438 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2792  restriction modification system DNA specificity domain protein  20.25 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3129  restriction modification system DNA specificity subunit  25.49 
 
 		 416 aa  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.343622  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3352  type I site-specific deoxyribonuclease S subunit  25.38 
 
 		 303 aa  47.8  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000513186  normal  0.0100815 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4007  restriction endonuclease S subunits-like  23.98 
 
 		 412 aa  47.4  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2415  restriction modification system DNA specificity domain  25.49 
 
 		 418 aa  47.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.589349  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2791  type I restriction-modification system, S subunit  25.49 
 
 		 418 aa  47.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0287  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.22 
 
 		 429 aa  47  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2194  restriction modification system DNA specificity subunit  25.38 
 
 		 427 aa  47  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.122675  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0455  restriction modification system DNA specificity subunit  23.76 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0467  restriction modification system DNA specificity subunit  23.76 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1414  restriction modification system DNA specificity domain  24.46 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00014984  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3180  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.29 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  27.52 
 
 		 611 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184495 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0006  type I restriction-modification system, S subunit, EcoA family  28.12 
 
 		 435 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1635  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.14 
 
 		 419 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0235263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1808  restriction modification system DNA specificity subunit  22.89 
 
 		 483 aa  44.3  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.300643  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2909  restriction modification system DNA specificity subunit  27.07 
 
 		 440 aa  43.9  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>