42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_4260 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_4260  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  588  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4455  restriction modification system DNA specificity subunit  31.19 
 
 		 388 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.353509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3550  restriction modification system DNA specificity subunit  30.67 
 
 		 417 aa  97.8  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257959  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0786  N-6 DNA methylase  34.51 
 
 		 710 aa  85.5  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.798778  normal  0.467887 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0615  restriction modification system DNA specificity subunit  31.22 
 
 		 417 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0545068  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2673  restriction modification system DNA specificity subunit  34.78 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.574489 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0160  restriction modification system DNA specificity subunit  28.88 
 
 		 399 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0944  restriction modification system DNA specificity subunit  33.54 
 
 		 420 aa  72.8  0.000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000962716  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1671  restriction modification system DNA specificity subunit  25.41 
 
 		 442 aa  72  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.517259  hitchhiker  0.00037426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2852  restriction endonuclease S subunits-like protein  30.43 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1778  type I restriction-modification system specificity subunit  35.34 
 
 		 419 aa  69.7  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.926504  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0988  type I restriction-modification system, S subunit  28.32 
 
 		 401 aa  62.4  0.000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4622  Restriction endonuclease S subunits-like protein  30.63 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.156513 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2598  type I restriction-modification enzyme, S subunit  23.72 
 
 		 417 aa  59.7  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0133376  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  38.95 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2548  restriction modification system DNA specificity domain  25.37 
 
 		 405 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5244  restriction modification system DNA specificity domain  34.48 
 
 		 422 aa  55.8  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04061  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  26.14 
 
 		 703 aa  55.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  25.1 
 
 		 425 aa  55.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0446  restriction modification system DNA specificity subunit  32.17 
 
 		 434 aa  54.7  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000807768  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0368  type I restriction-modification system, S subunit, putative  43.08 
 
 		 562 aa  53.9  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0249  restriction modification system DNA specificity subunit  28.91 
 
 		 393 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0429  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.25 
 
 		 404 aa  52.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0403  restriction modification system DNA specificity subunit  38.18 
 
 		 402 aa  51.2  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0268  restriction endonuclease S subunits  22.73 
 
 		 444 aa  49.7  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.277222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3717  restriction modification system DNA specificity subunit  25.14 
 
 		 427 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  28.57 
 
 		 456 aa  48.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3537  putative type I restriction-modification system, S subunit  28.07 
 
 		 419 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06809  type I restriction enzyme S subunit  54.35 
 
 		 90 aa  47  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2722  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.63 
 
 		 385 aa  45.8  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2926  restriction modification system DNA specificity subunit  33.64 
 
 		 434 aa  45.8  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2009  restriction modification system DNA specificity domain  22.18 
 
 		 423 aa  45.8  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.999718  normal  0.91224 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0334  restriction modification system DNA specificity domain  31.03 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.284396 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.54 
 
 		 422 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  24.35 
 
 		 429 aa  44.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2724  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.4 
 
 		 409 aa  44.3  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  31.67 
 
 		 374 aa  43.9  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.78 
 
 		 457 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3075  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.67 
 
 		 388 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.40504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1091  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.28 
 
 		 444 aa  43.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2792  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.94 
 
 		 423 aa  42.4  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2378  type I restriction-modification system, S subunit  22.92 
 
 		 383 aa  42.4  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>