197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2391 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  100 
 
 
374 aa  766    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  38.22 
 
 
425 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  33.6 
 
 
439 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0615  restriction modification system DNA specificity subunit  39.71 
 
 
417 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0545068  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  40 
 
 
425 aa  166  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0988  type I restriction-modification system, S subunit  51.75 
 
 
401 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0455  restriction modification system DNA specificity subunit  51.43 
 
 
403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0467  restriction modification system DNA specificity subunit  51.43 
 
 
403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2792  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.62 
 
 
423 aa  136  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313089  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  26.88 
 
 
425 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.78 
 
 
422 aa  130  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  35.25 
 
 
429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2724  restriction modification system DNA specificity domain protein  41.43 
 
 
409 aa  122  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0951  restriction modification system DNA specificity subunit  28.37 
 
 
419 aa  122  8e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000406123 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0006  type I restriction-modification system, S subunit, EcoA family  31.83 
 
 
435 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  29.24 
 
 
429 aa  117  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3132  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.38 
 
 
424 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.474681 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0448  restriction modification system DNA specificity domain  28.34 
 
 
435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000159098 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2257  restriction endonuclease S subunits-like protein  27.52 
 
 
413 aa  110  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2598  type I restriction-modification enzyme, S subunit  30.43 
 
 
417 aa  109  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0133376  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  26.61 
 
 
435 aa  105  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1216  restriction modification system DNA specificity subunit  26.16 
 
 
427 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1842  restriction modification system DNA specificity subunit  25.35 
 
 
391 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2277  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.92 
 
 
433 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.200455  hitchhiker  0.00000677276 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3673  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.32 
 
 
459 aa  101  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372341  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0500  restriction modification system DNA specificity subunit  26.35 
 
 
413 aa  100  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.565018  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1778  type I restriction-modification system specificity subunit  30.57 
 
 
419 aa  99  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.926504  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1087  restriction modification system DNA specificity subunit  26.29 
 
 
437 aa  98.2  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0762586  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2378  type I restriction-modification system, S subunit  26.83 
 
 
383 aa  98.6  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2009  restriction modification system DNA specificity domain  26.83 
 
 
423 aa  98.6  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.999718  normal  0.91224 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3443  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.1 
 
 
445 aa  97.4  4e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  25.15 
 
 
456 aa  96.7  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05614  type I restriction-modification system S subunit  26.93 
 
 
432 aa  95.9  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  27.83 
 
 
433 aa  96.3  9e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1671  restriction modification system DNA specificity subunit  26.05 
 
 
442 aa  95.5  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.517259  hitchhiker  0.00037426 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1158  restriction modification system DNA specificity subunit  30.52 
 
 
454 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000117149  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5008  Restriction endonuclease S subunits-like protein  23.45 
 
 
465 aa  94  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.441656 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  26.73 
 
 
426 aa  91.3  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4042  restriction modification system DNA specificity subunit  25.8 
 
 
428 aa  89.4  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1805  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.93 
 
 
423 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.745604  normal  0.535567 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0334  restriction modification system DNA specificity domain  29.52 
 
 
430 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.284396 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.51 
 
 
457 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0745  restriction modification system DNA specificity domain  25.27 
 
 
411 aa  86.3  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.189202  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0944  restriction modification system DNA specificity subunit  27.24 
 
 
420 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000962716  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0102  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.11 
 
 
442 aa  84  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2346  restriction modification system DNA specificity subunit  34.06 
 
 
392 aa  84  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104931  normal  0.0105772 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2665  type I restriction-modification system specificity subunit  24.56 
 
 
446 aa  83.6  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0650221  normal  0.332066 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3550  restriction modification system DNA specificity subunit  29.5 
 
 
417 aa  83.2  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257959  normal  0.256697 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0564  restriction modification system DNA specificity subunit  26.43 
 
 
415 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00017151  decreased coverage  6.20122e-17 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4012  restriction modification system DNA specificity subunit  23.04 
 
 
436 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.848484  normal  0.567977 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1091  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.6 
 
 
444 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17387  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1960  restriction endonuclease S subunit  22.78 
 
 
413 aa  80.1  0.00000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.323459  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2028  restriction modification system DNA specificity subunit  30 
 
 
391 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000400239 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  26.3 
 
 
422 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  23.75 
 
 
438 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0864  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.25 
 
 
413 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3075  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.83 
 
 
388 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.40504  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2976  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.71 
 
 
238 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1860  type I restriction enzyme, S subunit  23.56 
 
 
474 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0504746  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2939  type I restriction-modification system  22.97 
 
 
432 aa  74.7  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0304782 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0841  type I restriction-modification system, S subunit  23.61 
 
 
407 aa  73.9  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3989  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.7 
 
 
456 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0737122 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0789  type I restriction-modification system, S subunit  23.61 
 
 
407 aa  73.9  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190219  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0829  type I restriction-modification system, S subunit  26.6 
 
 
409 aa  73.9  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232689  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2926  restriction modification system DNA specificity subunit  26.97 
 
 
434 aa  72.8  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2689  restriction modification system DNA specificity subunit  27.04 
 
 
290 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.841682  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0098  restriction endonuclease S subunits  28.47 
 
 
315 aa  72  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0750  putative type I restriction-modification system  24.35 
 
 
436 aa  72  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.769779  normal  0.272821 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1204  restriction modification system DNA specificity subunit  23.92 
 
 
547 aa  70.9  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340549  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0640  restriction modification system DNA specificity subunit  24.65 
 
 
447 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0842  type I restriction-modification enzyme, S subunit, putative  21.9 
 
 
476 aa  70.1  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  23.31 
 
 
456 aa  69.7  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3549  restriction modification system DNA specificity subunit  24.83 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348533  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1195  type II restriction-modification enzyme  28.21 
 
 
1343 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0076  type I restriction-modification system subunit S  21.63 
 
 
464 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1015  hypothetical protein  24.87 
 
 
477 aa  67.8  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0796  restriction modification system DNA specificity domain  21.85 
 
 
441 aa  67.8  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343889 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0605  restriction modification system DNA specificity subunit  29.84 
 
 
453 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4761  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  22.32 
 
 
428 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0277  hypothetical protein  22.09 
 
 
474 aa  67.4  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0658  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.83 
 
 
473 aa  67.4  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2328  type I restriction-modification system specificity subunit  22.22 
 
 
404 aa  67.4  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03150  hypothetical protein  31.75 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.223184  hitchhiker  0.0000000000000424002 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2621  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.22 
 
 
400 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0023  type I restriction-modification system specificity subunit  25.65 
 
 
411 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0031  type I restriction-modification system specificity subunit  25.65 
 
 
411 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.404176  normal  0.032892 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003235  type I restriction-modification system specificity subunit S  23.04 
 
 
437 aa  65.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3717  restriction modification system DNA specificity subunit  22.68 
 
 
427 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2226  restriction modification system DNA specificity subunit  24.41 
 
 
451 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.890862  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3940  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.56 
 
 
453 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1220  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.77 
 
 
620 aa  63.9  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1307  restriction modification system DNA specificity subunit  25.95 
 
 
285 aa  63.5  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.186237 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4917  restriction modification system DNA specificity subunit  26.26 
 
 
412 aa  63.9  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.544675 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13680  hypothetical protein  25.23 
 
 
354 aa  63.5  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.247083  normal  0.424884 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0132  restriction modification system DNA specificity subunit  25.9 
 
 
427 aa  63.5  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.47299 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1536  hypothetical protein  25.09 
 
 
380 aa  63.2  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00344436  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3109  restriction modification system DNA specificity subunit  24.07 
 
 
426 aa  63.2  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3129  restriction modification system DNA specificity subunit  23.64 
 
 
416 aa  62.8  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.343622  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2607  restriction modification system DNA specificity subunit  25.07 
 
 
462 aa  62.4  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0844  restriction endonuclease S subunits-like protein  23.99 
 
 
386 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>