92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1842 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1842  restriction modification system DNA specificity subunit  100 
 
 		 391 aa  797    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1087  restriction modification system DNA specificity subunit  30.88 
 
 		 437 aa  155  9e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0762586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5244  restriction modification system DNA specificity domain  30.98 
 
 		 422 aa  154  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0467  restriction modification system DNA specificity subunit  32.35 
 
 		 403 aa  153  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0455  restriction modification system DNA specificity subunit  32.35 
 
 		 403 aa  153  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2346  restriction modification system DNA specificity subunit  37.37 
 
 		 392 aa  132  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104931  normal  0.0105772 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1411  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  31.22 
 
 		 382 aa  127  3e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.202691  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0988  type I restriction-modification system, S subunit  27.67 
 
 		 401 aa  119  9e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.271922  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1894  restriction modification system DNA specificity subunit  30.47 
 
 		 409 aa  116  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.850685  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1859  restriction modification system DNA specificity subunit  30.47 
 
 		 409 aa  116  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.777891  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1960  restriction endonuclease S subunit  25.36 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.323459  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1216  restriction modification system DNA specificity subunit  26.59 
 
 		 427 aa  110  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0448  restriction modification system DNA specificity domain  27.46 
 
 		 435 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000159098 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2471  type I restriction-modification system S subunit  28.64 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.0091078  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2391  restriction modification system DNA specificity subunit  25.35 
 
 		 374 aa  102  9e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164769  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0745  restriction modification system DNA specificity domain  28.05 
 
 		 411 aa  101  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.189202  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2009  restriction modification system DNA specificity domain  25.95 
 
 		 423 aa  99  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.999718  normal  0.91224 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2724  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.27 
 
 		 409 aa  91.3  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2621  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.51 
 
 		 400 aa  90.9  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2378  type I restriction-modification system, S subunit  26.61 
 
 		 383 aa  89  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0132  restriction modification system DNA specificity subunit  25.06 
 
 		 427 aa  81.3  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47299 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  23.53 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3352  type I site-specific deoxyribonuclease S subunit  29.17 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000513186  normal  0.0100815 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0249  restriction modification system DNA specificity subunit  23.14 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3717  restriction modification system DNA specificity subunit  23.47 
 
 		 427 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03130  hypothetical protein  24.64 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0551237  hitchhiker  0.00000000000000986658 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2598  type I restriction-modification enzyme, S subunit  27.42 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0133376  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0041  restriction modification system DNA specificity subunit  29.19 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0006  type I restriction-modification system, S subunit, EcoA family  23.87 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0403  restriction modification system DNA specificity subunit  27.78 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0808  specificity determinant HsdS-like  25.3 
 
 		 363 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.361917  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2397  restriction modification system DNA specificity domain  28.02 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000238697  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2194  restriction modification system DNA specificity subunit  26.25 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.122675  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0160  restriction modification system DNA specificity subunit  25.56 
 
 		 399 aa  63.5  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1671  restriction modification system DNA specificity subunit  22.66 
 
 		 442 aa  63.2  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.517259  hitchhiker  0.00037426 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3549  restriction modification system DNA specificity subunit  29.37 
 
 		 296 aa  62.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.348533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3351  type I site-specific deoxyribonuclease S subunit  30.16 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00146581  normal  0.0102246 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.16 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0334  restriction modification system DNA specificity domain  26.56 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.284396 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0507  restriction modification system DNA specificity subunit  23.78 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0308  restriction modification system DNA specificity domain  25.12 
 
 		 456 aa  61.6  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0548885  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0944  restriction modification system DNA specificity subunit  24.47 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000962716  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2792  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.49 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3120  hypothetical protein  24.14 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.239583  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1890  type I restriction-modification system, S subunit  21.27 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0615  restriction modification system DNA specificity subunit  26.01 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0545068  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1710  restriction modification system DNA specificity subunit  25.68 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.37 
 
 		 422 aa  57  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  24.54 
 
 		 425 aa  56.6  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03150  hypothetical protein  24.73 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.223184  hitchhiker  0.0000000000000424002 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1914  restriction modification system DNA specificity domain  24.03 
 
 		 386 aa  55.8  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381757 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4083  restriction modification system DNA specificity subunit  20.92 
 
 		 409 aa  55.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  28.26 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000269296  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0951  restriction modification system DNA specificity subunit  24.24 
 
 		 419 aa  55.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000406123 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3075  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.64 
 
 		 388 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.40504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2910  putative type I restriction-modification system, S subunit  26.86 
 
 		 373 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  23.44 
 
 		 439 aa  54.3  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0842  hypothetical protein  22.08 
 
 		 446 aa  53.9  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.229597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0556  type I restriction enzyme, specificity subunit  28.88 
 
 		 183 aa  53.9  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0239636  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0446  restriction modification system DNA specificity subunit  25.85 
 
 		 434 aa  53.5  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000807768  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0750  restriction endonuclease S subunit  26.01 
 
 		 387 aa  53.9  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0864  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.37 
 
 		 413 aa  53.1  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0689213  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0277  restriction modification system DNA specificity subunit  21.16 
 
 		 413 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1218  restriction modification system DNA specificity subunit  25.43 
 
 		 351 aa  51.2  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.67755  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4163  restriction modification system DNA specificity subunit  24.56 
 
 		 405 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.864984  normal  0.0584456 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0829  type I restriction-modification system, S subunit  26.49 
 
 		 409 aa  51.2  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.232689  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2548  restriction modification system DNA specificity domain  20.27 
 
 		 405 aa  50.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0967  restriction modification system DNA specificity domain  26.49 
 
 		 426 aa  50.8  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.800586  normal  0.821104 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1492  restriction modification system DNA specificity subunit  34.74 
 
 		 479 aa  49.7  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2415  restriction modification system DNA specificity domain  26.67 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.589349  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2791  type I restriction-modification system, S subunit  26.67 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  28.68 
 
 		 429 aa  48.5  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0387  restriction modification system DNA specificity domain  32.79 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0681662  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2722  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.44 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1158  restriction modification system DNA specificity subunit  23.45 
 
 		 454 aa  48.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000117149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2176  restriction modification system DNA specificity subunit  20.39 
 
 		 444 aa  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.962317  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1672  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.05 
 
 		 493 aa  47.4  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2743  type I restriction-modification system, S subunit, truncation  26.99 
 
 		 175 aa  47.4  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.441032  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1897  restriction modification system DNA specificity subunit  25 
 
 		 433 aa  47.8  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1435  restriction modification system DNA specificity subunit  24.42 
 
 		 340 aa  47.4  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1778  type I restriction-modification system specificity subunit  22.73 
 
 		 419 aa  47.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.926504  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3951  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.86 
 
 		 406 aa  46.6  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0040  restriction-modification enzyme subunit s3a  31.14 
 
 		 372 aa  45.8  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.0522579  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0368  type I restriction-modification system, S subunit, putative  44 
 
 		 562 aa  45.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1911  hypothetical protein  21.89 
 
 		 453 aa  44.7  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.568524  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0789  type I restriction-modification system, S subunit  22.66 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190219  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0841  type I restriction-modification system, S subunit  22.66 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.629279  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0607  restriction modification system DNA specificity subunit  25.25 
 
 		 438 aa  44.3  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0102  restriction modification system DNA specificity domain protein  32.98 
 
 		 442 aa  44.3  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1091  restriction modification system DNA specificity domain protein  19.95 
 
 		 444 aa  44.3  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17387  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0198  restriction modification system DNA specificity domain protein  20.26 
 
 		 386 aa  43.5  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.719886  decreased coverage  0.000218103 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4042  restriction modification system DNA specificity subunit  22.07 
 
 		 428 aa  43.1  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>